DNaseI是一种使用的酶,它能够水解单链或双链DNA,产生5'端为磷酸基团的二核苷酸、三核苷酸或更短的寡核苷酸片段。这种酶的活性依赖于钙离子,并且可以被镁离子或二价锰离子启动。在镁离子存在的情况下,DNaseI可以随机剪切双链DNA的任意位点;而在二价锰离子存在时,它可以在同一位点剪切DNA双链,形成平末端或1-2个核苷酸突出的粘末端。DNaseI的一个特点是它不含RNase活性,因此可以用于处理各种RNA样品,而不会对RNA造成降解。DNaseI的应用非常广,包括但不限于:-制备不含DNA的RNA样品;-在RT-PCR反应前去除RNA样品中可能的DNA污染;-体外RNA聚合酶催化的RNA转录后去除DNA模板;-进行DNaseI足迹实验研究DNA-蛋白质相互作用;-缺口平移(nicktranslation);-产生DNA随机片段文库;-在细胞凋亡TUNEL检测中部分剪切基因组DNA作为阳性对照。DNaseI通常从牛胰腺中纯化得到,其分子量约为32kDa(单体)。活性定义为在37℃、10分钟内,能够完全降解1μgpBR322质粒DNA所需的酶量。在实验中,DNaseI的活性单位通常以Kunitz单位来表示,该单位是基于特定条件下酶降解DNA的能力来定义的。Taq DNA Polymerase 能够在相对较高的温度下保持稳定,其适催化温度在75-80°C。Recombinant Rat IL-2 Protein
pA-Tn5转座酶是一种经过特殊改造的融合蛋白,由ProteinA和高活性的Tn5转座酶组成,具有以下主要应用:1.**高通量测序建库**:pA-Tn5转座酶可以用于快速构建用于高通量测序的DNA文库,通过其转座酶活性实现DNA片段化,同时加上测序接头,简化了传统DNA测序建库的多步过程。2.**CUT&Tag技术**:这是一种新兴的蛋白质与DNA相互作用研究方法,pA-Tn5转座酶利用ProteinA与特定抗体结合,将转座酶带到目标蛋白附近进行DNA切割和标签添加,实现对蛋白质结合位点的高通量测序分析。CUT&Tag技术具有高特异性、低背景噪音、高灵敏度、良好重复性等优点,适用于表观遗传学、干细胞等领域的研究。3.**ATAC-seq**:pA-Tn5转座酶也可用于ATAC-seq实验,这是一种研究染色质可及性的方法,通过转座酶在没有核酸酶消化的情况下切割染色质DNA,然后在切割位点加上测序接头,进行后续的测序分析。4.**转录组测序快速建库**:有研究开发了基于Tn5转座酶的转录组测序快速建库方法,例如SHERRY方法,它利用Tn5转座酶直接作用于RNA/DNA杂交链,简化了建库过程,适用于单细胞转录组测序,提高了样本的利用率和测序速度。
磁珠法质粒小量抽提试剂盒通过一系列优化的步骤来确保从细菌细胞中提取高质量和高纯度的质粒DNA。以下是这一过程的一般步骤:1.**细胞培养**:-首先,将含有质粒的大肠杆菌在适宜的培养基中培养至适宜密度(通常是OD600约0.6-1.2)。2.**裂解细胞**:-使用试剂盒提供的裂解液(含有SDS和可能的其他裂解成分)破坏细菌细胞壁和膜,释放出细胞内容物。3.**吸附磁珠**:-将磁珠加入裂解后的混合物中,磁珠表面修饰有能够特异性结合核酸的配体,使得质粒DNA吸附于磁珠表面。4.**磁分离**:-利用磁力架将吸附有质粒DNA的磁珠从溶液中分离出来,去除未结合的蛋白质和其他细胞碎片。5.**洗涤杂质**:-经过几次洗涤步骤,使用试剂盒提供的洗涤液去除吸附在磁珠表面的蛋白质、RNA和其他杂质。6.**去除洗涤液**:-磁分离后,小心地移除洗涤液,避免磁珠干燥或吸入磁珠,以确保纯度。7.**洗脱质粒**:-使用试剂盒提供的洗脱液(通常是低盐或高pH的缓冲液)将质粒DNA从磁珠上洗脱下来。8.**收集质粒**:-洗脱后的质粒DNA通常在室温或4°C下保存,避免多次冻融,以维持DNA的完整性。
1st Strand cDNA Synthesis Kit(RNase H-)的逆转录过程是将RNA模板转换成cDNA的过程。这个过程通常包括以下几个步骤:模板RNA的准备:确保RNA模板的质量和纯度,可能需要使用DNase I来去除RNA样品中的DNA污染。逆转录反应体系的配制:根据试剂盒的说明,将RNA模板、引物(如Oligo(dT)、随机六聚体或基因特异性引物)、dNTPs、逆转录酶和缓冲液等组分混合在一起。逆转录酶的启用:如果需要,可能要将反应体系预热到一定温度以达到逆转录酶。逆转录反应:在适宜的条件下,逆转录酶会根据RNA模板合成一条互补的DNA链。这个过程通常在一定的温度范围内进行,以保证酶的活性和反应的效率。反应的终止:逆转录反应完成后,通常通过加热到较高温度来终止反应,以防止cDNA的进一步合成。产物的纯化:合成的cDNA可能需要通过某些方法(如柱层析或沉淀)进行纯化,以去除未反应的dNTPs、RNA模板和酶等。cDNA的检测和应用:合成的cDNA可以用于后续的PCR、qPCR、克隆、测序等实验。由于Pfu DNA Polymerase 对引物的质量要求较高,使用纯度高的引物可以减少由于引物错误导致的非目标突变。
