SIRVs-Spike-InRNA质控标准品:SIRV-Sets三套SIRV,每一套含有不同的SIRVMix或者Mix组合,满足不用的用途()。Table1|SIRV选择指南。SIRV-Set1(货号)包含Isoform模块的MixesE0、E1和E2;SIRV-Set2(货号and)*含IsoformMixE0;而SIRV-Set3(货号)包含SIRVIsoformMixE0和ERCCs.✔:**可用,:**不可用,部分可用(部分Set可用)。SIRV-Set1:SIRV-Set1含有3种不同的“isoform模块”:E0、E1和E2,每种混合物含有所有69种SIRVisoform转录本(来自7个SIRV基因),但浓度比例不同。在特定的RNA测序工作流程下,E0是评估isoform检测能力的理想选择,因为所有69种转录本都以等摩尔浓度存在,它们不作为测序深度的评估选择。E1中包含中等浓度的给定基因的各种转录本;E2**了一种自然的状态,1个基因的一种转录本占主要丰度(转录本可达17种isoform),其他低表达量的转录本小于1%。E2不*可以校正短读长的转录本检测,而且还可以对长读长或者限制读长的测序平台进行线性和灵敏度评测。 Lexogen试剂盒的优缺点您知道吗?江苏rRNA去除Lexogen试剂盒销售
Quanteqpool样品barcode3‘mRNA-seq文库构建试剂盒:QuantSeq-Pool加快基因表达项目研究。LexogenQuantSeq-Pool结合了早期样本barcode标记和3'mRNA-Seq的所有的优点(图1)。因此,QuantSeq-Pool极大地增加了混样的能力,并且高度精简的流程减少了手动操作时间、耗材和测序的费用。通量灵活,适用于大规模的通量项目。在文库扩增步骤中,可通过在文库的i5和i7位置引入额外的UDIindex,以获得更高的通量。稳定的基因检测性能,即使非常浅的测序深度。高通量筛选项目需要在较低的测序深度也可获得稳定且可靠的基因表达谱。QuantSeq-Pool可以可靠地检测到7500至9000个高表达基因,每个样本测序深度为100K至1M。这种高灵敏度在8个重复中是一致的,这归功于早期pooling和批处理减少技术误差。因此,在更低或相同成本下,可增加更多的重复样本以获得更加可信的异基因表达。 湖北链合成Lexogen试剂盒销售云生物Lexogen试剂盒的售后服务很好。
Lexogen是一个为NGS技术提供创新性解决方案的生物公司。公司的主要专注于RNA测序技术的开发,以解决转录组的复杂性。Lexogen于2007年成立,在2013年发布了***款商业化产品。公司总部位于奥地利维也纳,北美办事处设在美国新罕布什尔州。SLAMseq Metabolic RNA Labeling Kit:通过区分新合成和已存在的RNA来分析RNA合成和降解;与Quantseq联合使用,在控制基因表达方面获取新的见解。SPLIT RNA Extraction Kit:不需要DNase,高产量,高效回收,***适用于各种分物种;可从同一个样本中纯化总RNA或小片段或大片段RNA;同样适用于血液RNA提取。QuantSeq3’mRNA-Seq Library PrepKits、QuantSeq-Flex Targeted RNA-Seq Library PrepKit:低成本基因表达谱分析-适用于低起始量,低质量以及血液样本。
Quant-seq表达谱文库构建试剂盒:建库流程:QuantSeq 表达谱建库试剂盒通过oligo dT引物特异逆转录poly(A)尾3’mRNA,第二链使用随机引物进行合成。由于插入片段的大小是由第二链合成引物和poly(A)尾之间的距离决定的,因此无需额外进行 RN**段化。随后的PCR可以提供9,216个不同的i5/i7index组合用于Illumina平台,48个index 用于Ion Torrent平台。能够实现更多样本混样测序。Lexogen提供两个版本的Illumina Quantseq 表达谱建库试剂盒,不同处在于Illumina接头序列的位置。下图绿色的是Read 1的序列,蓝色的是Read 2的序列。QuantSeq Forward (FWD) 在第二链合成的引物中包含Read 1 序列。因此,测序的方向是朝向poly(A)尾的方向。推荐使用这种方法进行基因表达的分析。如果研究关注的是转录的3’端序列或者双端测序策略,推荐使用QuantSeq Reverse (REV),Read 1 接头序列由oligo(dT)引物引入。买Lexogen试剂盒就找云生物!
Mix2 RNA-Seq 数据分析软件:Mix2 (Mix-Square)通过RNA-Seq数据中的位置覆盖偏差,来准确计算出基因isoform的丰度。使用Mix2进行isoform定量是可重复跨变量条件的,并可准确检测差异表达。
优势:
l 准确评估转录本浓度;
l 不同测序设备、文库制备和各种降解类型RNA,丰度评测的结果都可重复;
l 准确检测差异表达;
l 可以对RNA测序中的数据偏差类型进行检测并归类;
l 运算速度超快,且占用内存小。
工作原理:RNA测序中isoform定量的准确性和重复性,受RNA测序数据中的片段偏差的影响。Mix2没有对覆盖偏差做出任何假设,而是将混合模型与每个基因的isoform数据进行拟合。因此,Mix2可以准确地表现5'偏差,而Cufflinks软件**于均匀分布。 云生物就带您了解一下Lexogen试剂盒的特点。北京磁珠纯化模块Lexogen试剂盒活动云生物作为上海一家专业的Lexogen试剂盒厂家。江苏rRNA去除Lexogen试剂盒销售
SIRVs-Spike-InRNA质控标准品:作为强有力的转录组分析工具,RNA测序已经被应用到众多研究项目中,并且很有希望将其应用范围进一步扩展到诊断与***领域中。为保证分析的有效性,实验室测试必须提供可重复性和稳定性俱佳的精细信息。Makers和质控品是**可以准确无误的判定实验可靠性的方式。Lexogen公司研发的SIRVs可以评估转录组测序实验的质量和数据可比性。产品优势:通用的标准品,用于比较分析和监控整个RNA测序实验;验证RNA测序流程,发现测序错误的来源和偏差,改善RNA测序从建库到数据分析的整个流程;兼容所有的测序平台,各种生物来源的RNA,甚至单细胞水平的RNA;通过综合设计,*****isoform和转录组丰度的复杂性;提供三套不同的标准品(SIRV1,2,3),适用于复杂的isoform表达分析以及简单的样品之间的比较。工作流程:Spike-InRNAVariant(SIRV)对照质控品是人工转录本,*****了转录组的复杂性,实验过程中将其掺入样品(匀浆组织/细胞或纯化的RNA)中,标准品的数据量占总reads数的1-2%。通过SIRV的数据分析,可以评估RNA测序过程的精度和准确性,以确定每个处理样本的技术噪音。然后根据质量评测和偏差系数来计算实验之间的一致性。 江苏rRNA去除Lexogen试剂盒销售