广东GlySERIASIdeS蛋白酶蛋白组学

LC-MS中级分析是一种被大众接受的分析方法，用于快速表征mAb和其他基于IgG的生物制药。它有助于理解多种关键质量属性 （CQA），例如糖基化、氧化和 C 端赖氨酸剪切。这种关于翻译后修饰（PTM）的详细知识是生物制药开发和制造所必需的。Genovis的FabRICATOR HPLC酶色谱柱，可快速进行单克隆抗体的柱上酶切，并产生一致的亚基。该色谱柱含有固定化的FabRICATOR（IdeS）酶，可在铰链下方快速且特异性地消化IgG，产生F（ab'）2和Fc片段，而不会出现任何过度消化的风险。为了减少样品处理并为样品制备提供自动化解决方案，FabRICATOR被共价固定在树脂上，并装在适用于HPLC的PEEK色谱柱硬件中。使用FabRICATOR HPLC色谱柱，只需稍作修改，即可使用标准HPLC-MS装置自动生成抗体亚基。然后，FabRICATOR HPLC色谱柱上消解产生的亚基被捕获在在线连接的反相（RP）色谱柱的柱头上。Genovis将半胱氨酸蛋白酶FabRICATOR（IdeS）固定在磁性琼脂糖珠上，现在称为FabRICATOR MagIC。广东GlySERIASIdeS蛋白酶蛋白组学

与IdeS不同，Romiplostim 由四个相同的血小板生成素 （TPO） 受体结合肽和一个 Fc 片段组成，通过柔性聚甘氨酸序列连接在一起。与度拉糖肽类似，用 Genovis的GlySERIAS Immobilized 在 37°C 下过夜，或用 GlySERIAS 冻干 1 小时并在 37°C 下过夜消化该蛋白质。 链间二硫键被还原，以便于通过反相LC-MS进行以下分析。与度拉糖肽的观察结果类似，用固定化酶消化产生均质的 Fc/2，剩下一个连接子残基，此处为甘氨酸残基。这有助于识别专门位于Fc区域的修改。用冻干酶消化 1 小时得到 Fc/2，剩余 4 个甘氨酸残基和少量的 Fc/2 仍与一个 TPO 肽连接。另一方面，这使得研究 Fc/2 和第yi个肽之间的连接区域成为可能，而不会受到第二个肽的干扰。用 GlySERIAS 冻干液过夜消化产生 2 个 Fc/2 变体，分别剩下 4 个和 1 个甘氨酸残基。根据消化时间的不同，使用冻干产物释放的肽以五或七种变体存在，接头中残留的甘氨酸残基数量不同，而使用固定化产物释放的肽以四种变体存在。云南FabRICATORIdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶反相LC-MS对样品的分析表明，使用Genovis的GlySERIAS进行度拉糖肽的连接子消化后，肽从Fc区域完全去除。

Genovis除了提供IdeS酶以外，还提供很多种特异性蛋白酶，如半胱氨酸蛋白酶 FabALACTICA （IgdE）。IgdE 在铰链正上方的一个特定位点消化人 IgG1，产生完整的 Fab 和 Fc 片段的均质池。它在pH值和盐浓度范围内具有活性，不需要任何还原剂或辅助因子。因此，与许多其他常用的蛋白酶相比，FabALACTICA不需要任何优化来避免过度消化。这使得FabALACTICA成为一种有吸引力的酶，例如在还原和非还原条件下的LC-MS分析、抗体高阶结构（HOS）的结晶和NMR研究、双特异性或多特异性抗体的表征、单价结合研究和完整的Fc聚糖分析。

用于IgA1和IgA2m1以上铰链消化的冻干酶。与IdeS不同，Genovis提供的IgASAPSub1+2在铰链上方的一个特定位点消化人IgA1和IgA2m1，产生完整且均匀的Fab和Fc片段。由于人IgA1的铰链比IgA2的铰链长，因此IgA1和IgA2m1之间来自消化位点的氨基酸C末端不同。IgASAPSub1+2可消化分泌物和血清IgA。孵育时间为过夜（16-18小时），并且由于酶的特异性，没有过度消化的风险。该酶在pH值为6.0至8.0时具有活性，不需要还原条件或辅助因子即可产生活性。活性为37°C。IgASAPSub1+2是从丹毒梭菌克隆而来的，并在大肠杆菌中表达。该酶含有His标签，分子量为131kDa。IgASAPSub1+2冻干剂以冻干粉的形式提供，装在1000个单位的小瓶中，用于消化1mgIgA1和IgA2m1。孵育时间为过夜（16-18小时），并且由于酶的特异性，没有过度消化的风险。

Genovis的FabRICATOR MagIC自动样品制备可用于分析和监测不同的CQA。mAb在生产或储存过程中的氧化就是这样一种CQA，可能会影响zhiliao产品的质量。为了展示FabRICATOR MagIC如何解决这个问题，对6种mAb的混合物进行强制降解（室温下3个月），并通过反相LC-MS进行分析。当在完整水平上分析mAb时，可以检测到mAb5丰度的显着差异，同时出现许多新的峰。然而，无法获得可靠的质量数据。使用FabRICATOR MagIC，mAb5变化的来源在Fab区域内。随后还原为 Fc/2、LC 和 Fd' 片段，可以识别差异是由于 mAb5 Fd' 片段上的色氨酸氧化，通过形成氧代内酯 （+14 Da） 和二氧代内酯 （+30 Da） 以及 mAb5 LC （-18 Da） 的琥珀酰亚胺化来揭示。此外，还可检测到mAb3轻链的异构化。该示例说明了FabRICATOR MagIC在mAb中级分析中的强大功能，它创建的片段足够小，可以精确定位特定的修饰，而无需耗时耗费资源的肽图分析，所有这些都以相对较少的手动操作时间快速完成。GingisKHAN用于LC-MS表征基于抗体的生物药研究。山西FabRICATOR ZIdeS蛋白酶抗体酶切

Genovis的IgASAP 是 IgA 消化酶家族。IgASAP Sub1 是一种 IgA1 特异性酶。广东GlySERIASIdeS蛋白酶蛋白组学

与肽图谱相比，根据Genovis科学家的经验，尤其是对于像抗体这样的分子，许多人在常规实验中做了太多的肽图谱，而中级水平（Middle-level）的方法可以很好地工作。中级方法（IdeS酶切抗体）需要更少的实际操作步骤和较少的示例处理，所有这些都意味着过程中出错的事情更少。我们的许多酶可以作为平台方法，同样的方法适用于绝大多数的抗体，这不是肽图的情况下，可能需要优化整个样品制备，LC分离，质谱设置和数据分析的每个不同的抗体分析。这些变化可能是很小的，但没有一种适用于所有肽图的方法。由于分析和数据分析的简单性，中级方法非常适合自动化和高通量的工作流程。肽图当然可以自动用于样品制备，但高通量肽图生成大量数据，仍然需要彻底分析。事实上，肽图谱是一个多步骤的过程，每一个步骤都可能破坏方法，并可能导致破坏蛋白质的人工制品，很难交叉训练给非专业人员。中级水平的方法很容易交叉训练，我们的方法在质量控制实验室中被成功地使用。肽图谱是一种用于修饰分析和氨基酸确认的方法，但一旦完成了这一工作，我相信使用中级分析可以成功地更有效地完成抗体样本的大部分工作。广东GlySERIASIdeS蛋白酶蛋白组学