土壤极小单胞菌是Pusillimonas属的微生物,原产地为中国。这种细菌具有革兰氏染色阴性、氧化酶阳性,氧化代谢的特性。主要用途为研究。在形态特征上,它们通常为革兰氏阴性杆菌,无芽孢,无鞭毛。在2216E平板上,它的菌落呈圆形,乳白色不透明,表面皱褶干燥,边缘规则,无晕环,中间凸起,直径1—2mm;在MA培养基上25℃生长6天,蛋白酶、淀粉酶、乳糖酶、酪蛋白酶呈阴性。此外,土壤极小单胞菌在土壤微生物群落中可能扮演着重要的角色。例如,它们可能参与土壤中的营养循环,包括有机物的分解和营养元素的转化。它们还可能与其他微生物存在相互作用,如在植物根际形成有益的微生物群落,促进植物生长或增强植物对病害的抵抗力。在农业应用方面,一些研究探讨了秸秆还田及磷细菌对土壤微生态及农作物产量的影响。研究发现,玉米秸秆配合外源添加磷细菌恶臭假单胞菌(Pseudomonasputida),可以增加土壤及豆角根际解磷类细菌数量、增加土壤有效磷含量、提高土壤解磷能力、促进豆角增产。这表明秸秆和磷细菌有相互促进作用,为秸秆还田和磷细菌田间施用方法的研究和应用提供了参考。沉积物微杆菌能够形成芽孢,这些芽孢能够在极端条件下存活,如高温度、压力、有毒化学物质以及辐射。双孢土星形酵母菌种
海滨海芽孢杆菌(Halobacillus)在生物修复中的具体应用包括:1.**提高生物修复效率**:通过构建功能性微生物群落,增强了对除草剂等污染物的生物降解能力。通过筛选关键物种构建简化的微生物群落,并使用SuperCC模拟不同组合的关键物种的微生物群落表现,以优化物种组合和微生物代谢相互作用。2.**合成微生物群落/细胞构建框架**:该框架不仅在微生物群落模拟方面有所应用,还在工业产品的生物合成中具有广泛的应用,从污染的生物修复到工业产品的生物合成。3.**耐盐微生物在生物修复中的应用**:耐盐微生物在生态修复和污染控制中具有独特的优势。它们通过控制细胞质中的渗透压来耐受盐分,这主要通过两种机制实现:相容性溶质积累或无机离子积累。此外,耐盐微生物在高盐浓度下生存的能力也与具有迷人物理化学和结构特性的酶蛋白有关。4.**有机污染物的降解**:海洋衍生的微生物是生物修复高盐环境、工业废水、纺织厂废水和合成染料脱色以及其他难降解污染物的有希望的微生物来源。5.**生产胞外多糖(EPS)**:海滨海芽孢杆菌的某些菌株能够产生具有乳化活性的胞外多糖,这些多糖可以用于原油的乳化和生物降解。
太湖类芽孢杆菌(Paenibacillustaihuensis)是一种在太湖环境中发现的细菌,属于类芽孢杆菌属(Paenibacillus)。这类细菌在太湖的沉积物和水体中都有分布,它们在湖泊生态系统中扮演着重要的角色。以下是关于太湖类芽孢杆菌的一些特点和研究进展:1.**多样性和分布**:研究表明,太湖沉积物中的可培养细菌具有较高的多样性,其中类芽孢杆菌属(Paenibacillus)是主要的菌群之一。这些细菌与芽孢杆菌属(Bacillus)、微球菌属(Micrococcus)、节杆菌属(Arthrobacter)、迪茨菌属(Dietzia)和假单胞菌属(Pseudomonas)等细菌具有较高的相似性。2.**磷转化作用**:太湖水体中的磷转化细菌与水体磷形态之间存在关系。研究表明,太湖水体中的总磷和活性磷含量与磷转化细菌的关系密切。无机磷和有机磷分解菌在底泥中的数量远高于水体中,且存在明显的时间和空间差异。太湖水体中的磷分解细菌主要归属于芽孢杆菌属(Bacillus)和假单孢菌属(Pseudomonas),其中类芽孢杆菌(Paenibacillus)也起到了一定的作用。3.**浮游细菌群落多样性**:太湖夏季浮游细菌群落多样性的研究显示,浮游细菌的数量和多样性在不同营养水平的湖区中存在明显的差异。
