STEM基因表达趋势分析数据要求表达谱芯片或测序数据(已经过预处理)下游分析得到***富集的时间表达模式之后的分析有:1.时间表达模式中基因的功能富集2.时间表达模式中基因表达与性状之间的...
查看详细Agilent平台因为MeDIP技术本身的特点,都不能到达单碱基的分辨率,而Illumina的Infinium和GoldenGate检测技术却做得到。Illumina的Infinium甲基...
查看详细DNA甲基化作为表观遗传学研究的重要范畴,已经越来越受到研究者的关注。近些年来,随着DNA甲基化与组蛋白甲基化的联合作用机制、RNA干扰机制及去甲基化机制的发现,使得DNA甲基化研究受到***关注,从...
查看详细术语解释:互斥性(mutuallyexclusive):一组基因中只有一个在一种**中发生改变,这种现象被称为互斥性。共现性(co-occurrence):不同途径功能的基因突变可能发生在...
查看详细焦磷酸测序(Pyrosequencing)随着技术的不断改进,现在认为焦磷酸测序技术(Pyrosequencing)是甲基化检测新的金标准。焦磷酸测序作为一种新的序列分析技术,能够快速地检...
查看详细血清甲基化用于乳腺*转移早期筛查 Methylation patterns in serum DNA for early identification of disseminated ...
查看详细术语解读: TME: Tumormicroenvironment TMEscore: TMEsignature score(使用PCA算法计算得到,高意味着对病毒和干扰素免疫***和应...
查看详细**突变频谱分析(突变模式):目的:输入突变数据,用非负矩阵分解方法NMF分析突变特征,描述样本集的突变模式。什么是突变模式:这也是对TCGA数据的深度挖掘,从而提出的一个统计学概念。文章...
查看详细联合亚硫酸氢钠的限制性内切酶分析法(COBRA) 这种方法是将亚硫酸氢盐处理与酶切相结合来进行甲基化检测。DNA样本经亚硫酸氢盐处理后,利用PCR扩增。扩增产物纯化后用限制性内切酶(...
查看详细下游分析针对LASSO获得的基因模型(或称基因Panel)的验证:1.计算风险指数RiskScore2.绘制ROC曲线、DCA曲线、列线图进行验证3.绘制生KM存曲线对基因模型中的基因进行...
查看详细RIP-seqRNAImmunoprecipitation是研究细胞内蛋白与RNA相互作用的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具,能更有效地发现miRNA的调节靶点。这种技术运用针...
查看详细GSEA基本原理从方法上来讲,GSEA主要分为基因集进行排序、计算富集分数(EnrichmentScore,ES)、估计富集分数的***性水平并进行多重假设检验三个步骤。**步对输入的所有...
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