荧光探针法是一种利用荧光标记的分子(即荧光探针)来检测和定量目标分子的方法。这种方法广泛应用于生物化学、分子生物学和医学诊断等领域。以下是荧光探针法的一些关键特点和工作原理:1.**荧光标记**:荧光探针是一类特殊的分子,它们含有可以发出荧光的化学基团(荧光团)。这些荧光团在受到特定波长的光激发时,会发出特定波长的光。2.**特异性结合**:荧光探针通常设计成能够特异性地与目标分子结合,如DNA、RNA、蛋白质或其他小分子。这种结合通常是通过分子间的互补性,如氢键、疏水作用或离子键等实现的。3.**信号变化**:荧光探针在结合目标分子前后,其荧光特性(如荧光强度、波长、寿命等)会发生改变。这种变化可以是增强或减弱,取决于探针的设计和环境条件。4.**检测原理**:-在**荧光共振能量转移(FRET)**中,两个不同的荧光团被设计成靠近,使得一个荧光团(供体)的能量可以非放射性地转移到另一个荧光团(受体)。当供体和受体之间的距离改变(如由于目标分子的结合)时,FRET效率会改变,从而影响荧光信号。-在**荧光增强或减弱**中,探针的荧光特性直接受到其与目标分子结合的影响。例如,某些探针在结合DNA后,其荧光强度会增强。FnCas12a的双链或单链DNA靶标都能激发其反式剪切活性,即在形成三元复合物后,针对非特异序列ssDNA的剪切。Colivelin
DNaseI是一种使用的酶,它能够水解单链或双链DNA,产生5'端为磷酸基团的二核苷酸、三核苷酸或更短的寡核苷酸片段。这种酶的活性依赖于钙离子,并且可以被镁离子或二价锰离子启动。在镁离子存在的情况下,DNaseI可以随机剪切双链DNA的任意位点;而在二价锰离子存在时,它可以在同一位点剪切DNA双链,形成平末端或1-2个核苷酸突出的粘末端。DNaseI的一个特点是它不含RNase活性,因此可以用于处理各种RNA样品,而不会对RNA造成降解。DNaseI的应用非常广,包括但不限于:-制备不含DNA的RNA样品;-在RT-PCR反应前去除RNA样品中可能的DNA污染;-体外RNA聚合酶催化的RNA转录后去除DNA模板;-进行DNaseI足迹实验研究DNA-蛋白质相互作用;-缺口平移(nicktranslation);-产生DNA随机片段文库;-在细胞凋亡TUNEL检测中部分剪切基因组DNA作为阳性对照。DNaseI通常从牛胰腺中纯化得到,其分子量约为32kDa(单体)。活性定义为在37℃、10分钟内,能够完全降解1μgpBR322质粒DNA所需的酶量。在实验中,DNaseI的活性单位通常以Kunitz单位来表示,该单位是基于特定条件下酶降解DNA的能力来定义的。Recombinant Cynomolgus AFP Protein,His TagRecombinant Biotinylated Human MAGE-A3 (HLA-A*24:02) Protein, His-Avi Tag 是一种通过重组DNA技术。
5'DNA腺苷酰化试剂盒通过酶学方法高效地将单链DNA(ssDNA)5'端腺苷酰化,通常转化效率可达95%以上。以下是实现高效转化的关键步骤和特点:1.**单步反应**:与传统化学方法相比,该试剂盒可以在一个简单的步骤中完成5'端磷酸化修饰的单链DNA或RNA的腺苷酰化修饰,无需多步骤操作或纯化。2.**高效率**:试剂盒通常能将95%以上的5'端磷酸化的DNA(pDNA)转化成腺苷酰化DNA(AppDNA),从而提高产量并避免胶回收提纯步骤。3.**高温孵育**:在65℃的高温下进行反应,有助于避免DNA或RNA的二级结构对腺苷酰化反应的干扰。4.**酶的来源**:试剂盒中的腺苷酰化酶(Adenylase)通常来源于嗜热古细菌,在大肠杆菌中表达获得,保证反应的高效性。5.**操作简便**:使用MthRNA连接酶、ATP和5'-磷酸化的单链DNA进行反应,操作简单,且腺苷化产物通常不需要进行电泳切胶回收,可以直接通过乙醇沉淀进行进一步浓缩后用于后续的连接反应。6.**失活酶**:反应完成后推荐在85℃孵育5分钟以失活Adenylase,防止去腺苷酰化现象,确保腺苷酰化比率不下降。
