pA-Tn5转座酶是一种经过特殊改造的融合蛋白,由ProteinA和高活性的Tn5转座酶组成,具有以下主要应用:1.**高通量测序建库**:pA-Tn5转座酶可以用于快速构建用于高通量测序的DNA文库,通过其转座酶活性实现DNA片段化,同时加上测序接头,简化了传统DNA测序建库的多步过程。2.**CUT&Tag技术**:这是一种新兴的蛋白质与DNA相互作用研究方法,pA-Tn5转座酶利用ProteinA与特定抗体结合,将转座酶带到目标蛋白附近进行DNA切割和标签添加,实现对蛋白质结合位点的高通量测序分析。CUT&Tag技术具有高特异性、低背景噪音、高灵敏度、良好重复性等优点,适用于表观遗传学、干细胞等领域的研究。3.**ATAC-seq**:pA-Tn5转座酶也可用于ATAC-seq实验,这是一种研究染色质可及性的方法,通过转座酶在没有核酸酶消化的情况下切割染色质DNA,然后在切割位点加上测序接头,进行后续的测序分析。4.**转录组测序快速建库**:有研究开发了基于Tn5转座酶的转录组测序快速建库方法,例如SHERRY方法,它利用Tn5转座酶直接作用于RNA/DNA杂交链,简化了建库过程,适用于单细胞转录组测序,提高了样本的利用率和测序速度。
pA-Tn5转座酶的高活性是其重要特性之一,这种高活性主要来源于以下几个方面:1.**转座酶突变体**:pA-Tn5转座酶是由Tn5转座酶的高活性突变体构成的。这种突变体相比野生型Tn5转座酶,在体外的转座效率显著提高,通常提升1000倍以上。2.**ProteinA融合**:pA-Tn5转座酶将ProteinA与高活性Tn5转座酶融合,这种融合不仅保留了Tn5转座酶的高效DNA切割能力,还通过ProteinA的抗体结合特性,提高了对特定DNA序列的靶向能力。3.**转座随机性**:pA-Tn5转座酶能够在整个基因组上实现随机的DNA切割,这为高通量测序提供了广的覆盖度。4.**稳定性**:高活性的pA-Tn5转座酶在各种实验条件下都能保持稳定,包括在不同的温度和pH值条件下。5.**插入位点易测序**:pA-Tn5转座酶产生的DNA片段具有明确的插入位点,这些位点容易被高通量测序技术识别和分析。6.**高效片段化**:在CUT&Tag等实验中,pA-Tn5转座酶能够高效地实现目标蛋白结合DNA的片段化,为后续的测序和分析打下基础。7.**低细胞投入量**:由于其高活性,pA-Tn5转座酶允许从极少量的细胞中进行实验,如单细胞水平的研究。
AdvanceFastPCRMasterMix(2×)中的特异性主要体现在以下几个方面:1.**高保真DNA聚合酶**:该产品含有的HieffCanace™AdvanceFastHigh-FidelityDNAPolymerase是一种高保真度的DNA聚合酶,它具有较低的错误率,能够在复制DNA时减少突变的发生,特别是在高GC含量的基因区域。2.**优化的缓冲体系**:产品中的缓冲体系经过特别优化,能够提供适宜的反应条件,从而提高PCR反应的特异性,减少非特异性扩增。3.**快速扩增速度**:该产品具有快速扩增的特点,速度可达5秒/kb,快速的扩增速度有助于减少非特异性扩增的机会。4.**宽泛的GC含量适应性**:它可以用于扩增20-80%GC含量的基因,这表明它对不同基因序列的适应性强,有助于提高特异性扩增。5.**良好的稳定性**:产品含有特异保护剂,即使在反复冻融后仍能保持稳定活性,这有助于维持PCR反应的一致性和特异性。6.**直接电泳**:由于含有预添加的电泳指示剂,PCR产物可以直接进行电泳分析,减少了后续操作步骤中可能引入的非特异性问题。
脱氧腺苷三磷酸(Deoxyadenosinetriphosphate,dATP)是一种去氧核苷酸三磷酸,它是DNA合成和复制过程中必需的原料之一。dATP的结构与腺苷三磷酸(ATP)相似,但dATP的五碳糖2号碳上缺少一个-OH基,取而代之的是一个氢原子。dATP是四种dNTPs(脱氧核糖核苷酸三磷酸)之一,四种dNTPs包括dATP、dCTP、dGTP和dTTP,它们分别对应DNA中的腺嘌呤、胞嘧啶、鸟嘌呤和胸腺嘧啶。dATP的化学式为C10H16N5O12P3,分子量为491.182,CAS登录号为1927-31-7。在实验室中,dATP通常以100mM的浓度提供,用于各种分子生物学技术,如PCR、DNA测序和分子克隆技术。