一直以来，病毒基因组测序都是疾病诊断、流行病学调查和宿主-病原关系研究的重要手段。病毒的全基因组测序以及对应的生物信息学分析方法是研究病毒进化、毒力因子变异、疫病爆发之间的关系、疫病传播途径、不同遗传变异的分布模式、疫病发生地理区域的基础。与传统Sanger测序相比，NGS技术的发展使得一个小的研究小组可以拥有大量病毒株的全基因组序列，测序成本也在逐步降低。由于NGS产生的数据量非常庞大，其序列拼接难度也随之增加。而且对于低浓度高复杂度的样本，研究者除了PCR外别无他法。而PCR方法往往具有偏好性，丢失的片段将为序列组装带来非常高的失败率。对于完全未知的样本，无法通过PCR进行富集，要鉴定其种类需要调用各种方法，逐个尝试，工作量之大，其效率之低，使得一个新的研究方法的出现及其必要。一般是用密集的sanger测序监测某几个关键基因，搭载一定频率的全基因组测序。**标本全序列测序要多久
高通量测序技术又称“下一代“测序技术或深度测序技术，可以一次性对几十万至几百万条DNA分子进行序列测定。现已普遍应用在基因组测序、基因表达分析、非编码小分子RNA鉴定、转录因子靶基因筛选及DNA甲基化等相关的研究领域。高通量测序技术是对传统测序一次**性的改变，一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定，因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变，同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能，所以又被称为深度测序(deep sequencing)。深圳全基因组检测上哪找探普生物是专门为病毒研究者服务的。
深度测序技术对社会的影响：深度测序技术促进了基因检测的普及，对社会的影响第1个方面反映在商业模式的变化，即医学检验和健康管理方面的平民化、个性化趋势的形成。社会生活受到深度测序技术影响的第二个方面是基因测序的普遍应用。例如，基因关联将人与人通过遗传学关联起来，人们可以对基因进行分析判定亲缘关系，基因测定甚至可以帮助判定婚姻（包括遗传病等方面的）匹配度。公安机关可以通过基因比对，锁定犯罪嫌疑人、寻找丢散的儿童和亲人。甚至有报道表明，测定20多个基因就可以将人脸重构。基因检测的应用将随着基因-表型的关联得到更普遍的应用，对社会生活的方方面面起到重要作用。
RNA/DNA病毒测序:对病毒基因组进行测序是快速了解病毒突变、毒力变化、病毒型别的有效方法。可以根据病毒基因组大小和类型，采用PCR、RT-PCR或shotgun测序法，对病毒的部分或全长基因组测序，结果准确可靠。服务标准:测出的序列准确性在99%以上;病毒全基因组测序测出序列在总基因组大小95%以上;***数小于5个;Shotgun测序的覆盖度在6×以上;PCR和RT-PCR测序达到2×。服务说明：1、提供病毒DNA或RNA作为样品。2、PCR测序的DNA样品总量大于5 μg，浓度大于20 ng/μl。DNA无降解。3、Shotgun测序法的DNA样品总量大于20 μg，浓度大于100 ng/μl。DNA无降解。4、用RT-PCR和PCR测序法在提供参考序列时需同时提交样品部分序列与参考序列的比对文件，确保同源性在95%以上。需要对病毒的全基因组进行测序以后，结合其他上下游的研究数据，达到研究或者监测疫病的目的。
高通量测序技术在的鉴定中发挥了重要作用，先通过该技术确认了该病原为以前未知的 β 冠状病毒，其次确认了该病毒与蝙蝠相关冠状病毒ZC45和ZXC21密切相关，同源性约为88%，后高通量测序为后续的诊断提供了强有力的技术支撑。高通量测序能否定向检测细菌病毒等微生物？例如某人有皮肤病，提取组织，能否通过高通量测序来检测后列出所有的致病菌。或者当怀疑的时候，在人体组织中检测是否有某种特定的细菌或者病毒。（不求原理），就是想知道现在的测序技术能否替代传统临床检验方法。相比传统培养等方法，对样本的全微生物检测，或者特定微生物检测，基因测序技术目前的时间消耗，准确率，和金钱成本大概如何。可以定向检测，用特异引物就可以。病毒株往往都需要获得尽量完整的基因组序列来指导下一步的研究。**标本全序列测序要多久
传统Sanger测序相比，NGS技术的发展使得一个小的研究小组可以拥有大量病毒株的全基因组序列。**标本全序列测序要多久
近年来，第二代测序技术(next gene -ration sequencing, NGS)发展迅猛，与 Sanger 测序技术相比, NGS 是一种能一次对几十万到几百万的DNA 分子进行序列测定的高通量的测序技术, 这种高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌地分析成为可能, 因此又被称为深度测序(deep sequencing). 相比传统的个体基因组测序, NGS 使得测序价格日益廉价, 并且在生物信息学软件的辅助下, 可以将大量不同基因片段的信息连接起来进行基因组组装, 完成生物的基因组测序，这种新的测序技术革新了植物病毒的诊断方法, 对于病毒的流行病学和生态学研究起到了非常重要的推动作用。**标本全序列测序要多久
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