pA-Tn5转座酶的产品组分通常包括以下几个部分:1.**pA-Tn5转座酶蛋白**:一种高活性的Tn5转座酶突变体与ProteinA的融合蛋白,它是产品的主要组分,用于实现DNA片段化和接头连接的功能。2.**储存溶液**:碧云天的BeyoNGS™pA-Tn5转座酶产品含有特定的储存溶液,其组成为50mMHEPES(pH7.2),100mMNaCl,0.1mMEDTA,1mMDTT,0.1%TritonX-100,50%(v/v)Glycerol,这种溶液有助于保持酶的稳定性和活性。3.**测序接头(Adapters)**:用于与pA-Tn5转座酶组装形成pA-Tn5转座体(pA-Tn5Transposome),这是进行CUT&Tag实验的必需组分。4.**反应缓冲液**:部分产品包含用于转座酶反应的缓冲液,例如5×TagmentBuffer,这种缓冲液含有Mg2+,对转座酶的活性至关重要。5.**附件**:某些产品可能还包括附件,如说明书,提供产品使用和保存的详细信息。6.**其他组分**:根据产品的不同,可能还包括CouplingBuffer、AnnealingBuffer等其他辅助组分,这些组分有助于转座酶与DNA的结合和反应的进行。7.**包装规格**:pA-Tn5转座酶的包装规格可能有所不同,例如碧云天提供的BeyoNGS™pA-Tn5转座酶有800pmol和4000pmol两种包装规格。来源于Francisella tularensis:FnCas12a是一种来源于Francisella tularensis菌株的核酸内切酶。
1stStrandcDNASynthesisKit(RNaseH-)通常提供几种不同类型的引物用于启动cDNA的合成。这些引物包括:1.**Oligo(dT)引物**:这种引物通常与mRNA的poly(A)尾部互补配对,适用于从真核生物的mRNA中合成cDNA。它能够产生大量全长cDNA,特别是当模板来源于真核生物时。2.**随机六聚体引物(RandomHexamers)**:这些引物是一组随机的六核苷酸序列,可以与RNA模板的任何部分结合,从而启动cDNA的合成。它们适用于mRNA、rRNA、tRNA和长非编码RNA等多种类型的RNA模板。3.**基因特异性引物(GeneSpecificPrimers)**:这些引物是针对特定基因序列设计的,可以用于从总RNA或mRNA中合成特定基因的cDNA。它们通常用于当需要选择性地扩增特定基因或基因家族时。在选择引物时,需要考虑RNA模板的来源、RNA的质量和特性以及后续实验的需求。例如,如果RNA模板具有复杂的二级结构或较高的GC含量,可能需要使用随机引物以提高cDNA合成的效率。另外,如果后续实验是qPCR,可以将Oligo(dT)与随机引物混合使用,以提高qPCR结果的真实性和重复性。将Cas9/sgRNA复合物转染到目标细胞中。可以使用脂质体介导转染、电穿孔或其他转染技术 。Kemptide
在gRNA的引导下,Cas9 NLS可以对特定DNA序列进行剪切,适用于研究基因功能或进行基因编辑 。Colivelin
1st Strand cDNA Synthesis Kit(RNase H-)的逆转录过程是将RNA模板转换成cDNA的过程。这个过程通常包括以下几个步骤:模板RNA的准备:确保RNA模板的质量和纯度,可能需要使用DNase I来去除RNA样品中的DNA污染。逆转录反应体系的配制:根据试剂盒的说明,将RNA模板、引物(如Oligo(dT)、随机六聚体或基因特异性引物)、dNTPs、逆转录酶和缓冲液等组分混合在一起。逆转录酶的启用:如果需要,可能要将反应体系预热到一定温度以达到逆转录酶。逆转录反应:在适宜的条件下,逆转录酶会根据RNA模板合成一条互补的DNA链。这个过程通常在一定的温度范围内进行,以保证酶的活性和反应的效率。反应的终止:逆转录反应完成后,通常通过加热到较高温度来终止反应,以防止cDNA的进一步合成。产物的纯化:合成的cDNA可能需要通过某些方法(如柱层析或沉淀)进行纯化,以去除未反应的dNTPs、RNA模板和酶等。cDNA的检测和应用:合成的cDNA可以用于后续的PCR、qPCR、克隆、测序等实验。Colivelin
磁珠法PCR/DNA纯化试剂盒在科研中的应用非常广,主要包括以下几个方面:1.**PCR产物的纯化**:磁珠法试剂盒可以从PCR反应液中回收不同片段大小的DNA,有效去除酶、dNTP、盐类等杂质,回收率高,产物纯度好,可以直接应用于PCR、连接、测序、NGS建库等下游实验。2.**基因组DNA的提取**:适用于从血液、唾液、口腔拭子和动物组织等样品中分离纯化高质量基因组DNA,提取的DNA片段大,纯度高,质量稳定可靠,适合高通量工作站的自动化提取。3.**质粒DNA的提取**:磁珠用于从粗制的提取物中分离质粒DNA,通过精心优化的溶液将质粒DNA从基因组DNA和蛋白质中分离出来。4.**DNA...