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Lexogen试剂盒基本参数
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  • 云生物,Lexogen
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  • 齐全
Lexogen试剂盒企业商机

    Quanteqpool样品barcode3‘mRNA-seq文库构建试剂盒3’mRNA-Seq是基因表达谱分析的强有力工具。3’mRNA-Seq方法生成的NGS文库插入片段为多聚腺苷酸RNAs的3端,无需事先进行poly(A)富集处理(表1)。表1丨常规mRNA-Seq和QuantSeq3'mRNA-Seq基因表达谱分析方案比较。由于3'mRNA-seq每个转录本只产生一个文库片段,比对到给定基因的reads与其表达量成正比。3'mRNA-Seq不依赖于正确的异构体(isoform)注释和鉴定来确定确切基因表达值。此外,3'mRNA-Seq对RNA质量的差异不敏感。另一方面,传统的mRNA-seq需要高质量的RNA来富集mRNA,且对更长的转录本有偏好性,因为这些转录本产生更多的片段。因此,无论转录本长度如何,3'mRNA-Seq为基因表达谱提供了一个可靠且经济的解决方案1。 云生物主做Lexogen试剂盒的批发销售。山东磁珠纯化模块Lexogen试剂盒代理

Quanteq pool样品barcode 3‘ mRNA-seq文库构建试剂盒:产品优势:对于筛查项目是高性价比的基因表达分析方法批量处理,省时、省力、省成本可从几个样本到36,864个样本的批量处理。简介:迄今为止,基因表达谱分析是RNA-Seq在生物医学研究和诊断中**常用的应用。传统的基因表达项目使用mRNA测序技术,可以对全长转录本进行单核苷水平的***解析,但对样品处理数量有限,成本高。尽管测序的价格在持续下降,样品制备、测序和数据处理仍然是限制高通量筛选的主要成本。




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SLAMseq代谢标记试剂盒SLAM-ITseq: 确定哺乳动物体内特定组织和细胞类型的基因表达。对于该应用,将4-硫尿嘧啶(4-Thiouracil,不是LAMseq中的S4U)注射到转基因生物体中,例如*在特定细胞类型中表达尿嘧啶磷酸核糖基转移酶(UPRT)的小鼠中,新合成RNA*在该细胞类型中被标记,然后提取纯化RNA,***进行标准SLAMseq分析。可根据RNA -seq数据中碱基的转换信息,对体内特定组织和细胞类型的基因表达进行定量(Matsushima et al.,2018)。 SLAMseq合成代谢动力学试剂盒模块包含SLAM-ITseq所需的组分(4-Thiouracil除外),同时SLAMdunk软件与SLAM -ITseq数据兼容,可对其进行分析。

    Quanteqpool样品barcode3‘mRNA-seq文库构建试剂盒QuantSeq-Pool加快基因表达项目研究。LexogenQuantSeq-Pool结合了早期样本barcode标记和3'mRNA-Seq的所有的优点(图1)。因此,QuantSeq-Pool极大地增加了混样的能力,并且高度精简的流程减少了手动操作时间、耗材和测序的费用。通量灵活,适用于大规模的通量项目。在文库扩增步骤中,可通过在文库的i5和i7位置引入额外的UDIindex,以获得更高的通量。稳定的基因检测性能,即使非常浅的测序深度。高通量筛选项目需要在较低的测序深度也可获得稳定且可靠的基因表达谱。QuantSeq-Pool可以可靠地检测到7500至9000个高表达基因,每个样本测序深度为100K至1M。这种高灵敏度在8个重复中是一致的,这归功于早期pooling和批处理减少技术误差。因此,在更低或相同成本下,可增加更多的重复样本以获得更加可信的异基因表达。 云生物专业Lexogen试剂盒厂家。

    SIRVs-Spike-InRNA质控标准品设计模块化概念:Spike-InRNA对照质控品有两个模块,即isoform模块和ERCC模块,每个模块用于特定的研究场景。Isoform模块SIRVisoform模块以“**浓缩”方式模拟转录组的复杂性,它包括来自7个人类模型基因的69个人工可变剪切转录本组成。该模块***反映了可变剪接、可变转录起始和终止位点、重叠基因和反义转录的变化。每个模型基因有6到18个可变转录本,isoform的复杂性非常高,可以对RNASeq工作流程进行深入的探测1。为不同转录本的注释流程提供了正确的以及(示例性的)不充分和过度的注释2。SIRVisoform模块有三种,MixE0(所有的SIRV转录本等摩尔比例混合),E1(不同转录本拷贝数之间差异可高达8倍),E2(不同转录本拷贝数之间的差异可高达128倍)。ERCC模块ExternalRNAControlsConsortium(ERCC),由92个人工转录本组成,且无重叠序列。由于其序列的独特性,在不考虑isoform的情况下,适用于技术参数的评估。ERCCMix1覆盖220(106)的动态范围,可解决整个表达谱转录本丰度的复杂性问题3,4。将指定和评估的reads与已知浓度进行比较,可以评估动态范围、响应剂量、检测下限和工作流程的有效性。 Lexogen试剂盒的特点成为了一个重要因素。浙江Lexogen i7 6 nt Index SetLexogen试剂盒销售

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CORALLTotalRNA-seq文库构建试剂盒CORALL试剂盒:可以在(UMIs)以及链特异性(>99%)的RNA文库构建。Lexogen专有的链置换终止和连接技术,无需片段化,可提供完整的转录表达信息,包括转录的起始和终止位点信息。产品优势:完整覆盖转录本信息,从起始到终止位点信息,用于全转录组分析;整合UMIs,准确反映转录本信息;出色的链特异性(>99%)操作流程;低起始量(1ng-1μg),兼容mRNA捕获及核糖体去除建库;适用低起始量或低质量的FFPE样本;自动化友好。工作流程:CORALL文库构建基于特有的链置换终止和连接技术,首先置换终止引物(DSP,包含P7序列)3’端可随机结合到RNA模板上,然后进行反转录延伸,当延伸到下一个DSP时,延伸终止,因此文库构建过程不需要进行片段化。插入片段的大小取决于两个结合到模板RNA上DSP的距离。此外,这种终止可阻止伪第二链的合成,保持出色的链特异性。寡核苷酸连接序列可以与**链cDN**段的3’端进行高效的连接,同时引入P5序列和单分子标签(UMIs)。通过PCR进行第二链的合成和双链cDNA扩增,同时把i7和i5(可选)端index以及簇生成所需的完整接头序列引入到文库中。所有的核酸纯化都使用磁珠,操作流程高度匹配自动化。 山东磁珠纯化模块Lexogen试剂盒代理

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