做RT-qPCR实验时，大家常常会遇到各种各样的问题，如扩增曲线异常，熔解曲线异常，复孔重复性差，Ct值偏大等，其中Ct值偏大可能是大家较容易遇到的问题。现在就给大家分享下，遇到Ct值偏大问题时该如何解决。RT-qPCR的Ct值偏大主要有两种情况，一种是所有基因Ct都偏大，另外一种是个别基因Ct偏大。所有基因Ct偏大：如果前期所做基因均已做过预实验，Ct值正常，而本次实验，所有基因扩增Ct值都偏大，那很可能是模板质量的原因，如发生了降解，浓度不纯等。可通过Nanodrop和琼脂糖凝胶电泳实验评估RNA的质量，包括浓度、纯度及完整度。的不同qPCR会有不同的优势。广西SYBRGreen法qPCR哪家好
稳定和精确的qPCR实验常和PCR效率有关。当靶基因相对于参考基因的mRNA浓度时PCR的效率特别重要。△△Cq法是基于单一参考基因的标准化当下流行确定不同浓度样本的差异性的方法。计算靶基因和参考基因Cq值(△Cq)的差异，直接比较不同样本△Cqs。扩增两个基因以比较这两个基因的效率。但是当下流行的方法不一定是较合适的，不过现在已开发替代的定量模型用于纠正扩增效率，还可以使用多个参考基因。PCR扩增效率必须建立校准曲线，因为这种校准提供了一个简单、快速以及可重复PCR效率、分析敏感性和实验的稳定性的平均指标。效率放大应当从l校准曲线的og线性部分的斜坡部分决定。具体而言PCR效率＝10-1/slop-1，初始模板浓度的对数(单独变量)是X轴，Cq(依赖变量)是Y轴。理论较大值为1.00(或100%)表示每个周期的产物量加倍。理想状态下PCR的估计平均效率的CIs或SEs服从校准曲线。广西SYBRGreen法qPCR哪家好一个好的qPCR项目需要具备哪些特点您知道吗？
LOD为检测到阳性样本比较低浓度为95%。换句话说，包含一组靶基因复制内LOD的浓度较多不超过5%失败反应。低拷贝PCRs是随机有限的，不可能出现LODs为3个拷贝/PCR。如果是多个反应，可通过数字PCR得到低浓度的准确定量。实际上浓度校准器可以通过检测有限的稀释，失败和成功反应的百分比符合Poisson分布。很多因素可以解释qPCR结果的变异，包括温度的差异可影响退炎和/或变性，浓度不同可由移液浓度错误引起，以及随机变异。qPCR精度的一般随着拷贝数减少而变化。理想状态是实验内变异(重复性)在图中应当表现为标准误，或者重复样本的在校准曲线作为CIs。CVs不能用作Cqs，但是可用于表达拷贝数或浓度的变化。这种技术上的变化应该有别于生物变异。生物复制可直接解决不同组或救治组之间的qPCR结果的统计学差异。诊断分析，报道不同部位和不同操作者之较批间精度(重复性)可能同样是必须的。
DNA样本：一般情况下DNA降解比较少，但是法医学评价外源性DNA降解是重要的，如恶劣环境犯罪或者大规模灾害，或者涉及失踪人员案件中，DNA化学结构可能出现降解。qPCR扩增片段大小可以帮助减少测定有关的问题，但是开发供DNA质量的定量检测方法可用于这种特殊用途。可能的抑制剂是更普遍可变因素，必须在发表中指出，没有抑制剂纯化的DNA可能会扭曲结果，比如病原体的检测和量化。虽然可以添加样本与阳性对照来检测抑制剂，但是不同的PCR反应可能会受抑制剂影响。因此比较好是常规使用核酸稀释来证明Cqs或拷贝数的减少是与预期结果一致的。上海融享生物科技有限专业qPCR公司。
qPCR是不是会做不好呢？即使是看了人家文献里的PCR方法，照搬了人家的引物，还是做得每次结果都不一样？其实具体原因有这么几个。首先，你基本上不太会用移液头。移液头特别是微量移液头，特别长期快速操作，也就是说弹簧没来得及恢复又进行下一步按压。极其容易导致……你的大拇指关节受损。好吧，这都是其次，关键是你的移液量可能都会有变化。所以，关爱拇指，吸取液体时，保持1-2秒，给弹簧一个缓冲。当然，在加模板的时候，提高模板加样量，也可以尽可能减少每次加样的误差。吸取液体的时候，需要把头插入凹液面底部，而不是插到凹液面的侧面。侧面比较容易产生气泡：当然，你会说，每次头都插很深，但是这样的话，就很容易在头上沾上液滴，在微量的模板加样时，很容易导致加样量的误差。上海融享生物科技有限公司实时荧光定量qPCR服务。湖南实时荧光qPCR
qPCR 是分子生物学中的常规实验。广西SYBRGreen法qPCR哪家好
其实没有一项生物学实验是 so easy 的，即便是看起来毫无难度的 qPCR 。但同样地，任何一项生物学实验都是有套路的，包括 qPCR ，就看你套路深不深。对于像病毒载量这样的定量实验来讲，标准曲线的质量起到决定性作用。R2值太低一般是由于稀释操作不够准确，或者加样操作误差太大；E值太低则可能是由于探针引物设计不够好，或者Ta值不合适；而E值太高则提示可能出现了非特异扩增或者PCR扩增受抑制的情况。根据qPCR的MIQE准则，合适的扩增效率E在95%～105%，这就是努力的方向。很多人会有疑问，为啥要千方百计的优化扩增效率呢？扩增效率的提高可以提升qPCR检测体系的灵敏度、动态范围，减少非特异性产物的产生；数据的重复性及可信度也会得到提高；Tm值优化是提高扩增效率特别直接特别简单的方法，只需要一台具有温度梯度功能的qPCR设备即可，时间上还用不了半天。广西SYBRGreen法qPCR哪家好
