用下一代测序技术(next generation sequencing，NGS)测定
16S/18S/ITS 某个可变区的序列，可以反映环境样
品在细菌、、古菌等组成的微生物群落之间的
差异，对研究海洋、土壤、宿主等不同环境中的
微生物群落组成及动态变化有重要的指导作用，同
时也是系统发育和分类学研究中一种使用的方法。
ITS 的保守型表现为种内相对一致，种间差异较明
显，能够反映出种属间甚至菌株间的差异。此外，
ITS 序列片段较小(ITS1 和 ITS2 长度分别为 350 bp
和 400 bp 左右，但不同物种之间存在一定差异)，
易于分析。也就是说，ITS 具有更高的扩增和测序
成功率以及分类学分辨率，目前已被应用于真
菌不同种属的系统发育分析。 18S 的各种测序应用领域还是不一样的。山东环境微生物16S测序机构
１６ＳｒＲＮＡ 序列
分析技术的基本原理就是利用恒定区序列设计通用引物从微
生物样本中扩增出１６ＳｒＲＮＡ 的 基 因 片 段，通 过 克 隆 测 序、探
针杂交、酶切片段多态性分析或凝胶电泳等方 法获 得 １６Ｓ
ｒＲＮＡ 序列信息，再与１６ＳｒＲＮＡ 基因数据库中的序列数据或
其他数据进行同源对比及分析，从而鉴定样本中可能存在的病
原菌种类。目前绝大多数的研究都 是 先 将１６ＳｒＲＮＡ 反 转 录 为１６ＳｒＤＮＡ 再 进 行 进 一 步
的研究。也可以提取细菌总的 ＤＮＡ 之 后，利用细菌通用引物
对样品总 ＤＮＡ 中的１６ＳｒＲＮＡ 基因进行全长扩增，再对 ＰＣＲ
产物进行进一步研究。 北京细菌16S测序公司哪里有您知道上海融享生物科技有限公司的 18S ITS都有哪些吗？
真核生物80S核糖体中包含4种沉降系数不同的rRNA，其中，40S核糖体亚基(小亚基)中包含18S rRNA，而60S核糖体亚基(大亚基)中包含5S rRNA、5.8S rRNA和28S rRNA。即真核细胞核糖体中通常含28S、18S、5.8S和5S 四种rRNA;真核细胞中的18S rRNA是16S rRNA的同源RNA，其相对分子质量约为0.7 MDa，长度约为1900 nt。18S rRNA除了比16S rRNA稍长且多一些臂和环结构外，两者空间结构十分相似，在核糖体中起到的作用也基本相同。所以就酵母而言，鉴定酵母菌株本身是需要进行18s鉴定，之所以酵母中同时出现了真核和原核的rRNA沉降系数，可能是因为该株酵母中含有共生体(线粒体，质体)
ITS1 或 ITS2 究竟哪
个片段能更好地反映群落组成仍存有争议。
ITS1 通常比 ITS2 短，对物种分辨率低一些，但是
扩增和测序错误也低一些；ITS2 分辨率高，但是测
序的误差会增加 OTU 的数量。研究表明，在不同
的生态环境和群落复杂性下，ITS1 和 ITS2 测序结
果反映的群落组成既存在一致性，也存在差异性。
例如，在部分土壤和外生菌根群落研究中，
ITS1 和 ITS2 呈现出了相似的结果；而在部分土壤
和人类肠道群落研究，ITS1 和 ITS2 的结果则
存在差异。我们的结果表明，针对 ITS2 片段的
扩增引物覆盖度均高于针对 ITS1 片段的扩增引物。
总之，这些结果表明，群落结构研究所关注的
标记基因片段和引物选择尚未标准化。 16s 的主要特点都有哪些呢？
2004 年, HS Kwon 等通过对 16S- 23S rRNA 进行套式 PCR 的方法, 对多株乳杆菌进行了快速 鉴定。2004 年, S Altun 等利用 16S rRNA 序列分 析对分离自虹鳟鱼中的格氏乳球菌( Lactococcus garvieae) 进行了鉴定。2004 年, X Bonjoch 等利用 套式 PCR 法分析 16S rRNA 序列, 对粪便中污染 的双歧杆菌的来源进行了鉴定。由于 16SrRNA 序列的保守性和存在的普遍 性, 以及核酸序列本身的稳定性、序列分析的重现 性极高, 基于当今分析技术的改进, 应用 16S rRNA 作为分子指标, 可以实现快速、微量、准确 简便的对微生物进行分类鉴定。分子分类正是在 从研究的目的过渡到研究的手段。随着分子分类 的理论和方法的日趋成熟, 其已逐步成为微生物 资源调查和整理的一种强有力工具。上海融享生物科技有限公司主营测序包括16s 18S ITS 价格优惠。山东环境微生物16S测序机构
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