dATP溶液需要在低温条件下保存,通常是-20℃,以保持其稳定性和活性。在DNA测序中,dATP与ddATP一起使用,ddATP是dATP的衍生物,它缺少3'-OH基团,用于Sanger测序中的链终止反应。在PCR中,dATP作为DNA聚合酶的底物,用于合成新的DNA链。dNTPs的浓度在PCR反应中非常重要,适当的浓度有助于减少错配和提高扩增效率。通常,四种dNTPs以等浓度混合使用,以减少PCR过程中的错配误差。在某些情况下,根据目标序列的长度和组成,可能需要调整dNTPs的浓度,以优化PCR反应。利用牛痘DNA拓扑异构酶I的连接原理,可以在无需DNA连接酶的情况下,快速高效地连接DNA片段,实现克隆。
pA-Tn5转座酶是通过将ProteinA与Tn5转座酶进行融合来构建的。ProteinA是一种来源于金黄色葡萄球菌的蛋白质,它具有高亲和力结合大多数哺乳动物IgG抗体的Fc片段的能力。Tn5转座酶是一种能够识别特定DNA序列并在基因组上进行“剪切-粘贴”或“复制-粘贴”的酶。融合ProteinA的目的是为了在实验中实现对特定蛋白质的靶向。下面是pA-Tn5转座酶融合的一般步骤:1.**基因克隆**:首先,将Tn5转座酶的基因和ProteinA的基因克隆到一个表达载体中。这通常涉及到分子克隆技术,如PCR扩增、限制性内切酶消化和连接酶连接。2.**融合蛋白设计**:设计一个融合蛋白,其中ProteinA的基因序列和Tn5转座酶的基因序列通过一个短的连接肽(LinkerPeptide)相连。这个连接肽通常包含几个氨基酸残基,以确保两个蛋白部分在融合后仍能保持各自的构象和功能。3.**表达载体构建**:将融合基因插入到适合的表达载体中,这个载体应该包含适当的启动子、标记基因(如抗性基因)和终止子,以确保融合蛋白在宿主细胞中得到高效表达。4.**宿主细胞表达**:将构建好的表达载体转化到宿主细胞(如大肠杆菌)中,通过诱导表达融合蛋白。牛痘DNA拓扑异构酶I是一种来源于牛痘病毒的酶,有多种作用于DNA分子的能力。Recombinant Human LRP-6Protein,mFc Tag
SpCas9-NLS的N端和C端都融合了SV40 T抗原的核定位信号,这使得Cas9蛋白与gRNA形成的复合物。Recombinant Human LRP-6Protein,mFc Tag
RNaseH-(RNaseH缺乏)通常是指在某些逆转录酶中通过突变消除了RNaseH活性的酶。这种酶在合成cDNA链时不会降解RNA模板,因此可以用于生成更高产量的全长cDNA,尤其是在使用较长的RNA模板时。RNaseH-的应用主要包括:1.**全长cDNA合成**:由于RNaseH-不会在逆转录过程中降解RNA模板,因此可以合成更长的cDNA片段。2.**提高cDNA产量**:在某些情况下,使用RNaseH-可以提高cDNA的产量,特别是当RNA模板质量较高时。3.**避免RNA降解**:在逆转录过程中,RNaseH-有助于保护RNA模板不被降解,这对于后续的分子生物学实验非常重要。4.**特定基因表达分析**:RNaseH-可用于合成特定基因的cDNA,进而进行基因表达分析。5.**RNA病毒研究**:在研究RNA病毒时,RNaseH-可用于合成病毒RNA的cDNA,以便进一步研究病毒的基因组。6.**基因克隆和功能研究**:合成的全长cDNA可以用于克隆和研究基因的功能。7.**提高qPCR和RT-qPCR的效率**:使用RNaseH-合成的cDNA作为模板,可以提高定量PCR的效率和准确性。8.**RNA干扰和基因沉默研究**:RNaseH-有助于合成siRNA或shRNA,进而研究基因沉默的效果。
磁珠法PCR/DNA纯化试剂盒在科研中的应用非常广,主要包括以下几个方面:1.**PCR产物的纯化**:磁珠法试剂盒可以从PCR反应液中回收不同片段大小的DNA,有效去除酶、dNTP、盐类等杂质,回收率高,产物纯度好,可以直接应用于PCR、连接、测序、NGS建库等下游实验。2.**基因组DNA的提取**:适用于从血液、唾液、口腔拭子和动物组织等样品中分离纯化高质量基因组DNA,提取的DNA片段大,纯度高,质量稳定可靠,适合高通量工作站的自动化提取。3.**质粒DNA的提取**:磁珠用于从粗制的提取物中分离质粒DNA,通过精心优化的溶液将质粒DNA从基因组DNA和蛋白质中分离出来。4.**DNA...