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Lexogen试剂盒基本参数
  • 品牌
  • 云生物,Lexogen
  • 型号
  • 齐全
Lexogen试剂盒企业商机

    Quanteqpool样品barcode3‘mRNA-seq文库构建试剂盒3’mRNA-Seq是基因表达谱分析的强有力工具。3’mRNA-Seq方法生成的NGS文库插入片段为多聚腺苷酸RNAs的3端,无需事先进行poly(A)富集处理(表1)。表1丨常规mRNA-Seq和QuantSeq3'mRNA-Seq基因表达谱分析方案比较。由于3'mRNA-seq每个转录本只产生一个文库片段,比对到给定基因的reads与其表达量成正比。3'mRNA-Seq不依赖于正确的异构体(isoform)注释和鉴定来确定确切基因表达值。此外,3'mRNA-Seq对RNA质量的差异不敏感。另一方面,传统的mRNA-seq需要高质量的RNA来富集mRNA,且对更长的转录本有偏好性,因为这些转录本产生更多的片段。因此,无论转录本长度如何,3'mRNA-Seq为基因表达谱提供了一个可靠且经济的解决方案1。 Lexogen试剂盒的优点有很多。湖北Small RNA文库构建试剂盒Lexogen试剂盒多少钱

    SLAM-ITseq:确定哺乳动物体内特定组织和细胞类型的基因表达:对于该应用,将4-Thiouracil(不是SLAMseq中的S4U)注射到转基因生物体中,例如*在特定细胞类型中表达尿嘧啶磷酸核糖基转移酶(UPRT)的小鼠中,新合成RNA*在该细胞类型中被标记,然后提取纯化RNA,***进行标准SLAMseq分析。可根据RNAseq数据中碱基的转换信息,对体内特定组织和细胞类型的基因表达进行定量(Matsushimaetal.,2018)。SLAMseq合成代谢动力学试剂盒模块包含SLAM-ITseq所需的组分(4-Thiouracil除外),同时SLAMdunk软件与SLAM-ITseq数据兼容,可对其进行分析。 山东单细胞建库Lexogen试剂盒哪家好云生物主做Lexogen试剂盒的批发销售。

Lexogen i5 6 nt UDI Add-on Kits (5001-5096):Lexogen 6碱基i5双Index Add-on试剂盒提供4个(5001-5004)或96个(5001-5096) Unique i5 index,与QuantSeq和CORALL Library Prep Kits兼容。96个 i5和96个i7 Indix结合使用,可实现多达9,216种不同的i5 / i7 index组合,从而 实现完全灵活的双端**的index。

货号产品描述规格047.4x24Lexogen i5 6 nt Dual Indexing Add-on Kit (5001-5004), 24 rxn/Index4x24

047.4x96Lexogen i5 6 nt Dual Indexing Add-on Kit (5001-5004), 96 rxn/Index4x96

047.96Lexogen i5 6 nt Unique Dual Indexing Add-on Kit (5001-5096), 1rx/Index96

    Quantseq有非常高的灵敏度。测序量在reads时,RNA完整性好的新鲜冷冻样本中检测到25,842个基因(数据未显示)。当单个样本测序数据量在,在新鲜冷冻样本中检测出20,081个基因,且每个基因只少有1个read;相应的,在FFPE样本中能检测到15,190个,两者有24%的差异()。但是,当阈值提高到5或者10个reads/基因时,差异分别下降至3%和1%。此对比数据表示Quantseq可在冷冻样本和FFPE样本中准确检测基因表达。两者之间在低表达基因检测存在的差异,是由于FFPE样本在处理、储存及回收过程中低拷贝转录本很容易降解至无法检测到。Quantseq用oligo(dT)引物进行逆转录,每个转录本只产生1个片段。这样能够使得无论RNA的质量如何(包含FFPE样本)都可准确定量。标准的mRNA-seq操作流程旨在覆盖整个转录本,但是在使用降解样本时将导致严重的3’偏好性。因此,相对于其他用Poly(A)分选mRNA操作流程,Quantseq3’mRNA-Seq更有效的对低质量的样本进行建库。 使用Lexogen试剂盒的好处您了解多少呢?

ploy(A)RNA选择试剂盒:LexogenPoly(A)RNA选择试剂盒可以快速、高度特异性富集来自总RNA样品的多腺苷酸化RNA,从而有效地去除通常不太感兴趣的高丰度细胞质核糖体RNA(rRNA)。适用于各种RNA分析需求,例如RNA-seq。产品优势:高度特异性富集来自总RNA样品的多腺苷酸化RNA(>97%蛋白编码RNA);灵活的RNA投入量(500ng-100μg的总RNA投入量);对于CORALL,input量可以低至1ng-1μg;Poly(A)RNA纯化比较高可达500μg(100x5μg)或1,000μg总RNA(10x100μg);自动化友好的操作流程—基于磁珠纯化流程;快速—手动操作时间只需20min;洗脱的或与磁珠结合的Poly(A)RNA可与下游各种应用无缝衔接。工作流程:总RNA变性后,mRNA3'端的poly(A)会与磁珠上的oligo(dT)进行杂交。通过清洗,将没有poly(A)结构的RNA(例如rRNA、tRNA)去除掉。从磁珠上洗脱下来的mRNA(含polyA结构)可用于下游的各种应用,例如cDNA文库构建,RT-PCR,以及总RNA-seq。同样,结合在磁珠上的mRNA也可以直接用于下游的应用(如一链的合成)。Poly(A)RNA选择试剂盒可以与CORALLTotalRNA-Seq文库构建试剂盒结合使用。性能表现:Poly(A)RNA选择试剂盒可以高效特异的对含poly(A)RNA进行富集。 对于不同的需求我们选择不同的Lexogen试剂盒系列。浙江QuantSeq-Flex链合成模块Lexogen试剂盒销售

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    SIRVs-Spike-InRNA质控标准品SIRV-Set2:SIRV-Set2:等摩尔isoformMixE0。它非常适合于成本敏感的应用和RNA-Seq实验,这些实验只需对复杂的isoform混合物进行检测,而不需要很深的测序深度来覆盖不同浓度转录本。SIRV-Set2非常适用于一致性的计算,因为实验的指纹图谱*依赖于SIRVisoform的复杂性而非浓度差异。SIRV-Set3:该组包含MixE0和ERCCMix,二者各占50%。69个SIRVisoform转录本和92个无重叠的ERCCRNA的混合物满足了参入(Spike-in)RNA质控品的复杂性需求,可兼顾isoform的高度复杂性和宽浓度范围的试验特性。可对整个RNA测序工作流程进行更***的质量评估和监测,并获得技术细节以及用于比较**样本和实验间的指纹图谱。单一的isoformERCC转录本覆盖6个数量级的浓度,辅以等摩尔浓度的SIRVisoform。 湖北Small RNA文库构建试剂盒Lexogen试剂盒多少钱

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