微生物因为体积小、质量轻、适应性强、繁殖能力强等特点，普遍分布于自然界中。它们存在于食品、化妆品、饲料、环境等人们能触及的各个角落中。某些微生物对产品的污染，不仅影响到产品本身的质量，更严重的是它危及消费者的健康和安全。微生物检测的检测项目：菌落总数、霉菌和酵母计数、大肠杆菌、沙门氏菌、志贺氏菌、大肠埃希氏菌、副溶血性弧菌、金黄色葡萄球菌、溶血性链球菌、产气荚膜梭菌、蜡样芽孢杆菌、单增李斯特氏菌、双歧杆菌、乳酸菌、罐头商业无菌、阪崎肠杆菌、粪链球菌等。高通量测序技术可以提供一条新的病原微生物鉴定途径。随机PCR未知病原鉴定诊断
近年来药品不安全事故不断发生，并呈上升趋势。在药品质量事故的高发期，强化药品微生物鉴定工作显得尤为重要，尤其是无菌药品。在无菌药品的生产中，对原料、辅料、包装材料、生产场所、生产过程的微生物控制是保证药品质量的基础，所以利用微生物鉴定技术快速、准确地获得鉴定结果，对当前无菌药品微生物鉴定工作来说非常重要。PCR技术能够鉴定出药品中含有诊疗大肠杆菌、金黄色葡萄球菌以及李斯特杆菌多种成分，相关**学者在还没有经过富集化培养就采用免疫磁珠并结合PCR技术，准确并快速对药品进行检测，确定了药品中含有李斯特菌和大肠埃希氏菌成分;还有有关**采用实时荧光定量PCR技术检测实验菌株，确定药品中多数菌株呈阴性，而有少量溶血弧菌呈阳性。杭州微生物检测诊断常用的病毒检测方法有3种，植物直接测定法、指示植物测定法、血清学方法。
临床微生物鉴定必须经历的过程：1.分离培养：临床细菌学不可缺少的基本技术，是获得纯培养物的必要手段，即使自动化仪器先进的现在也只能对纯菌作出鉴定。2.细菌的菌落、色素、溶血性、气味是鉴定的重要特征。3.形态学鉴定：如奴卡菌、红球菌。4.动力在各种细菌鉴定：针对形态不易区分时来鉴别菌种。5.氧化酶，触酶试验是分别革兰阴性菌和革兰阳性菌鉴定试验。传统的鉴定方法通过选实验项目，同一科内的不同属、种可以选择不同的鉴定指标。
微生物鉴定可以用微生物对噬菌体的敏感性作为指标来鉴定微生物的种属。因为各种噬菌体都有其严格的宿主范围，不同的细菌作为噬菌体的宿主对应有特定的已知特性的噬菌体，其和噬菌体的作用方式也有接合，转化，转接，溶原性转换和原生质体融合等多种方式。部分细菌可以采用血清学反应的方法来进行区分和鉴别，就比如说常见的疑似伤寒沙门菌的菌种鉴别，我们可以利用血清学反应，现有的已知的对应的血清学反应抗体，蘸取菌种液在抗体液中涂抹，看是否会出现血凝现象（即是否出现淡白色的凝集颗粒）。生化方法检测病原微生物实际上是测定微生物特异性酶。
未知病原微生物样本需要经历：核酸纯化-文库构建-生物信息学分析这三大基本流程才能完成鉴定。高通量测序技术之解决疑难鉴定问题并提高检测的灵敏度，在病原微生物检测与鉴定方面，对一些非典型症状的样品，依靠先验知识与传统检测方法无法有效对病原微生物进行检测时，高通量测序技术通过对基因组进行全序列测序，可有效检测出在某种材料中可能携带的之前未报道过的病原微生物,或鉴定出混合侵染样品中的不同病原分离物，降低有害生物传入的风险。相对传统的生物学、血清学与分子生物学检测技术，高通量测序技术具有更高的特异性和灵敏性，即使在样品中病原微生物存在量较低的情况下依然能够做出快速、准确的检测，尤其适用于病原微生物侵染初期的样品材料的检测。随着医学微生物学研究技术的不断发展，病原学诊断已不再局限于病原体水平。随机PCR病原检测方法
微生物鉴定系统的工作原理因不同的仪器和系统而异。随机PCR未知病原鉴定诊断
有些微生物是有益的，也有些微生物的存在可引起多种应变性疾病和传染性疾病，会对人身体健康产生不良的影响;还会使食品及原料腐烂和变质。所以，微生物检测必须严格把关。微生物检测的必要性：1、食品：食品因含有微生物可依赖生长的营养成分，因此食品会受到微生物不同程度的污染。食品质量安全关系到人民**的身体健康，生命安全及社会经济。为了食品的安全，人们的健康，微生物检测极其必要。2、医院：医院都和微生物有着极为密切的关系。加强医院的微生物检验与监测，对于预防和控制医院起着十分重要的作用。3、空气：室内空气是微生物污染的重要传播途径。室内舒适的温度，湿度等环境条件以及相对密闭的室内更为各种有害微生物滋生创造了条件。只有有效地检测微生物的含量，才能采取有效地措施，才能保证人体健康不受微生物的危害。随机PCR未知病原鉴定诊断
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