3C-like蛋白酶是中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)等其它冠状病毒的繁殖过程中极为重要的蛋白酶。它已成为人类在抗冠状病毒领域中的研究热点。本文基于计算生物学方法对与MERS-CoV同属的蝙蝠冠状病毒HKU4(HKU4-CoV)的43个肽类3C-like蛋白酶抑制剂分子,建立三维定量构效关系(3D-QSAR)模型。在基于配体叠合的基础上,发现比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)中的四个场组合(位阻场、静电场、氢键供体场与氢键受体场)为比较好的模型(Q2=0.522,Rncv2=0.996,Rpre2=0.904;Q2:交叉验证相关系数,Rncv2:非交叉验证相关系数,Rpre2:验证集分子的预测值相关系数),并借助该模型通过分子对接(docking)与分子动力学(MD)方法阐明了配受体结合作用。实验结果表明:(1)基于比较好的CoMSIA模型基础上的三维等势图形象地说明了分子基团的位阻作用、静电作用、氢键供体与氢键受体作用对分子生物活性的影响;(2)分子对接研究结果显示了疏水性以及结晶水、氨基酸His166和Glu169在配体和受体结合过程中产生重要作用;PNGase F可以用于释放糖链,进而通过质谱等技术进行糖链的详细结构分析。Recombinant Human VCAM-1/CD106 Protein,His Tag
5'DNA腺苷酰化试剂盒通过酶学方法高效地将单链DNA(ssDNA)5'端腺苷酰化,通常转化效率可达95%以上。以下是实现高效转化的关键步骤和特点:1.**单步反应**:与传统化学方法相比,该试剂盒可以在一个简单的步骤中完成5'端磷酸化修饰的单链DNA或RNA的腺苷酰化修饰,无需多步骤操作或纯化。2.**高效率**:试剂盒通常能将95%以上的5'端磷酸化的DNA(pDNA)转化成腺苷酰化DNA(AppDNA),从而提高产量并避免胶回收提纯步骤。3.**高温孵育**:在65℃的高温下进行反应,有助于避免DNA或RNA的二级结构对腺苷酰化反应的干扰。4.**酶的来源**:试剂盒中的腺苷酰化酶(Adenylase)通常来源于嗜热古细菌,在大肠杆菌中表达获得,保证反应的高效性。5.**操作简便**:使用MthRNA连接酶、ATP和5'-磷酸化的单链DNA进行反应,操作简单,且腺苷化产物通常不需要进行电泳切胶回收,可以直接通过乙醇沉淀进行进一步浓缩后用于后续的连接反应。6.**失活酶**:反应完成后推荐在85℃孵育5分钟以失活Adenylase,防止去腺苷酰化现象,确保腺苷酰化比率不下降。
脱氧腺苷三磷酸(Deoxyadenosinetriphosphate,dATP)是一种去氧核苷酸三磷酸,它是DNA合成和复制过程中必需的原料之一。dATP的结构与腺苷三磷酸(ATP)相似,但dATP的五碳糖2号碳上缺少一个-OH基,取而代之的是一个氢原子。dATP是四种dNTPs(脱氧核糖核苷酸三磷酸)之一,四种dNTPs包括dATP、dCTP、dGTP和dTTP,它们分别对应DNA中的腺嘌呤、胞嘧啶、鸟嘌呤和胸腺嘧啶。dATP的化学式为C10H16N5O12P3,分子量为491.182,CAS登录号为1927-31-7。在实验室中,dATP通常以100mM的浓度提供,用于各种分子生物学技术,如PCR、DNA测序和分子克隆技术。dATP溶液需要在低温条件下保存,通常是-20℃,以保持其稳定性和活性。在DNA测序中,dATP与ddATP一起使用,ddATP是dATP的衍生物,它缺少3'-OH基团,用于Sanger测序中的链终止反应。在PCR中,dATP作为DNA聚合酶的底物,用于合成新的DNA链。dNTPs的浓度在PCR反应中非常重要,适当的浓度有助于减少错配和提高扩增效率。通常,四种dNTPs以等浓度混合使用,以减少PCR过程中的错配误差。在某些情况下,根据目标序列的长度和组成,可能需要调整dNTPs的浓度,以优化PCR反应。
