与复旦大学问附属**医院合作,开发人血液外泌体中RNA的数据库(exoRBase),目前已经稳定运行三年,**个血液外泌体RNA自有数据库,形成区域数据中心,集本院所数据搜集、全球数据检索上传、文献引用、二次分析模块滚动开发、药物及治疗方案革新的重要平台;数据库***期建设同时发表于NucleicAcidsResearch,关联影响因子10分以上文章3篇,且在不断增加中。微生物分析平台:BSL-3实验室致病***原微生物数据分析平台,根据实验室现有数据,建立本地化数据自动化、智能化分析平台,加速实验室数据分析速度与产出。**全转录组研究:与南京鼓楼医院合作,对其测定的乳腺*组织RNA-seq样本进行***重新分析(原有基础分析无法获得有效靶点),并联系**对其原始科研方案进行修改,同时进行大规模数据挖掘,弥补其有效样本不足问题(两期分析,共入组800余例深度测序样本);通过分析,获得8个全新的与乳腺*转移复发相关的LncRNA和cicleRNA候选靶点;我方联系第三方公司与医院实验室同时进行平行双盲有效性验证,通过260例实际人体样本检测,8个靶点在98%的样本中与预测结果完全一致,且平行实验结果完全吻合。 云生物外泌体的售后服务很好。江苏血液样本抽提外泌体要多少钱
细胞上清(需采用去除外泌体的培养基):
(1) 细胞在正常含有血清的培养基中培养一定时间,贴壁细胞密度在70 %-80 %,悬浮细胞密度在60 %-70 %;
(2) 对于贴壁细胞,去除原有培养基,换为新的不含外泌体的培养基或者无血清培养基;对于悬浮细胞,300 g,4°C,10 min收集细胞;
(3) 使用不含外泌体的培养基或者无血清培养基悬浮细胞并继续培养。细胞继续培养24-48 小时,根据细胞的生长速度确定收取上清时间;
(4) 收集细胞上清,300 g,4°C,离心10 min;小心吸取上清,注意避免吸入细胞或者细胞碎片;
(5) 3000 g,4°C,再次离心15 min,确保将细胞或者细胞碎片去除干净;
(6) 取上清,注意避免吸入细胞或者细胞碎片,合并相同的细胞培养液上清样品,装入无菌的玻璃瓶,可在4°C短期保存(1-2天),长期保存可冻存于-80°C 。建议细胞上清分离后尽快进行外泌体分离,保存在4°C和-80°C,都会对产量有一定的影响。
安徽样本制备外泌体活动外泌体数据库有哪些?分离:超速离心法:超速离心法是外泌体分离**常见的技术之一。据不完全统计,约有1/2的研究者会选择该种方式分离外泌体。该方法由几个离心步骤组成,可分步去除细胞、细胞碎片和大囊泡,沉淀外泌体。但该种方法用于血浆和血清等粘性生物液体时效率较低,且重复离心操作有可能对外泌体造成损害,从而降低其质量。如将超速离心配合蔗糖溶液进行梯度密度离心可得到纯度更高的外泌体,是公认可以得到**高纯度的分离方法。但此法对离心时间非常敏感,一般需要8-30h,产率较低,同样不适用于血浆和血清等粘性生物液体中外泌体的分离,因此难以***普及。聚合物沉淀法:第二大主流的外泌体分离技术就是基于聚合物的沉淀法了,**常见的聚合物是聚乙二醇(PEG)。通常将含有聚合物的沉淀溶液与生物体液混合,4℃温育,低速离心,沉淀外泌体。目前已有成熟的PEG-base商业试剂盒,比如图中的ExoQuick™(SystemBiosciences)。这类试剂盒使用容易和快速,不需要额外的设备,且随着产品不断更新换代,提取效率和纯化效果逐渐提高,因而逐渐取代超速离心法并推广开来。沉淀法的主要缺点是分离物中会有少量的聚合物存在。不过大家不用担心,一般来说这些物质不会干扰下游分析。
胸水:
(1) 临床收集胸水后若不能**时间处理,请于4℃临时保存(不得超过8 h);
(2) 将收集到的胸水1000 g离心10 min,收集上清液;
(3) 将得到的胸水上清3000 g离心10 min,收集上清;
(4) -80℃冰箱中保存。
腹水:
(1) 临床收集腹水后若不能**时间处理,请于4℃临时保存(不得超过8 h);
(2) 将采集到的腹水在4℃下(室温亦可)离心2000 g,20 min,去除腹水中的残渣;
(3) -80℃冰箱中保存。
胆汁:(1) 用无菌容器收集胆汁;
(2) 将收集到的胆汁在4℃下,3000 g离心10 min去除细胞沉渣和碎片;
(3) 收集胆汁上清液,4℃或者-20℃长期保存。
众所周知,成熟的miRNA可以与装配蛋白(assemblyproteins)相互作用,形成一个复合物,称miRISC。miRISC的主要成分包括miRNA、可被miRNA***的mRNA、GW182和AGO2。人类AGO2蛋白,主要结合miRNA5’末端的U或A碱基,能介导mRNA和miRNA结合,介导后续的翻译***或mRNA分子降解。**近研究发现AGO2蛋白和外泌体miRNA分拣机制之间有一种可能的联系。对外泌体蛋白进行分析时,用质谱MS或WBD都有发现AGO2蛋白的存在。Guduric-Fuchsetal.发现敲除了AGO2基因后,会减少那些偏好于进入外泌体的miRNA的类型或丰度,如HEK293T细胞系来源的外泌体中的miR-451,miR-150和miR-142-3p。还有些证据也支持miRISC和外泌体miRNA分拣之间的联系。首先,miRISC的主要成分被发现与MVB(多囊泡小体)有相同定位;其次,阻碍MVB被溶酶体降解会导致miRISC的过度累积,而阻断MVB形成会导致miRISC的丢失;再次,细胞***时出现的miRNA***靶序列水平的变化可能引起外泌体miRNA的分拣。总之,某些miRNA中的特异序列可能指导它们整合入外泌体,而有些酶或其他蛋白质可能也能控制外泌体miRNA的分拣--以一种不依赖于miRNA序列的形式。 想要做外泌体?您要先了解外泌体的特点。上海数据库外泌体活动
外泌体抽提是什么试剂盒?江苏血液样本抽提外泌体要多少钱
目前,外泌体研究主要集中在以下几个方向:开发疾病诊断和预后标志物揭示疾病发病机制作为药物载体,实现靶向给药作为疾病***的靶点参与免疫反应调控。外泌体蛋白质组学服务:云生物根据主流外泌体研究策略,开发了一套完整的外泌体蛋白质组学研究技术服务体系。提供从外泌体收集、鉴定到蛋白质组定性定量、数据分析一系列的技术服务项目,确保外泌体研究在同样技术标准下获得高质量研究数据。外泌体收集:对于外泌体研究,分离和收**格的外泌体是非常关键的一步。目前对于外泌体收集有:超速离心、密度梯度离心、超滤、磁珠免疫、聚合物沉淀与试剂盒提取法等几种主要方法,各种方法均存在不同优缺点。云生物在现有试剂盒法的基础上进行大量技术优化,形成了一套针对不同样品的外泌体提取试剂盒和配套收集方法。可以在提高外泌体收集丰度的同时,***减少杂蛋白残留,以保证蛋白质组分析阶段获得的数据更加稳定和可靠。 江苏血液样本抽提外泌体要多少钱