Lambda核酸外切酶(LambdaExonuclease)高度特异性地作用于5'端磷酸化的双链DNA主要通过以下几个方面实现:1.**结构特异性识别**:Lambda核酸外切酶具有识别特定DNA结构的能力,特别是5'端磷酸化的双链DNA。这种识别能力通常由酶的活性位点结构决定,能够与5'-磷酸基团形成特定的相互作用。2.**酶活性位点**:酶的活性位点含有氨基酸残基,这些残基能够与5'-磷酸基团形成氢键或其他非共价相互作用,从而稳定酶与DNA的结合。3.**切割机制**:Lambda核酸外切酶通过水解5'-磷酸二酯键来降解DNA链。它从5'端开始,逐个移除核苷酸,直到遇到非5'-磷酸化的末端或遇到结构上的障碍。4.**低活性对非特异性底物**:对于5'-羟基(OH)末端的DNA或单链DNA,Lambda核酸外切酶的活性降低,因为这些底物缺乏与酶活性位点结合所需的特异性相互作用。5.**酶动力学**:Lambda核酸外切酶对5'-磷酸化双链DNA的酶动力学参数(如Km和Vmax)与对非特异性底物的参数有差异,这反映了其对特异性底物的高亲和力和高催化效率。6.**过程性(Processivity)**:一旦Lambda核酸外切酶结合到特异性底物上,它可以连续移除多个核苷酸,而不需要频繁地与底物解离和重新结合,这增加了酶的效率。来源于Francisella tularensis:FnCas12a是一种来源于Francisella tularensis菌株的核酸内切酶。Recombinant Biotinylated Mouse IL-23A Protein,His-Avi Tag
利用牛痘DNA拓扑异构酶I的连接原理,可以在无需DNA连接酶的情况下,快速高效地连接DNA片段,实现克隆。Recombinant Rat IL-2 Protein
1stStrandcDNASynthesisKit(RNaseH-)主要用于从RNA模板合成链cDNA,而不是直接用于线性RNA的放大。然而,合成的cDNA可以作为模板用于后续的线性RNA放大过程,这通常涉及以下几个步骤:1.**cDNA合成**:使用1stStrandcDNASynthesisKit(RNaseH-)按照试剂盒的说明进行操作,从线性RNA模板合成链cDNA。2.**第二链cDNA合成**:在某些情况下,可能需要合成双链cDNA。这可以通过使用DNA聚合酶和第二链合成试剂来完成,从而获得完整的双链cDNA。3.**线性RNA放大**:一旦获得了cDNA,可以使用体外转录(IVT,InVitroTranscription)技术来放大RNA。这通常涉及以下步骤:-使用含有RNA聚合酶启动子序列的特定引物对cDNA进行PCR扩增。-使用含有RNA聚合酶识别位点的引物进行体外转录反应,以合成大量RNA拷贝。4.**RNA纯化**:体外转录产生的RNA需要通过适当的方法(如柱层析或沉淀)进行纯化,以去除DNA模板、未反应的核苷酸和其他杂质。5.**RNA质量检测**:使用凝胶电泳或生物分析仪检测RNA的质量和大小,确保RNA的完整性和纯度。Recombinant Rat IL-2 Protein
核酸内切酶VIII(EndonucleaseVIII)和核酸内切酶III(EndonucleaseIII)都是DNA修复酶,但它们之间存在一些关键的区别:1.**活性类型**:-**核酸内切酶VIII**:具有N-糖基化酶(N-glycosylase)活性和AP裂解酶(AP-lyase)活性。N-糖基化酶活性可以释放受损的嘧啶碱基,如胸腺嘧啶乙二醇和尿嘧啶乙二醇,产生一个脱嘌呤(Apurinic,AP)位点;AP裂解酶活性可以切割AP位点的3'和5'端,产生一个具有3'和5'磷酸的碱基缺口(Gap)。-**核酸内切酶III**:主要具有β裂解酶(β-lyase)活性,能够切割DNA磷二酯骨架在...