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数字PCR基本参数
  • 产地
  • 中国
  • 品牌
  • 永诺
  • 型号
  • MicroDrop-100
  • 是否定制
数字PCR企业商机

dPCR的基本原理

目前dPCR主要有两种形式,芯片式和液滴式,但基本原理都是将大量稀释后的核酸溶液分散至芯片的微反应器或微滴中,每个反应器的核酸模板数少于或者等于1个。这样经过PCR循环之后,有一个核酸分子模板的反应器就会给出荧光信号,没有模板的反应器就没有荧光信号。根据相对比例和反应器的体积,就可以推算出原始溶液的核酸浓度。 FAM、VIC双通道荧光检测。南通MicroDrop-100数字PCR报价

可以使用几种不同的方法来分配样品,包括微孔板,毛细管,油乳剂和带有核酸结合表面的小型化腔室阵列。样品的分配使人们可以通过假设分子种群遵循泊松分布来估计不同分子的数量,根据泊松分布的原理,反应体系中目标分子的拷贝数可以通过公式A=-ln[(N-X)/N]*N计算,从而解决了多个目标分子存在于单个液滴中的可能性。
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与常规PCR方法相比,数字PCR有如下优势:

  1. 能够***定量:常规PCR定量需要制定已知拷贝数的标准DNA曲线,但是由于待检样本与标准曲线不在统一体系,条件上会存在差异,另外加上PCR扩增效率的差异从而影响定量结果的准确性。而数字PCR不受标准曲线和扩增动力学影响,可进行***定量。

  2. 样本需求量低:适用于珍贵样本或核酸降解严重的样本

  3. 灵敏度高:数字PCR是将传统PCR反应体系分割成数万个**PCR反应,这些反应可以精确地检测很小的目的片段差异、单拷贝甚至低浓度的混杂样本。且能避免非同源异质双链的形成。

  4. 高耐受性:由于目的序列被分配到多个**反应体系中,***降低了背景信号和***物对反应的干扰,扩增基质效应大大减小。 无锡MicroDrop-100数字PCR正规代理能检测低至0.01%的突变基因。

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研究方向

二代测序辅助建库

目前靶向测序建库方法包括扩增子方法,在均相溶液中,当扩增引物增加时,由于扩增引物之间的相互作用,从而影响扩增的效率;如果将其分散到大量微液滴中扩增,将可**降低引物间相互作用,提高扩增效率。同时还可以实现对于少量模板的有效扩增,得到更多的有效测序数据。

CRISPR-Cas9基因编辑结果验证

CRISPR-Cas9技术的发明,是基因编辑技术的一大突破,但如何验证实验是否成功,仍需要高灵敏度的检测方法,数字PCR技术可以满足这一需求。Broad研究所张锋团队发明了以CRISPR为基础的SHERLOCK技术可以对核酸进行高灵敏度的定性检测,但精确定量评估时仍采取了数字PCR进行确认。

要了解为什么传统 PCR 存在限制,务必要了解 PCR 反应过程中发生了什么。基本 PCR 运行可以分为三个阶段:

指数期

每个循环积聚的产物准确加倍(假定 ** 反应效率)。该反应具有高度特异性和精确度。出现指数式扩增,因为所有试剂均新鲜可用,反应的动力学推动反应有利于扩增子加倍。

线性期(高变异性)

随着反应继续,一些试剂因扩增而被消耗。反应开始减缓,并且每个循环的 PCR 产物不再加倍。

平台期(终点:使用传统方法进行凝胶检测)

反应停止,不再产生更多产物,并且如果放置时间够长,PCR 产物将开始降解。因为每个样品具有不同的反应动力学,所以每支试管或每个反应将在不同的时间点进入平台期。在平台期可以看到这些差异。在平台期内,传统 PCR 进行测量,又称为终点检测。 适用复杂样品的检测。

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数字PCR采用的策略概括起来非常简单,就是“分而治之”(divide and conquer)[1],这种做法非常类似于计算机科学中的“分治算法”,将一个标准PCR反应分配到大量微小的反应器中,在每个反应器中包含或不包含一个或多个拷贝的目标分子( DNA模板) ,实现“单分子模板PCR扩增”,扩增结束后,通过阳性反应器的数目“数出”目标序列的拷贝数。在实际的数字PCR实验中,事实上是通过呈现两种信号类型的反应器比例和数目进行统计学分析,计算出原始样本中的模板拷贝数。 
数字PCR仪广泛应用于医疗、农业、环境等领域。南京流式数字PCR解决方案

线性范围达到6个数量级,灵敏度低至万分之一。南通MicroDrop-100数字PCR报价

每种PCR方法对比如下:

数字PCR

实时荧光定量PCR

传统PCR

概述

测量阴性平行样的比例以确定***拷贝数

在发生PCR扩增时进行测量

在PCR循环结束时测量积聚的PCR产物的量

是否定量

是,阴性PCR反应的比例适合泊松统计算法

是,因为在PCR的指数期内采集数据,在此期间PCR产物的数量与核酸模板量成正比

否,但是比较凝胶上的扩增条带的强度与已知浓度的标准品可进行半定量

应用

***载体***定量

核酸标准品***定量

下一代测序文库***定量

稀有等位基因检测

基因表达***定量

混合物富集和分类

基因表达定量

质量控制和检测验证

病原体检测

SNP基因分型

拷贝数变异

microRNA分析

***定量

siRNA/RNAi实验

DNA扩增

基因分型

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浚和(上海)仪器有限公司是一家仪器仪表、电气设备、环保设备、机械设备及配件、化工产品及原料(除危险化学品、监控化学品、民用物品、易制毒化学品)的销售,从事货物及技术的进出口业务,从事电子科技领域内的技术开发、技术咨询、技术服务、技术转让,机械设备的维修。 【依法须经批准的项目,经相关部门批准后方可开展经营活动】的公司,是一家集研发、设计、生产和销售为一体的专业化公司。浚和拥有一支经验丰富、技术创新的专业研发团队,以高度的专注和执着为客户提供真空泵,喷雾干燥机,培养箱,等离子清洗机。浚和继续坚定不移地走高质量发展道路,既要实现基本面稳定增长,又要聚焦关键领域,实现转型再突破。浚和始终关注自身,在风云变化的时代,对自身的建设毫不懈怠,高度的专注与执着使浚和在行业的从容而自信。

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定量PCR和数字PCR的特点:1.在20多年的使用和发展中,定量PCR作为一种技术平台,已经产出海量的数据,在工业界和分子检测的某些应用上,定量PCR已经成为“金标准”。基础研究方面,则形成了被称为MIQE的“定量PCR标准实验指南”。2.在定量PCR的各种应用中,基因表达分析(geneexpressionanalysis)的应用比重约占七成,综合各种因素来看,眼下定量PCR还是进行基因表达研究的理想手段。3.上述的“各种因素”具体展开,主要包括:通量、自动化程度、各种检测探针与染料、检测通道、成本和可参考文献与protocol的数目等等。4.就目前市场上已有的数字PCR设备来看,定量PCR在...

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