这个阶段需要区分开目的蛋白与那些分子量大小及理化性质接近的蛋白，为了使分辨率提高，需要使用更加小的树脂颗粒。离子交换柱和疏水柱经常被使用，树脂的选择性和柱效两个因素在应用的时候需要综合考虑。蛋白质纯化蛋白质的的物理、化学、生物化学、物理化学和生物学性质取决于它的一级、二级、三级和四级结构，不同蛋白质之间的性质存在差异或者改变条件是使之具有差异，利用一种同时多种性质差异，在兼顾收率和纯度的情况下，选择蛋白质提纯的方法。蛋白质通常通常均是由复杂的混合物形式存在于组织或细胞中，有成千种不同的蛋白质存在于每种类型的细胞内。分离和提纯蛋白质非常的艰巨而繁重。直到现在还不能够从复杂的混合物中使用一个单独的或一**成的方法提取出任何一种蛋白质。然而，对于任何一种蛋白质，选择一套适当的分离提纯程序来获取高纯度的制品是非常有可能的。蛋白质提纯的总目标是使制品纯度或比活性得到增加，从细胞的全部其他成分特别是不想要的杂蛋白中以合理的效率、速度、收率和纯度分离出蛋白质，为其对纯化的要求。同时这种多肽的生物学活性和化学完整性依然得以保留。疏水性层析蛋白纯化系统是利用盐-水体系中样品分子的疏水力的不同而进行分离的一种层析方法。宁波蛋白纯化服务电话
蛋白质的分离纯化工作较为复杂，从细胞中提取的蛋白质或从含有蛋白质的溶液中经过沉淀、梯度离心、盐析等方法得到的蛋白质经常含有杂质，要去除这些杂质，同时又要保持蛋白质的生物学活性，如酶的催化活性，就需要根据不同的蛋白质制定出相应的策略，采用不同的方法。电泳和色谱法是比较常用的方法，尤其是色谱法，对蛋白质的处理较为温和，又可大量制备有生物学活性的纯化蛋白质，因此是目前较广应用的技术方法。蛋白质的分离纯化工作较为复杂。
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蛋白纯化的目的是将目标蛋白质从细胞裂解液的全部组分中分离出来，同时仍保留蛋白的生物学活性及化学完整性。蛋白质的分离和提纯工作是一项艰巨而繁重的任务，需根据蛋白的特性选择合适的纯化方法来提高获得的蛋白制品的纯度。
蛋白纯化的原理为：不同蛋白质的氨基酸序列及空间结构不同，导致其在物理、化学、生物学等性质上存在差异，利用待分离蛋白质与其它蛋白质性质上的差异，即可以设计出一套合理的蛋白纯化方案。蛋白的纯化大致分为粗分离阶段和精细纯化阶段两个阶段。粗分离阶段主要将目的蛋白和其他细胞成分如 RNA、DNA 等分开，常用的方法为硫酸铵沉淀法。精细纯化阶段的目的是把目的蛋白与其他大小及理化性质接近的蛋白区分开来，常用的方法有：凝胶过滤层析、离子交换层析、疏水层析、亲和层析等。
排阻层析也叫凝胶过滤或分子筛。排阻层析柱的填充颗粒是多孔的介质,柱中围绕着颗粒所能容纳的液体量叫流动相，也称无效体积。太大的蛋白不能进入颗粒的孔内，只能存在于无效体积的溶液中，将会最早从柱中洗脱出来，对这部分蛋白无纯化效果。由于各种蛋白的分子大小不同，扩散进入特定大小孔径颗粒内的能力也各异。大的蛋白分子会被先洗脱出来，分子越小，洗脱出来的越晚。为得到比较好的纯化效果，应将孔径大小选在目的蛋白能在无效体积和总柱床体积的中点附近洗脱。排阻层析有其他方法所不具备的优点，首先所能纯化的蛋白分子量范围宽，TosohBiosep公司的聚合物树脂，排阻极限可达20o000kD;其次，树脂微孔的形状适合分离球形的蛋白质，纯化过程中也不需要能引起蛋白变性的有机溶剂。应该注意的是某些蛋白不适合用凝胶过滤纯化，因为本技术所用树脂有轻度的亲水性，电荷密度较高的蛋白容易吸附在上面。排阻层析从不用于纯化过程的早期，因为这种方法要求标本高度浓缩，上样量只能在柱体积的19%--4%之间，柱子要细而长才能得到好的分***果，树脂本身也比较昂贵，规模化的工业生产中不太适用。 常用的分离、纯化免疫球蛋白的方法主要有哪几种？
其他纯化方法
对于具有特殊性质的蛋白，可以利用特殊的方法对其进行纯化，下面就一些蛋白的特殊性质及纯化方法做一介绍。可逆性缔合：在某些溶液条件下，有一些酶能聚合成二聚体、四聚体等，而在另一种条件下则形成单体，如相继在这两种不同的条件下按大小就可以进行分级分离。
热稳定性：大多数蛋白质加热到 95℃时会解折叠或沉淀，利用这一性质，可容易地将一种经这样加热后仍保持其可溶性活性的蛋白质从大部分其它细胞蛋白质中分离开。
蛋白酶解稳定性：用蛋白酶处理上清液消化杂蛋白，可以纯化得到具有蛋白酶解抗性的蛋白质。
溶解度：影响蛋白质溶解度的外界因素很多，如溶液的 pH、离子强度、介电常数和温度等。在特定的外界条件下，不同的蛋白质具有不同的溶解度。适当改变外界条件，控制蛋白质混合物中某一成分的溶解度从而将其从溶液中析出。 快速蛋白纯化系统特点是什么？南京自动蛋白纯化参考价
分子筛层析蛋白纯化系统的应用范围和操作步骤。宁波蛋白纯化服务电话
各种蛋白质在同一pH条件下，因分子量和电荷数量不同而在电场中的迁移率不同而得以分开。值得重视的是等电聚焦电泳，这是利用一种两性电解质作为载体，电泳时两性电解质形成一个由正极到负极逐渐增加的pH梯度，当带一定电荷的蛋白质在其中泳动时，到达各自等电点的pH位置就停止，此法可用于分析和制备各种蛋白质。2、离子交换层析法离子交换剂有阳离子交换剂（如：羧甲基纤维素；CM-纤维素）和阴离子交换剂（二乙氨基乙基纤维素；DEAE?FONTFACE="宋体"LANG="ZH-CN">纤维素），当被分离的蛋白质溶液流经离子交换层析柱时，带有与离子交换剂相反电荷的蛋白质被吸附在离子交换剂上，随后用改变pH或离子强度办法将吸附的蛋白质洗脱下来。（四）根据配体特异性的分离方法－亲和色谱法亲和层析法（aflinitychromatography）是分离蛋白质的一种极为有效的方法，它经常只需经过一步处理即可使某种待提纯的蛋白质从很复杂的蛋白质混合物中分离出来，而且纯度很高。这种方法是根据某些蛋白质与另一种称为配体(Ligand）的分子能特异而非共价地结合。其基本原理：蛋白质在**或细胞中是以复杂的混合物形式存在，每种类型的细胞都含有上千种不同的蛋白质，因此蛋白质的分离。 宁波蛋白纯化服务电话
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