由于真核微生物的核糖体 DNA 是由核糖体基
因及与之相邻的间隔区(ITS)组成，使扩增
ITS1 的正向引物落在 18S 亚基上，扩增 ITS1 的反
向引物和扩增 ITS2 的正向引物落在 5.8S，而扩增
ITS2 的反向引物则是落在 28S 亚基上。然而目前并
没有一个较为准确完整的数据库能够提供从 18S 至
28S 全长序列。因此，我们用 ITSx Extractor 从专门
针对 ITS 序列的数据库 Unite 中分别筛选出的
ITS1、ITS2 和 ITS 全长序列，并构建了 3 个新的
数据库。其中，ITS1 数据库的筛选条件为：包含 ITS1
基因，且 ITS1 基因前、IT1 基因后序列长度>100 bp；
ITS2 数据库的筛选条件为：包含 ITS2 基因，且 ITS2
基因前、ITS2 基因后序列长度>100 bp；ITS 基因全
长序列数据库的筛选条件为：序列包含 ITS1 基因，
ITS2 基因、且 ITS1 基因前、ITS1 基因与 ITS2 基
因间隔、ITS2 基因后序列长度>100 bp。 上海融享生物科技有限公司主营测序包括16s 18S ITS 价格优惠。古细菌16S测序机构电话
１６ＳｒＲＮＡ 基因结构特点及序列分析的基本原理 １６Ｓ
ｒＤＮＡ 基因是细菌染色体上编码１６ＳｒＲＮＡ 相对应的 ＤＮＡ 序 列，其可变区与恒定区序列交错排列。恒定区在各种细菌中基
本保持不变，而可变区因不同细菌，不同科、种、属而异，且变异
程度与细菌的系 统 发 育 密 切 相 关。相 比 之 下，５ＳｒＲＮＡ 虽 易
分析，但核苷酸少，没有足够的遗传信息用于分类研究；而２３Ｓ
ｒＲＮＡ 含有的核苷酸数几乎是 １６ＳｒＲＮＡ 的 ２倍，分 析 较 困
难，故以１６ＳｒＲＮＡ 作为研究对象较为理想。 重庆环境微生物16S测序上海融享生物科技有限公司主营测序包括ITS价格优惠。
P Kaufmann 等用 16S rRNA 探针杂交技术 和 PCR 技术定量鉴定了分离自食物中的 30 株双 歧杆菌。1997 年, D Mora 等利用套式 PCR 方法扩 增 16S rRNA 序列和一段 D- 乳酸脱氢酶基因, 对 乳酸片球菌( Pediococcus acidilactici) 和戊糖片球 菌( Pediococcus pentosaceus) 进行了鉴定。后来, P Parola 等( 1998 年) 又利用 16S rRNA 基因序列 分析技术从败血症患者术后区域成功地分离 出干酪乳杆菌。1998 年, T Matsuki 等利用 16S rRNA 序列分析快速鉴定了人肠道中的 46 株双 歧杆菌。1998 年, R Patel 等应用 16S rRNA 序列 分 析 将 一 株 鸡 肠 球 菌 鉴 定 到 种 。1999 年 , GW Tannock 等利用 16S- 23S rRNA 间区序列的比较 分析分别对分离自胃肠道、青贮饲料和酸奶中的 40 株乳杆菌进行了鉴定。2000 年, MJ Kullen 等 利用细菌 16S rRNA 的包括可变区 V1 和 V2 的 500bp 长度片段序列快速准确地从人肠道混合物 中鉴定出嗜酸乳杆菌。在 2000 年, 黄锡全等对一 株明串珠菌的 16S rRNA 基因序列进行分析, 并 与其它 21 株乳酸菌 16S rRNA 基因序列进行了 同 源 性 比 较 , 与 柠 檬 色 明 串 珠 菌 的 同 源 性 为 99%, 认为该菌株是一株柠檬色明串珠菌。
在细菌的系统分类学研究中有用的和常 用的分子钟是 rRNA, 其种类少、含量大(约占细菌 RNA 含量的 80%), 分子大小适中, 存在于所有的 生物中, 特别是其进化具有良好的时钟性质, 在结 构与功能上具有高度的保守性, 素有“细菌化石” 之称。rRNA 是细菌和真核细胞核糖体的基本组 成部分, 编码 rRNA 的基因是按 5′- 16S- 23S- 5S- 3′方式排列的, 由两个非编码的间隔区序列所分 开。16S rDNA、23S rDNA、5S rDNA 三部分组成 一个 RNA 操纵子, 这个操纵子作为一个单位进 行转录。转录后处理成为成熟的 16S、23S 和 5S rRNA。上海融享生物科技有限公司主做16s 的测序。
2000 年, M Manzano 等利用温度梯度凝胶电泳的方法 分析 16S rRNA 对分离自食物中的利斯特氏菌进行了鉴定。 2001 年, HJ Monstein 等利用温度梯度凝胶 电泳和 PCR 扩增 16S rRNA 的 V6 区 ( 可变区) 片段的方法对 16 株肠球菌进行了鉴定。2001 年, 沈永才等利用 16S rRNA 的 PCR 法鉴定了 8 株 双歧杆菌, 并用 16S rRNA 荧光定量 PCR 法对双 歧杆菌进行了定量检测。2002 年, A Manero 等对 利用 16S rRNA 探针杂交的方法鉴定肠球菌属细 菌进行综述。2002 年, Y Woo- PatrickC 等通过 16S rRNA 序列分析的方法, 从一位菌血症胆囊 炎患者体内检测到了唾液乳杆菌的存在。2003 年, Y Seto 等对 16S rRNA 序列特定长度片段进 行 分 析 , 对 人 体 粪 便 样 品 中 嗜 酸 乳 杆 菌 ( Lactobacillus acidophilus) 的分布情况进行了检 测。2003 年, JR Byun 等利用分析 16S rRNA 和 23S rRNA 间区序列的方法对一株鼠李糖乳杆菌 ( Lactobacillus rhamnosus ATCC 53103) 进行了鉴 定, 并与干酪乳杆菌( L. casei) 、嗜酸乳杆菌( L. acidophilus) 和瑞氏乳杆菌( L. helveticus) 的 16S rRNA 和 23S rRNA 间区片段进行了比较。上海融享生物科技有限公司专业ITS 公司。天津环境微生物16S测序哪里有
您知道上海融享生物科技有限公司的ITS 测序都有哪些吗？古细菌16S测序机构电话
下一代测序技术的迅速发展降低了微生
物多样性分析的检测成本和复杂程度。因此，选择
引物扩增标记基因就成为确定序列长度和覆盖范
围的关键。2010 年，地球微生物组计划(Earth
Microbiome Project，EMP)成立，慢慢建立起来自世
界各地生态系统的微生物多样性目录，以创建微
生物组样本数据库。基于此，微生物生态学家可以
控制分析方法的一致性，以促进全球微生物组的比
较。因此，EMP 提出了标准引物和实验方法，以保
证样本间的多样性比较的准确性。对于 16S rRNA
基因，EMP 推荐的标准引物是扩增 V4−V5 区的
515F/806R 引物对和扩增 V4−V6 区的 515F/926R 引
物对。16S rRNA 基因的 V4−V6 区特异性好、数据
库信息全，是细菌多样性分析注释的选择。 古细菌16S测序机构电话
