为了证明Genovis的PNGase F冻干和PNGase F固定在各种底物上的去糖基化能力,用PNGase F冻干或PNGase F固定化处理了一系列糖蛋白。使用天然反应条件在一小时内有效去除曲妥珠单抗和依那西普上的所有N-糖,以及西妥昔单抗上的Fc-糖。当加入RapiGest™并在变性条件下进行反应时,西妥昔单抗的所有N-聚糖(包括Fab-聚糖)在PNGase F固定化10分钟内完全去除,PNGase F固定化15分钟内完全去除。在变性反应条件下,PNGase F 在 30 分钟内成功将更复杂的 F 融合蛋白阿巴西普和阿柏西普去糖基化。使用变性和还原反应条件,将常用的糖蛋白标准品RNase B在10或15分钟内完全去糖基化,分别使用PNGase F冻干或PNGase F固定化。在天然和变性条件下生成的去糖基化样品与LC-MS分析兼容。瑞典生物技术公司Genovis率先次提供IdeS工具酶等,用于mAb、ADC药物的开发、生产和质量控制。吉林PNGaseF去糖基化酶
生成携带 O-糖的糖肽,该酶可实现 O-糖谱分析、O-糖肽图谱和位点占用测定,以及使用 MS 分析的中级方法。1.可靠O-聚糖特异性蛋白酶 – 消化丝氨酸/苏氨酸糖基化位点的 N 末端;2.稳健的消化,增强复杂生物制药的表征;3.高特异性 - 可靠的聚糖位点测定和定位。Genovis的OpeRATOR 是一种 O-聚糖特异性蛋白酶,可消化携带he心1 O-聚糖的蛋白质,糖基化(he心 1)Ser 和 Thr 残基的 N 端。OpeRATOR 来源于 Akkermansia muciniphila,并以 E 表达。大肠杆菌。该酶含有 His 标签,分子量为 42 kDa。SialEXO 来源于 Akkermansia muciniphila,并以 E 表达。大肠杆菌。SialEXO Lyophilized 中的酶也含有 His 标签,这些组分的分子量分别为 43 kDa 和 66 kDa。用于消化粘蛋白型O-糖蛋白和肽的冻干酶。Genovis的OpeRATOR 冻干剂以冻干粉末的形式提供,装在 2000 个单位的小瓶中,用于消化 2 mg O-糖基化蛋白。福建PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究SialEXO酶来源于Akkermansia muciniphila,并在大肠杆菌中表达。
用于水解离心柱中糖蛋白上的N-聚糖的固定化酶。 Genovis的PNGase F 固定化微离心柱含有与琼脂糖珠共价偶联的 PNGase F 酶,用于在样品中酶峰减少的糖蛋白上水解 N-糖。 将糖蛋白样品与PNGase F一起在离心柱中固定,然后通过离心步骤轻松收集去糖基化的蛋白质。由于空间位阻,PNGase F对某些糖蛋白的活性可能缓慢或受到抑制 - 在这些情况下可能需要更长的孵育时间或糖蛋白变性。 Microspin 色谱柱可用于水解 5 或 10 x 0.2 mg 糖蛋白。1. 易于使用的离心柱;2. 提高酶与底物的比例,提高消化效率;3.z终样品中的酶峰减少。
Genovis的ImpaRATOR™ 和 OpeRATOR® - 两种协同的作用:O-糖蛋白酶。使用ImpaRATOR或OpeRATOR消化后分析依那西普重糖基化区域O-聚糖位点的覆盖率(图3)。使用OpeRATOR鉴定对应于所有13个O-聚糖位点的肽,而使用ImpaRATOR只能明确鉴定10个位点。ImpaRATOR 可能比 OpeRATOR (1) 具有更具选择性的氨基酸序列偏好,此处由 S186 和 T245 位点缺乏消化来表明。此外,ImpaRATOR 在两个相邻的 O-糖基化氨基酸之间显示出有限的裂解,如 S213 位点酶解肽的缺乏以及 T200 和 T217 位点酶解肽的低强度所证明的那样。在OpeRATOR酶解样品(T184-S199和T200-H204;图2b和d),而在ImpaRATOR消化的样品中,具有漏裂的相应肽(S184-H204)的强度更高。 虽然OpeRATOR显示出更高的O-聚糖位点覆盖率,但使用ImpaRATOR进行消化可以表征O-聚糖结构,包括唾液酸化物种。例如,条形图插入显示了两种糖肽 T184-V198 和 T205-P207 的 O-聚糖种类。这应该与使用OpeRATOR的消化进行比较,在OpeRATOR中,必须去除唾液酸才能产生酶活性,这意味着有关唾液酸化的信息丢失。总而言之,ImpaRATOR 和 OpeRATOR 酶共同提供了有关聚糖组成和 O-聚糖位点的完整信息。依那西普是一种 Fc 融合蛋白,具有高度 O-糖基化的铰链区域。
用于糖蛋白去唾液酸化的冻干酶混合物。Genovis的SialEXO 冻干剂以冻干粉的形式提供,装在 2000 个单位的小瓶中,用于 2 mg 糖蛋白的去唾液酸化。1. 用于方法开发的灵活格式;2. 可以结合酶以提高效率;3. 适用于自动化工作流程;4. 即用型 - 只需加水即可。用于水解ɑ2-3-连接唾液酸的冻干酶。 Genovis的SialEXO 2-3冻干剂以冻干粉末的形式提供,装在500个单位的小瓶中,用于0.5mg糖蛋白的去唾液酸化。 与唾液酸酶混合物 SialEXO 相比,SialEXO 2-3 是一种 α2-3 特异性唾液酸酶,允许对 α2-3 连接的唾液酸进行靶向分析。O-和N-糖基化蛋白的高效α2-3去唾液酸化可以在1小时内实现。使用OpeRATOR图谱O-聚糖位点对依那西普进行LC-MS分析。吉林PNGaseF去糖基化酶
SialEXO和GalactEXO截断O-聚糖后,应用GalNAcEXO酶去除剩余的GalNAc残基。吉林PNGaseF去糖基化酶
我们展示了使用两种蛋白作为底物的OmniGLYZOR的性能。依那西普是一种 Fc 融合蛋白,含有 TNFα 受体的胞外结构域。该结构域用 2 个 N-糖和 8-11 个 1 个具有不同程度唾液酸化的 O-聚糖修饰。在 37°C 下将这种重糖基化蛋白在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小时,可完全去除所有 N-和 O-糖,如中级 LC-MS 分析所示。促红xibao生成素 (EPO) 是一种携带 3 个 N-聚糖和 1 个he心 1 个 O-聚糖的小蛋白质,其总质量的近 40% 由聚糖组成。O-连接聚糖通常存在于蛋白质的暴露位置,因为它们在蛋白质折叠发生后附着。只有负责其合成的糖基转移酶才能接触到这些暴露的位点。吉林PNGaseF去糖基化酶
Genovis的SialEXO Immobilized是一种微离心柱,用于在室温下孵育30分钟后完全...
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