企业商机
小基因组测序基本参数
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  • 可靠性检测
  • 服务内容
  • 小基因组测序
  • 所在地
  • 上海
  • 检测类型
  • 建库测序
小基因组测序企业商机

技术优势:

1. 业内**的mtDNA&cpDNA富集抽提服务:自主研发的细胞器基因组富集提取技术,高效实现高质量细胞器基因组富集。

2. 一对一的生物信息分析,人工基因注释矫正:告别在线注释平台的偏差,满足NCBI数据库上传要求,高质量结果交付,助力高水平研究。

3. **技术团队负责人均9年以上从业经验,项目经验丰富,提供可以个性化方案定制。

4. 已完成叶绿体&线粒体基因组项目数百例,96%以上样本实现完成图水平交付。

5. 配套数据库构建服务,提升科研水准,助力高水平研究发表。 云生物自主研发的细胞器基因组富集提取技术。云南系统进化小基因组测序多少钱

    InDel检测及注释:InDel是DNA序列的插入(Insertion)和缺失(Deletion)现象的总称,狭义的InDel表示1~10bp的短InDel。在基因组编码区域,InDel的发生可能会引起移码突变、氨基酸改变、假基因的出现等等现象。这里分析的是狭义的InDel。利用LASTZ软件将样品和参考序列进行比对,检测得到初步InDel结果。然后取参考序列InDel位点上下游150bp与样品的测序reads用BWA软件及SAMtools进行比对验证,过滤得到可靠的InDel。SV检测:基因组结构变异(SV,StructuralVariation)通常是指基因组内DN**段缺失、插入、重复、倒位、异位。使用MUMmer软件对目标基因组和参考基因组进行比对,再使用LASTZ对区域间进行比对,从区域比对结果中查找SV。 上海系统进化小基因组测序报价云生物小基因组测序可进行测序组装。

    复旦大学脑科学研究院朱剑虹教授、基础医学院沙红英博士研究组与安徽医科大学曹云霞研究组合作,创新性进行极体基因组移植用于预防遗传线粒体疾病研究。该研究论文于2014年6月在国际刊物《细胞》上发表。论文**作者单位包括复旦大学医学神经生物学国家重点实验室、复旦大学附属华山医院神经外科、复旦大学脑科学研究院、基础医学院等,第二作者单位为安徽医科大学**附属医院妇产科生殖中心。我校上海医学院临床医学八年制医学生王天同学、沙红英博士及安徽医科大学纪冬梅医师为该论著的共同**作者,沙红英博士和朱剑虹教授为共同通讯作者,曹云霞教授和朱剑虹教授为共同***作者。该研究在国际上发表后获得高度评价。《自然》和《自然遗传学-综述》杂志分别发表题为《阻断遗传病变异传递》和《聚光灯下的线粒体置换技术》的文章,介绍中国的发明,并称“重要的是证明极体移植的可行性,并***提高了线粒体移植疗法的效率”。美国医学遗传学会**称该研究“为线粒体疾病干预提供新假设、新发现、新手段”。线粒体置换技术是当前国际生物医学的高科技前沿,我国遗传性线粒体疾病患者数量很大,该研究表明极体移植线粒体置换技术有潜在和重要的临床应用前景。。

基因组组装:首先,利用ABySS v2.0.2初步组装Illumina测序数据,然后利用blasR比对Pacbio三代数据,根据比对结果对单分子测序数据进行一次矫正与纠错,目的在于减少单分子长序列中单碱基、插入缺失的错误;***利用纠正过的单分子测序数据与二代数据进行混合组装,使用的软件是SPAdes-3.10.1;挑选覆盖深度足够高且组装长度较长的序列作为候选序列,比对NT库确认;***再次利用Illumina数据进行校验,得到**终的组装结果。基因组组分分析:通过多种方法对编码基因、非编码RNA等进行预测,获取测序样本基因组的组成情况。做小基因组测序技术服务找云生物。

在高等生物细胞内除了细胞核遗传外,细胞质遗传也是重要的研究方向。细胞质中主要的遗传物质的载体是线粒体和叶绿体。利用高通量测序技术对动植物线粒体基因组及植物叶绿体基因组进行测序组装,突破传统mt/cpDNA分离提纯的实验壁垒,可直接利用组织总DNA获得线粒体/叶绿体基因组,对序列信息进行深入解析,通过比较基因组分析获得物种分类、系统进化、地理谱系遗传等信息。云生物自主研发的Enrichment富集技术,可降低核DNA污染,将总DNA中靶细胞器基因组比例提升。专业生物信息团队,提供人工基因注释矫正,满足NCBI数据库上传要求,高质量结果交付,助力高水平研究。小基因组测序多种系列供您选择。广东小基因组测序小基因组测序报价

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叶绿体基因组 | “**”遗传资源开发新模式:叶绿体基因组结构和特征:三个样品的完整叶绿体基因组基本信息,包含由LSC(87,496-87,604bp)和SSC(18,222-18,342bp)区域分开的两个IR拷贝(25,507-25,519bp)。编码相同的131个基因组,其中113个是独特的,18个在IR区域中重复。113个独特的基因包含79个蛋白质编码基因,30个tRNA基因和4个rRNA基因。14个含有一个内含子(6个tRNA基因和8个蛋白质编码基因),3个含有两个内含子(rps12,clpP,ycf3)。 rps12基因的5'-末端外显子位于LSC区域,基因的内含子和3'-末端外显子位于IR区域。云南系统进化小基因组测序多少钱

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