与IdeS不同,度拉糖肽由两个胰高xue糖素样肽-1 (GLP-1) 分子组成,它们通过柔性 GS 接头连接到人 IgG4 的 Fc 区域。为了分别研究肽和 Fc 区域,从而鉴定结构域特异性 PTM,用 Genovis的GlySERIAS 在 37°C 下冻干消化度拉糖肽 1 小时。为了降低样品复杂性,使用内切糖苷酶GlycINATOR Lyophilized去除Fc聚糖,并用DTT还原链间二硫键。反相LC-MS对样品的分析表明,使用GlySERIAS进行连接子消化后,肽从Fc区域完全去除。连接子中的大量甘氨酸残基为GlySERIAS提供了许多不同的潜在消化位点,这就是为什么Fc/2和GLP-1肽都被检测为几种变体,其中不同数量的甘氨酸和丝氨酸残基仍然连接。此外,还鉴定了GLP-1肽的氧化。尽管GlySERIAS同时在多个位点进行消化,但一式三份的酶解在获得的不同Fc/2变体的相对量中显示出可重复的结果。剩下一个连接子残基(甘氨酸残基),这有助于识别位于Fc区域的修饰。甘肃FabDELLOIdeS蛋白酶蛋白组学
与IdeS不同,Genovis的FabULOUS(SpeB)是一种半胱氨酸蛋白酶,可在来自多个不同物种和亚类的IgG的铰链区域消化,产生Fab和Fc片段。人、小鼠、大鼠、山羊和绵羊的IgG被FabULOUS消化,产生Fab和Fc片段。人IgG1的主要消化位点是......KTHT...例如,制备的Fab片段可用于亲和力研究、Fab糖基化研究和结构研究。对来自多个物种和亚类的IgG有活性–上铰链区域的消化物;快速-在一小时内生成Fab和Fc片段;有效消化小鼠IgG1。FabULOUS来源于化脓性链球菌,在大肠杆菌中表达。FabULOUS的分子量为29kDa,该酶含有His标签。福建GingisKHANIdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶Genovis将半胱氨酸蛋白酶FabRICATOR(IdeS)固定在磁性琼脂糖珠上,现在称为FabRICATOR MagIC。
Genovis除了提供IdeS酶以外,还提供很多种特异性蛋白酶,如半胱氨酸蛋白酶 FabALACTICA (IgdE)。IgdE 在铰链正上方的一个特定位点消化人 IgG1,产生完整的 Fab 和 Fc 片段的均质池。它在pH值和盐浓度范围内具有活性,不需要任何还原剂或辅助因子。因此,与许多其他常用的蛋白酶相比,FabALACTICA不需要任何优化来避免过度消化。这使得FabALACTICA成为一种有吸引力的酶,例如在还原和非还原条件下的LC-MS分析、抗体高阶结构(HOS)的结晶和NMR研究、双特异性或多特异性抗体的表征、单价结合研究和完整的Fc聚糖分析。
样品制备的条件可能会在样品中诱发伪影,因此需要避免高温和碱性pH值进行质谱分析。如果可能的话,避免多个步骤并在一锅反应中进行消化和还原也可能是有益的。与IdeS不同,为了探索Genovis的GingisREX对离液剂和去液剂的稳定性和耐受性,在一系列试剂中测试了酶活性,并使用底物测定进行了评估。数据显示,GingisREX在6M时耐受尿素,吐温高达1%,但活性在0.1%时受到SDC的负面影响。该酶在 pH 值范围为 5.0 至 9.0 时显示出活性,在 pH 值为 6.5-8.0 之间。综上所述,GingisREX可用于一锅反应,以同时消化和变性6M尿素。与Genovis的IdeS不同,双特异性 T 细胞接合器 (BiTE) 分子是一种融合蛋白疗法,其中两个 scFv 融合,形成一个双特异性分子,其中一个 scFv 靶向细胞毒性 T 细胞,另一个靶向Ai症抗原。该蛋白质由四个蛋白质结构域组成,两个 scFv 均由 VL 和 VH 区域组成,总共由三个柔性 GS 连接子连接。这种蛋白质的大尺寸(54 kDa)可能对通过完整质谱法进行产品质量监测构成挑战,因为标准MS仪器可能无法提供蛋白质的单同位素分辨率。Genovis提供冻干和固定化的FabRICATOR(IdeS),为客户提供了许多选择,满足他们的需求。
对于携带突变铰链的 Fc 融合蛋白或抗体来说,Fab 和 Fc 片段的生成可能具有挑战性。Genovis的GingisKHAN酶在铰链上方一个可触及的赖氨酸位点消化人IgG1,在足够温和的还原条件下保留链内和链间二硫键,从而产生完整的Fab和Fc片段。对于融合蛋白,消化通常在铰链上方获得,但融合伴侣的结构和氨基酸序列可能导致其他暴露的消化位点。如果去除保守的 Fc N-聚糖,Fc 中的第二个切割位点也可能被GingisKHAN酶切。将精选的单克隆人 IgG1 抗体和 Fc 融合蛋白与 GingisKHAN 在 37°C 下孵育 1 小时,并通过 HPLC 进行分析。在抗体及核酸药领域,倍笃生物产品线涵盖药物研发的全流程,抗体结构域分析蛋白酶、蛋白聚糖分析水解酶。江西GingisREXIdeS蛋白酶
度拉糖肽的使用GlySERIAS酶切后,HPLC分析后,还鉴定了GLP-1肽的氧化。甘肃FabDELLOIdeS蛋白酶蛋白组学
在Genovis,我们的策略是帮助客户进行中级(或亚基)分析,这是我们的工作,特别是我们的蛋白质酶切产品。完整质量和肽图谱是蛋白质表征的常用方法,我们发现,与简单但信息有限的完整质量和高度复杂但信息丰富的肽图谱相比,中级方法具有优势。通过执行中级描述,您可以生成从完整的质量实验中获得的所有信息,具有额外的优势。在对抗体进行完整质量分析时,很难明确地识别某些修饰。质谱仪器正在改进,可以更有效地分析更大的分子,但通过使用我们的SmartEnzymes,如IdeS,可以将抗体分解成更小的片段,这提高了这些实验可以执行的分辨率,因此,增加了鉴定修饰的信心。此外,你不仅能够更好地识别修改,而且你能够将它们定位到蛋白质上的单个结构域,这是你在完整水平上无法做到的。甘肃FabDELLOIdeS蛋白酶蛋白组学
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