Quant-seq表达谱文库构建试剂盒:Quantseq在低质量RNA中的表现:Quantseq在高质量和低质量(FFPE)样本中有很好的相关性:用同一来源的不同质量RNA样本进行比较,评估Quantseq适用于高度降解的样本(如FFPE样本)的能力。将人的MOLP-8**细胞系分成两份,一份进行新鲜冷冻,一份处理成FFPE样本,从而使同一个来源的样本得到不同质量的RNA。用RIN值(RNA完整度)来区分RNA的质量。RIN值大于8表示RNA质量高。对应严重降解的样本,RIN值不适用于质量的评估,因此使用DV200值(大于200nt的RN**段的分布值)来表示RNA质量。低完整度的RNA对应低DV200值。RNA提取后,FFPE样本的DV200值为87%(RIN值),冷冻样本RIN值为。使用50ng总RNA,用QuantSeqFWD试剂盒进行文库构建。FFPE样本提取的RNA,即使DV200值低至23%(数据未显示)仍能成功构建Quantseq文库。FFPE样本有对应的低质量RNA建库操作流程,对应冷冻样本,应用标准操作流程。文库在Hiseq2500上进行用1x50bp读长测序。FFPE-RNA文库和冷冻保存RNA文库的基因表达的相关性很高(R²=),表示Quantseq能在不同质量的RNA中表现稳定。 Lexogen试剂盒的优点有很多。广东胶提取Lexogen试剂盒活动
SIRVs-Spike-InRNA质控标准品:SIRV-Set2:SIRV-Set2:等摩尔isoformMixE0。它非常适合于成本敏感的应用和RNA-Seq实验,这些实验只需对复杂的isoform混合物进行检测,而不需要很深的测序深度来覆盖不同浓度转录本。SIRV-Set2非常适用于一致性的计算,因为实验的指纹图谱*依赖于SIRVisoform的复杂性而非浓度差异。SIRV-Set3:该组包含MixE0和ERCCMix,二者各占50%。69个SIRVisoform转录本和92个无重叠的ERCCRNA的混合物满足了参入(Spike-in)RNA质控品的复杂性需求,可兼顾isoform的高度复杂性和宽浓度范围的试验特性。可对整个RNA测序工作流程进行更***的质量评估和监测,并获得技术细节以及用于比较**样本和实验间的指纹图谱。单一的isoformERCC转录本覆盖6个数量级的浓度,辅以等摩尔浓度的SIRVisoform。 陕西ployARNA选择Lexogen试剂盒活动您知道云生物的Lexogen试剂盒系列都有哪些吗?
ploy(A)RNA选择试剂盒:LexogenPoly(A)RNA选择试剂盒可以快速、高度特异性富集来自总RNA样品的多腺苷酸化RNA,从而有效地去除通常不太感兴趣的高丰度细胞质核糖体RNA(rRNA)。适用于各种RNA分析需求,例如RNA-seq。产品优势:高度特异性富集来自总RNA样品的多腺苷酸化RNA(>97%蛋白编码RNA);灵活的RNA投入量(500ng-100μg的总RNA投入量);对于CORALL,input量可以低至1ng-1μg;Poly(A)RNA纯化比较高可达500μg(100x5μg)或1,000μg总RNA(10x100μg);自动化友好的操作流程—基于磁珠纯化流程;快速—手动操作时间只需20min;洗脱的或与磁珠结合的Poly(A)RNA可与下游各种应用无缝衔接。工作流程:总RNA变性后,mRNA3'端的poly(A)会与磁珠上的oligo(dT)进行杂交。通过清洗,将没有poly(A)结构的RNA(例如rRNA、tRNA)去除掉。从磁珠上洗脱下来的mRNA(含polyA结构)可用于下游的各种应用,例如cDNA文库构建,RT-PCR,以及总RNA-seq。同样,结合在磁珠上的mRNA也可以直接用于下游的应用(如一链的合成)。Poly(A)RNA选择试剂盒可以与CORALLTotalRNA-Seq文库构建试剂盒结合使用。性能表现:Poly(A)RNA选择试剂盒可以高效特异的对含poly(A)RNA进行富集。
CORALLTotalRNA-seq文库构建试剂盒CORALL试剂盒:可以在(UMIs)以及链特异性(>99%)的RNA文库构建。Lexogen专有的链置换终止和连接技术,无需片段化,可提供完整的转录表达信息,包括转录的起始和终止位点信息。产品优势:完整覆盖转录本信息,从起始到终止位点信息,用于全转录组分析;整合UMIs,准确反映转录本信息;出色的链特异性(>99%)操作流程;低起始量(1ng-1μg),兼容mRNA捕获及核糖体去除建库;适用低起始量或低质量的FFPE样本;自动化友好。工作流程:CORALL文库构建基于特有的链置换终止和连接技术,首先置换终止引物(DSP,包含P7序列)3’端可随机结合到RNA模板上,然后进行反转录延伸,当延伸到下一个DSP时,延伸终止,因此文库构建过程不需要进行片段化。插入片段的大小取决于两个结合到模板RNA上DSP的距离。此外,这种终止可阻止伪第二链的合成,保持出色的链特异性。寡核苷酸连接序列可以与**链cDN**段的3’端进行高效的连接,同时引入P5序列和单分子标签(UMIs)。通过PCR进行第二链的合成和双链cDNA扩增,同时把i7和i5(可选)端index以及簇生成所需的完整接头序列引入到文库中。所有的核酸纯化都使用磁珠,操作流程高度匹配自动化。 云生物主营产品很多,其中Lexogen试剂盒销量很好。
Quanteqpool样品barcode3‘mRNA-seq文库构建试剂盒:QuantSeq-Pool加快基因表达项目研究。LexogenQuantSeq-Pool结合了早期样本barcode标记和3'mRNA-Seq的所有的优点(图1)。因此,QuantSeq-Pool极大地增加了混样的能力,并且高度精简的流程减少了手动操作时间、耗材和测序的费用。通量灵活,适用于大规模的通量项目。在文库扩增步骤中,可通过在文库的i5和i7位置引入额外的UDIindex,以获得更高的通量。稳定的基因检测性能,即使非常浅的测序深度。高通量筛选项目需要在较低的测序深度也可获得稳定且可靠的基因表达谱。QuantSeq-Pool可以可靠地检测到7500至9000个高表达基因,每个样本测序深度为100K至1M。这种高灵敏度在8个重复中是一致的,这归功于早期pooling和批处理减少技术误差。因此,在更低或相同成本下,可增加更多的重复样本以获得更加可信的异基因表达。 对于不同的需求我们选择不同的Lexogen试剂盒系列。上海链合成Lexogen试剂盒价格
上海Lexogen试剂盒代理哪家好?广东胶提取Lexogen试剂盒活动
SLAMseq代谢标记试剂盒:SLAMseq试剂盒从S4U标记条件的优化到进行S4U标记动力学实验,以及后续的RNA提取和烷基化,SLAMseq试剂盒为RNA代谢测序实验提供了一个完整的解决方案。产品应用:测定RNA合成及降解速率用S4U标记小鼠胚胎干细胞,随后抽提出总RNA,烷基化,用QuantSeq3’mRNA试剂盒进行文库构建和测序。首先,用S4U标记mESCs24小时,然后用未标记的尿苷进行冲洗和尿苷终止反应(U终止反应)。测序数据用SLAMDUNK软件进行分析,测定整个转录组的RNA周转率。转录因子HES1具有高的周转速率(RNA合成与降解速率高),而对于管家基因NDUFA7,它的周转速率较低。 广东胶提取Lexogen试剂盒活动