BloodDirectPCRMasterMix(2×)适合血液样本的PCR扩增主要通过以下几个方面:1.**抗血液抑制剂能力**:该预混合溶液含有的DNA聚合酶和其他成分能够抵抗血液样本中的PCR抑制剂,如胆酸盐、血红素、蛋白质等。2.**优化的缓冲体系**:预混合溶液中的缓冲体系经过特别优化,以适应血液样本中的特定条件,包括pH、离子强度和Mg2+浓度,从而提高PCR扩增的效率和特异性。3.**高保真DNA聚合酶**:包含的DNA聚合酶具有高保真度,能够在复制DNA时减少错误,保证扩增结果的准确性。4.**快速扩增速度**:一些BloodDirectPCRMasterMix产品具有快速扩增的特点,可以缩短PCR实验的时间。5.**宽泛的GC含量适应性**:该产品可以用于扩增不同GC含量的基因,包括高GC和低GC区域,提高了PCR的适用性。6.**直接使用血液样本**:无需对血液样本进行DNA提取或纯化,可以直接将抗凝血样品或干血斑样品加入PCR反应中。7.**兼容性**:兼容多种抗凝剂,如EDTA、肝素或柠檬酸钠,适用于不同来源的血液样本。8.**简化的操作流程**:由于省去了DNA提取的步骤,BloodDirectPCRMasterMix简化了实验操作流程,减少了实验时间和潜在的污染风险。α-凝血酶的多面性质在其临床使用中提出了挑战,特别是在平衡其止血效果与血栓形成风险之间。
dNTPMix(脱氧核苷酸三磷酸混合溶液)的稳定性是进行PCR和其他DNA合成实验时的重要因素。以下是一些关于dNTPMix稳定性的关键点:1.**储存条件**:dNTPMix应储存在-20°C的条件下,以保持其稳定性和活性。2.**避免反复冻融**:dNTPMix应避免多次冻融,因为这可能会影响其稳定性。3.**使用频率**:如果使用频率较高,使用后应以-20°C储存。4.**长期储存**:对于长期储存或使用频率较低的情况,建议将dNTPMix储存在-70°C以保持好的状态。5.**质量控制**:dNTPMix应不含DNase和RNase,以避免DNA或RNA的降解。6.**纯度**:dNTPMix的纯度通常≥99%(HPLC检测),确保了其在实验中的可靠性。7.**pH调节**:dNTPMix通常用超纯水配制,并通过高纯度NaOH溶液调节pH值至约7.0,以保持其稳定性。8.**有效期**:在适当的储存条件下,dNTPMix的有效期通常为2年或更长时间。9.**使用注意事项**:使用dNTPMix时,应穿戴适当的实验室防护装备,如实验服和一次性手套,以确保操作安全。人α-凝血酶,一种丝氨酸蛋白酶,是凝血级联反应中的中心酶,对止血和其他多种生理过程至关重要。Recombinant Human JAM-A Protein,His Tag
通过使用PNGase F去除糖蛋白上的糖链,可以确定蛋白质是否发生糖基化,以及糖基化位点。Recombinant Human VCAM-1/CD106 Protein,His Tag
T4UvsX重组酶是一种来源于T4噬菌体的酶,属于RecA/Rad51家族的同源体。这种重组酶在双链DNA断裂的修复以及复制叉重新启动的过程中扮演着重要角色。T4UvsX重组酶能够与其他DNA结合蛋白或辅助因子协同作用,与单链DNA形成核酸蛋白复合物。该复合物通过寻找与目标DNA互补的区域进行杂交,以完成链置换反应,且此酶本身不具有核酸酶活性。产品应用方面,T4UvsX重组酶主要用于等温扩增技术,如重组酶聚合酶扩增(RPA)技术。它在实验中与T4UvsY重组酶、BsuDNA聚合酶(大片段)、T4基因32蛋白(gp32)等组分一同使用,以优化RPA扩增反应。T4UvsX重组酶的保存条件为-20℃,可保存3年,或者-20℃储存有效期为2年,避免反复冻融。其储存液通常包含Tris-HCl、KCl、DTT、EDTA和甘油等成分,以保持酶的稳定性和活性。热失活处理为60℃孵育10分钟。在使用T4UvsX重组酶时,需要注意其保存液中甘油含量较高,建议单独分装保存,并且在操作时穿着实验服并佩戴一次性手套,以确保安全。此外,该产品供科研使用,不应用于临床诊断。Recombinant Human VCAM-1/CD106 Protein,His Tag
在质粒DNA提取过程中,确保DNA的完整性和活性至关重要,这通常涉及以下几个关键因素:1.**温和的裂解条件**:选择适当的裂解方法对于保持DNA的完整性至关重要。对于大于15kb的质粒DNA,应采用温和的裂解方法,如将细菌悬浮于等渗的葡萄糖溶液中,加入溶菌酶和EDTA破坏细胞壁和细胞膜,以减少对质粒DNA的机械剪切力,从而保护其完整性。2.**避免过度裂解**:在质粒提取过程中,并非裂解时间越长越好。过长的裂解时间可能会造成基因组DNA片段的污染,影响质粒的纯度。3.**适当的洗涤和洗脱**:在纯化过程中,适当的洗涤可以去除蛋白质和其他杂质,但过度洗涤可能会导致DNA的损失。洗脱步骤中,确保...