不论采用哪一类钙离子指示剂，总体上成像记录过程是非常类似的。包含钙离子指示剂的细胞可以通过荧光显微镜(fluorescence microscope)观测，然后通过CCD摄像机捕捉、记录图像。现在钙成像技术主要在以下几类神经科学研究方面有广泛应用：1.记录培养的神经元的活动。2.记录脑片上神经元的活动。记录神经元的活动。由于离体实验本身的限制，现在越来越多的神经方面科学家倾向于做在体钙成像实验，希望能得到更准确且更能反应生理状况的数据。得益于双光子荧光显微镜的发展，现在在实验动物处于huoti状态下的钙成像技术取得了飞速进展。4.记录神经元树突和树突棘（spine）的活动。由于对于实验精度的要求，有些科学家不仅只想记录单个神经元的反应，他们还想更确切地知道神经元上哪些树突和树突棘参与了某个行为，也就是说他们需要在huoti条件下，对单根树突以及某些spine进行钙成像记录实验。由于双光子荧光显微镜和GCaMP6基因编码钙离子指示剂的发展，现在，对树突和树突棘用钙成像实验进行记录也成为了可能。
钙成像系统具有单细胞分辨率的大视野的特征。上海新型钙成像供应商
目前有三种在神经元上填充钙离子指示剂的方法，且都可以用于体内和体外研究。第一种方法是利用玻璃吸管将膜渗透性盐或葡聚糖形式的指示剂注入单个神经元中。此方法方便实验者控制单个神经元内的钙离子指示剂浓度且信噪比较高。第二种是利用“批量加载”的方法将钙离子指示剂染料负载神经元，观察对象为一群神经元。尽管此方法可能导致一些胶质细胞也被指示剂所标记，但提高了整体神经元的标记百分比，使研究者得以观察到一群神经元内动作电位相关性的活动。第三种也较为常用，通过病毒转染的方式使其基因编码钙离子指示剂。（A）单细胞注射法；（B）network loading法；（C）通过病毒转染使其基因编码钙离子指示剂（expression of genetically encoded calcium indicators, GECI）
北京超微显微钙成像nVoke2.0近年来出现了通过植入性的显微镜或透镜进行活动动物钙成像的技术。
传统的宽场荧光显微镜由于光散射的影响，只能够对大脑浅层的神经元或在离体组织上进行成像，共聚焦显微镜由于光损伤较大，一般也只用于离体钙成像。随着荧光显微镜技术的迅速发展，在体钙成像技术得到了蓬勃发展。双光子荧光显微镜能够在进行在体成像的时候实现高分辨率和高信噪比。例如，用双光子显微镜对海马树突棘的钙离子信号进行成像，研究神经元突触后长时程yizhi；观察小鼠运动皮层神经元在嗅觉选择任务中刺激相关电位等等。不过，这些实验还是需要对动物进行麻醉和固定，而神经科学领域很多研究更希望能够对自由活动的动物进行研究。
nVista神经元超微钙成像系统是可以在自由活动的动物上进行大范围的动态荧光成像的设备。通过nVist，您可以视觉化细胞活动，同步行为学，以及长期追踪神经环路的活动。nVista被应用于全球的研究机构中，产生了影响力的大数据库。主要特征：利用GCamp钙离子探针进行成像·功能完整的数据采集软件，实现对焦，调焦，行为同步化单细胞分辨率下，可同时捕获成百上千神经元活动长时间追踪细胞，追踪时间可长达数月电子对焦，保证视野范围的恒定自由动物行为学：可运用标准行为学测量方法，行为操作箱，迷宫，旷场等可进行皮层，深部核团，以及脑干，中脑等区域的成像记录动物无需进行适应性训练钙离子成像+自由活动行为学1.锚定特殊细胞类型，例如特定的receptor/promotor/geneticmarker2.单细胞的空间分辨率，可以分析细胞在空间内的mapping和编码信息3.动物可在大范围的旷场内自由活动4.长时程追踪同一细胞的放电规律变化：用于学习，记忆，药物成瘾等研究。5.可对脑内的深部核团进行记录nVista神经元超微钙成像系统成像效果好。神经元超微钙成像系统技术参数专业的数据采集软件Inscopix数据采集软件可记录成百上千个神经元细胞。电子调焦功能，可通过软件实现物理调焦。传统钙成像实验要求成像的光路极为稳定。
对于双光子（2P）钙成像而言，离焦和近表面荧光激发是两个*da的深度限制因素，而对于三光子成像这两个问题大大减小，但是三光子成像由于荧光团的吸收截面比2P要小得多，所以需要更高数量级的脉冲能量才能获得与2P激发的相同强度的荧光信号。功能性三光子显微镜比结构性三光子显微镜的要求更高，它需要更快速的扫描，以便及时采样神经元活动；需要更高的脉冲能量，以便在每个像素停留时间内收集足够的信号。复杂的行为通常涉及到大型的大脑神经网络，该网络既具有局部的连接又具有远程的连接。要想将神经元活动与行为联系起来，需要同时监控非常庞大且分布guangfan的神经元的活动，大脑中的神经网络会在几十毫秒内处理传入的刺激，要想了解这种快速的神经元动力学，就需要MPM具备对神经元进行快速成像的能力。快速MPM方法可分为单束扫描技术和多束扫描技术对钙离子的功能研究中，钙指示剂是必不可少的工具。宁波荧光钙成像供应商
长时间追踪相同细胞，进行可重复的科学研究对自由行为动物进行慢性钙成像研究。上海新型钙成像供应商
一项由葡萄牙尚帕莫未知中心，牛津大学，哥伦比亚大学，荷兰鹿特丹伊拉斯谟大学，麻省理工学院，伦敦大学，德国MaxPlanck生物控制论研究所，德国图欧宾根大学多方合作的研究于2020年11月4日在Neuron上发表了题为TheAnteriorCingulateCortexPredictsFutureStatestoMediateModel-BasedActionSelection的文章，作者通过一个新的两步谜题任务了解基于模型的决策使用对行为具体后果的预测，在小鼠的一系列决策任务中使用Inscopix显微钙成像和光遗传学来证明前扣带皮层（ACC）预测了行动将导致的状态，而不仅*是预测它们是好是坏，并判断结果是否与这些预测相符。研究结果表明，ACC是基于模型的控制的关键节点，在预测所选操作的未来状态方面发挥着特定作用。上海新型钙成像供应商
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