太平洋嗜冷杆菌(PsychrophilicbacteriafromthePacific)是一类在低温环境中生存的微生物,它们具有独特的适应机制,使其能在寒冷环境中生长和代谢。这些嗜冷菌具有多种适应策略,包括:1.**细胞膜的适应性**:为了保持膜的流动性,嗜冷菌的细胞膜中不饱和脂肪酸和分支脂肪酸的含量较高,这有助于在低温下维持细胞膜的柔韧性和功能。2.**冷休克蛋白(CSP)**:嗜冷菌会产生特定的冷休克蛋白,这些蛋白帮助细胞在温度下降时稳定RNA,从而维持蛋白质合成的进行。3.**抗冻蛋白和冰核的蛋白**:一些嗜冷菌能够产生抗冻蛋白或冰核的蛋白,这些蛋白可以防止细胞内形成冰晶,保护细胞不受冰晶的机械损伤。4.**代谢调整**:嗜冷菌在低温下会调整其代谢途径,以适应低温环境。这可能包括改变酶的活性、调整代谢中间体的浓度以及改变细胞呼吸链的组成。5.**外泌多糖和生物表面活性剂**:嗜冷菌能够产生外泌多糖和生物表面活性剂,这些物质有助于细胞在冰冷环境中保持湿润,减少水分流失,并可能有助于细胞在冰下的附着和移动。6.**压力耐受性**:一些嗜冷菌还具有高压耐受性,这使得它们能在深海环境中生存,这些环境通常伴随着低温和高压。假交替单胞菌在海洋中非常普遍,通常占表层海洋和深海总细菌群落的2-3%和14%。
玫瑰色新鞘氨醇菌(Paenibacillusroseus)是一种新发现的细菌种类,具有以下特点:1.**形态特征**:玫瑰色新鞘氨醇菌是一种粉红色的、革兰氏阳性、需氧的、有动力的杆状细菌。它在pH值范围6.0至9.0(适pH为7.5)、温度在10至37°C(适温度为30°C)以及0至3%的NaCl浓度(适浓度为0.5%)下都能生长。2.**基因特征**:通过16SrRNA基因序列分析,发现玫瑰色新鞘氨醇菌与PaenibacilluspinihumiS23T有97.3%的相似性,其次是与PaenibacilluselymiKUDC6143T有96.7%的相似性。其基因组草图总长度为5,367,904个碱基对,共鉴定出4857个基因,其中4629个为蛋白质编码基因,137个为RNA基因。3.**代谢活性**:玫瑰色新鞘氨醇菌的基因组注释显示了172个碳水化合物基因,其中一些可能负责从主要人参皂苷Rb1生物合成人参皂苷Rd。这种能力使得它在生物合成领域具有潜在的应用价值。4.**化学分类特征**:该细菌的DNAG+C含量为48.4mol%,主要醌为MK-7。其主要脂肪酸为C15:0anteiso、C16:0和C17:0anteiso。极性脂质包括磷脂酰乙醇胺、磷脂酰甘油、二磷脂酰甘油、磷脂酰-N-甲基乙醇胺、两种未鉴定的氨基磷脂和五种未鉴定的磷脂。肽聚糖的诊断二氨基酸是内消旋二氨基庚二酸。燕麦食酸菌是一种杆状的单胞菌,其大小约为1.2~3.0μm×0.4~0.6μm,具有1~2根极生鞭毛。宾氏微杆菌
产左聚糖微杆菌能够通过酶法合成左聚糖(levan),这是一种由β-D呋喃果糖聚合而成的天然果聚糖。双孢土星形酵母菌种
格木慢生根瘤菌(B)是一种与格木(一种豆科植物)共生的根瘤菌。根据搜索结果,以下是格木慢生根瘤菌的一些特点和应用:1.**遗传多样性**:研究表明,格木根瘤菌具有很大的遗传多样性,通过限制性酶切片段长度多态性(RFLP)分析16S-23SIGS序列,将166株根瘤菌分为22个型。2.**分类地位**:格木根瘤菌被分为4个种群,主要是Bradyrhizobiumelkanii和Bradyrhizobiumpachyrhizi这两个优势种群,以及Bradyrhizobiumyuanmingense和一个潜在的新种群Bradyrhizobiumsp.I作为次要种群。3.**进化分析**:进化动力分析结果表明基因突变和纵向遗传是格木慢生根瘤菌进化的主要推动力。4.**共生基因**:结瘤基因nodC和固氮基因nifH序列的系统发育分析将格木根瘤菌分为5-6个分支,分类结果与持家基因结果较一致,表明共生基因与持家基因呈共进化关系。5.**土壤理化因子相关性**:根瘤菌的种群分布特征与土壤理化因子相关性分析结果表明,B.elkanii的菌株偏好酸性土壤,且土壤pH与B.elkanii的分布呈正相关。双孢土星形酵母菌种