2000 年, M Manzano 等利用温度梯度凝胶电泳的方法 分析 16S rRNA 对分离自食物中的利斯特氏菌进行了鉴定。 2001 年, HJ Monstein 等利用温度梯度凝胶 电泳和 PCR 扩增 16S rRNA 的 V6 区 ( 可变区) 片段的方法对 16 株肠球菌进行了鉴定。2001 年, 沈永才等利用 16S rRNA 的 PCR 法鉴定了 8 株 双歧杆菌, 并用 16S rRNA 荧光定量 PCR 法对双 歧杆菌进行了定量检测。2002 年, A Manero 等对 利用 16S rRNA 探针杂交的方法鉴定肠球菌属细 菌进行综述。2002 年, Y Woo- PatrickC 等通过 16S rRNA 序列分析的方法, 从一位菌血症胆囊 炎患者体内检测到了唾液乳杆菌的存在。2003 年, Y Seto 等对 16S rRNA 序列特定长度片段进 行 分 析 , 对 人 体 粪 便 样 品 中 嗜 酸 乳 杆 菌 ( Lactobacillus acidophilus) 的分布情况进行了检 测。2003 年, JR Byun 等利用分析 16S rRNA 和 23S rRNA 间区序列的方法对一株鼠李糖乳杆菌 ( Lactobacillus rhamnosus ATCC 53103) 进行了鉴 定, 并与干酪乳杆菌( L. casei) 、嗜酸乳杆菌( L. acidophilus) 和瑞氏乳杆菌( L. helveticus) 的 16S rRNA 和 23S rRNA 间区片段进行了比较。上海融享生物科技有限公司主营测序很多，其中16s 销很好。江西16S测序机构哪家好
１６Ｓ～２３ＳｒＲＮＡ 基因间区结构特点及序列分析的基本
原理 １６Ｓ～２３ＳｒＲＮＡ 区 间ＩＳＲ 是 位 于 １６ＳｒＲＮＡ 基 因 与
２３ＳｒＲＮＡ 基因之间的 区 间 序 列，不仅序列长度存在差异，而
且序列中间有ｔＲＮＡ 的插入、缺失、突变等特征。经研究发现，
大多数 革 兰 阳 性 菌 含 有ｔＲＮＡａｌａ、ｔＲＮＡｉｌｅ，少 部 分 只 含 ｔＲ－
ＮＡｇｌｕ基因。相比而言，大部分革兰阴性菌不含ｔＲＮＡ 基 因，
少部分只含ｔＲＮＡａｌａ或ｔＲＮＡｉｌｅ，或者两者兼有。另外不同的
细菌可能含有不同的ｒＲＮＡ 操 纵 子 数 目。所有这些序列长度
差异和ｔＲＮＡ 基因数目的变异为微生物菌的鉴定分型提供了
依据。研 究 证 实 １６Ｓ～２３ＳｒＲＮＡ 区 间 的 进 化 率 要 高 于 １６Ｓ
ｒＲＮＡ 基因１０ 倍，它 比 １６ＳｒＲＮＡ 有更多的变异区。 江西16S测序机构哪家好16s 18S ITS 的多种测序总有一款是您满意。
在过去的 10 年中，NGS 技术被用于探
索各种生态系统中微生物群落的多样性和组成
结构，诸如全球气候变化及微生物响应、生
物地理分布[10-11]、海洋生态系统[12]、农业生态系
统、生物降解及修复、野生动物及人体
共生微生物[等各个领域。随着高通量测序技术
的不断发展和参考数据库的不断更新，利用核糖
体操纵子作为 DNA 标记可以揭示不同生态系统
中的微生物多样性和组成。然而，针对不同环
境样本的引物选择和实验过程仍然需要更细致的验证。
原核生物(细菌、古菌) rRNA 按核酸的沉降系
数分为 3 种，分别为 5S、16S 和 23S。16S rRNA 是
核糖体 RNA 的一个亚基，16S rRNA 基因就是编码
该亚基的基因。其存在于所有细菌染色体基因组
中，参与生物蛋白质的合成过程，并在生物进化的
漫长历程中保持一定的遗传保守性，是细菌系统分
类研究中有用和常用的分子标记。16S rRNA
基因分子大小适中(长度约为 1540 bp)，在结构与功
能上又具有高度的保守性，检测方便并且与原核生
物的系统发育关联密切，因此逐渐成为常用的原
核生物标记基因。16S rRNA 编码基因序列共有
9 个保守区和 9 个高可变区，其中 V4−V6 区
数据库信息全、特异性好，是细菌多样性分析的常
用目标区域。
16s 18S ITS 的各种测序应用领域还是不一样的。
１６ＳｒＲＮＡ 基因序列分析的基本方法可将 ＰＣＲ产物克隆到质粒
载体上进行测序，与１６ＳｒＲＮＡ 数据库中的序列进行比较。目 前，大量已知 微 生 物 的 ＤＮＡ 都被测定并输入国际基因数据
库，成为对微生物鉴定分类非常有用的参照系统，从而可以通
过测定某种未知微生物１６ＳｒＤＮＡ 序列，与基因库中已有菌株
的１６ＳｒＤＮＡ 序列进行同源对比及分析，即可得出待测菌的菌
属类别，从而达到对其进行快速、有效的鉴定分类的目的。
Ｂｏｓｓｈａｒｄ等用１６ＳｒＲＮＡ 序列同源 性 大 于 等 于９５％至 大 于
等于９９％ 定 义 同 属 细 菌，用 大 于 等 于 ９９％ 定 义 同 种 细 菌。 上海融享生物科技有限专业16s 公司。云南真核微生物16S测序
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１６ＳｒＲＮＡ 基因序列分析的基本方法通过１６ＳｒＲＮＡ 种属特异性的探针与 ＰＣＲ 产 物 杂 交 以 获
得微生物组成信息，或利用基因芯片将 ＤＮＡ 片段制作成探针
固定在支持物上，与 荧 光 标 记 的 待 检 ＤＮＡ 片 段 杂 交，通 过 观
察荧光信号的位置，即可确定待检细菌的种类。杨祖钦等，根
据引起化脓性脑膜炎的常见致病菌，成 功 地 建 立 了 ＤＮＡ 芯 片，可对该疾病快速、准确的诊断，明确病原菌。
对扩增产物进行变性
梯度凝胶电泳、温度梯度凝胶电泳（ＴＧＧＥ）分 析，直 接 观 察 其
多样性。Ｇｏｌｄｅｎｂｅｒｇ等［１１］还在此基础上建立了变性高效
液相色谱（ＤＨＰＬＣ）技术，并成功的分析了大便中菌群的组成，
监测药物治疗前后肠道菌群的动态变化。
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