ImpaRATOR 是一种 O-聚糖依赖性蛋白酶，可催化糖蛋白和糖肽中与糖基化丝氨酸或苏氨酸残基相邻的肽键的水解。它切割用粘蛋白型O-聚糖修饰的丝氨酸或苏氨酸残基的N-末端，包括唾液酸化物种。粘蛋白型O-聚糖是ImpaRAT活性所必需的，该酶不会消化未修饰的丝氨酸或苏氨酸残基，也不会在糖蛋白的N-糖基化位点。该酶接受 O-聚糖结构，包括唾液酸化he心 1 和he心 2 结构以及 Tn 抗原。Genovis的ImpaRATOR 来源于铜绿假单胞菌，在大肠杆菌中表达。该酶含有 His 标签，分子量为 97 kDa。GlycOCATCH的应用包括O糖蛋白和肽的特异性富集或去除、糖组学、复杂样品的研究和生物制药的表征。云南高活性/无非特异酶活PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究
我们展示了使用两种蛋白作为底物的OmniGLYZOR的性能。依那西普是一种 Fc 融合蛋白，含有 TNFα 受体的胞外结构域。该结构域用 2 个 N-糖和 8-11 个 1 个具有不同程度唾液酸化的 O-聚糖修饰。在 37°C 下将这种重糖基化蛋白在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小时，可完全去除所有 N-和 O-糖，如中级 LC-MS 分析所示。促红xibao生成素 （EPO） 是一种携带 3 个 N-聚糖和 1 个he心 1 个 O-聚糖的小蛋白质，其总质量的近 40% 由聚糖组成。O-连接聚糖通常存在于蛋白质的暴露位置，因为它们在蛋白质折叠发生后附着。只有负责其合成的糖基转移酶才能接触到这些暴露的位点。山西N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶因此，其水解需要底物蛋白以与酶活性相容的方式变性。
水解O-聚糖的酶不会从变性中获益，这就是为什么OmniGLYZOR色谱柱只能在天然条件下使用的原因。 OmniGLYZOR 试剂盒 Microspin 以含有足够材料的试剂盒形式提供，可使5 × 50-100 μg 或 10 × 50-100 μg 糖蛋白去糖酸化。N-和O-连接聚糖的快速高效；与LC-MS兼容；完全去除聚糖，改进基础蛋白的分析；固定形式可提高酶与底物的比率，从而实现快速去糖基化。 IgdE酶(FabALACTICA®)和PNGaseF酶分别购自Genovis(马萨诸塞州，美国)。用于水解糖蛋白上N-聚糖的冻干酶。Genovis的PNGase F 冻干剂以冻干粉的形式提供，装在 1000 或 5 x 1000 单位小瓶中，分别用于消化 1 mg 或 5 x 1 mg 糖蛋白。
Genovis的SialEXO Immobilized是一种微离心柱，用于在室温下孵育30分钟后完全去除0.5mg天然糖蛋白上的唾液酸。为了研究依那西普的潜在电荷变体，开发了一种使用SialEXO固定化柱对糖蛋白进行去唾液酸化的一般工作流程。毛细管电泳通常用于在生物制剂的表征和质量控制过程中确定电荷变体。使用SialEXO Imfixedized对糖蛋白进行去唾液酸化，并使用ProteinSimple的Maurice在成像等电聚焦中进行分析。综合起来，该分析工作流程改进了糖蛋白的分离并实现了电荷异构体分析。依那西普，如果不首先去除唾液酸，将很难分析，但使用SialEXO固定化分离峰可以获得。OmniGLYZOR 含有固定化酶的混合物，可快速有效地去除抗体；
与PNGase F类似，Genvois的OmniGLYZOR 水解 N-和粘蛋白型 O-聚糖：糖基化往往是异质的，这使得对高度糖基化的生物zhiliao药物的分析具有挑战性。完整质量数的确认以及其他产品质量属性的表征受到不同糖型复杂性的阻碍，这就是为什么有效的聚糖去除工具简化了此类分析的原因。 虽然 N-聚糖包含一个共同的结构，并且可以通过 PNGase F 整体去除，但粘蛋白型 O-聚糖在结构上更加多样化，具有多个不同的he心。OmniGLYZOR含有固定化酶的混合物，能够依次分解O-聚糖，以完全去除最常见的O-聚糖结构（二唾液酸和单唾液酸基he心1和Tn抗原）。而用其他岩藻糖酶处理部分去除岩藻糖或根本没有去除。云南高活性/无非特异酶活PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究
GlycOCATCH亲和纯化以方便的离心柱形式提供，包含4 个 GlycOCATCH。云南高活性/无非特异酶活PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究
为了研究 OglyZOR 对天然糖蛋白的活性，将该酶与依那西普、TNFR 和阿巴西普在 37°C 下有或没有 SialEXO 孵育 1 小时。当唾液酸被去除时，OglyZOR酶有效地水解了所有三种底物中的O-聚糖。Genovis的OglyZOR 酶可有效水解天然糖蛋白中的he心 1 二糖 （Gal-β1,3-GalNAc）。这使得这些酶适合在LC-MS分析之前制备样品，以鉴定其他PTM或确认氨基酸序列O-糖基化生物制药的全去糖基化：O-糖基化生物制药（如依那西普）很难表征。为了能够通过质谱法测定完整质量数，我们进行了酶促总去糖基化。N-聚糖被Genovis的PNGase F裂解，而O-聚糖可以与OglyZOR和SialEXO一起去除。。云南高活性/无非特异酶活PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究
Genovis的PNGase F Automation 含有以自动化友好的 96 孔板形式冻干的 P...
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