数字PCR通过在一定体积内稀释DNA分子,实现DNA分子计数,从而提供了高精度拷贝数的估算。数字PCR技术在突破PCR扩增效率限制的同时,结果也有很高的重现性。和传统PCR相比,数字PCR技术检测遗传稀有突变时具有更高的灵敏度,在对于低水平痕量DNA分析也有更可靠的结果。数字PCR具有高敏感度、***定量、高特异性、使用标本用量少等特点,可以为临床提供更客观、自动化程度更高的定量检测结果,而且较好的克服了**组织包埋标本DNA质量差、标本量有限等问题,目前已经被应用于多个研究领域,有望成为恶性**的诊断和监测的可靠工具。微反应单元体积越均一稳定、数量相对越多,定量的整体精度就越高。江苏PCR数字PCR共同合作
常规PCR和实时荧光PCR定量检测都需要已知拷贝数的标准DNA制定标准曲线,由于样品测定在各种条件上不会完全一致,会造成PCR扩增效率的差异,从而影响定量结果的准确性。而ddPCR不受标准曲线和扩增动力学影响,可以进行***定量。dPCR也有一些缺点,数字PCR系统成本高,通量有限、操作繁琐等不足。芯片式dPCR由于芯片加工成本高,系统复杂度高,使得商业化优势不是特别明显,特别是目前大多数分子诊断qPCR也能够很好的满足需求,dPCR增加的收益成本比并不算高。液滴式相对芯片式成本有所下降,但典型的液滴式dPCR液滴形成和PCR扩增和检测都分别在不同仪器中完成,增加了很多操作,也增加了系统的复杂性,从这点上看全自动荧光定量PCR做的更好。江苏荧光信号数字PCR经验丰富开发多靶点检测的多重数字PCR检测,可以通过多种荧光染料或标记技术来实现。
cdPCR主要以Fluidigm公司的BioMark HD系统以及Life Technology公司的QuantStudio 3D系统为**。Bio Mark系统采用微泵阀式芯片,以聚二甲基硅氧烷为芯片材料,主要依靠微流控通道与阀门的开闭进行原始体系分割,在芯片的反应仓进行PCR反应,然后通过类似于基因芯片的方法扫描每个通孔的荧光信号,进行目的序列含量的计算。QuantStudio 3D系统采用阵列微池式芯片,反应液由进样孔直接进入各微反应池。芯片式dPCR生成微滴体积均一,具有较高的稳定性,体系之间影响较小,但技术操作复杂,通量有限且实验成本较高。
1999年,Bert Vogelstein创造了“数字PCR”一词,文章正式报道于美国科学院院刊PNAS,并表明该技术可用于发现罕见的**突变。作者是美国**研究者、霍华德·休斯医学研究所研究员贝尔特·福格尔斯泰因(Bert Vogelstein)。目前dPCR主要有两种形式,芯片式和液滴式,但基本原理都是将大量稀释后的核酸溶液分散至芯片的微反应器或微滴中,每个反应器的核酸模板数少于或者等于1个。这样经过PCR循环之后,有一个核酸分子模板的反应器就会给出荧光信号,没有模板的反应器就没有荧光信号。根据相对比例和反应器的体积,就可以推算出原始溶液的核酸浓度。在扩增结束后对每个反应单元的荧光信号进行采集。
微生物(病毒、细菌等)的检测:疾病预防控制中心、出入境检验检疫局系统的实验室可以将基于TaqMan探针法的定量PCR体系无缝地转移到数字PCR上,从而满足该类实验室对于检测结果的要求:灵敏度更高、重复性更好、无需依赖标准曲线的***定量结果。其他应用:数字PCR还可以用于转基因成分的检测、移植排斥监控、肠道菌群分析以及药物基因组检测等领域。随着数字PCR荧光通道的增加和多指标检测的成熟,数字PCR将会进入更多应用领域,有力推动生命科学、医学诊断、检验检疫、农业等领域的快速发展。常见的300种人、小鼠和大鼠基因表达Assay均已在QIAcuity数字PCR平台上经过验证。江苏PCR数字PCR共同合作
肺*T790M突变-cfDNA动态监测。江苏PCR数字PCR共同合作
数字PCR即Digital PCR(dPCR),是一种核酸分子***定量技术。数字PCR是一种基于单分子快速PCR扩增,进行核酸拷贝数定量的一种方法。数字PCR( 也可称单分子PCR) 一般包括两部分内容,即PCR 扩增和荧光信号分析。在PCR 扩增阶段,与传统技术不同,数字PCR 一般需要将样品稀释到单分子水平,并平均分配到几十至几万个单元中进行反应。不同于qPCR对每个循环进行实时荧光测定的方法,数字PCR 技术是在扩增结束后对每个反应单元的荧光信号进行采集。***通过直接计数或泊松分布公式计算得到样品的原始浓度或含量。江苏PCR数字PCR共同合作