1. 原核细胞及真核细胞内共生体的70S核糖体中包含3种沉降系数不同的rRNA，其中30S核糖体亚基中包含16S rRNA，50S核糖体亚基中包含5S rRNA和23S rRNA。这3种rRNA在结构上有明显的不同。即原核生物中则含23S、16S和5S 三种rRNA。由于不同种的真细菌与古细菌间的16S rRNA基因(16S rDNA)是高度保守的，16S rRNA作为研究分类学和系统进化的分子受到很大重视，16S rRNA序列分析是当前对细菌进行分类学研究中较精确的一种技术。随着分子生物学的快速发展以及该技术在医学微生物研究中的应用，对16S rRNA作为微生物分类依据的研究也逐渐发展起来并已得到认同。ITS 多种测序供您选择。江苏细菌16S测序实验
１６ＳｒＲＮＡ 序列
分析技术的基本原理就是利用恒定区序列设计通用引物从微
生物样本中扩增出１６ＳｒＲＮＡ 的 基 因 片 段，通 过 克 隆 测 序、探
针杂交、酶切片段多态性分析或凝胶电泳等方 法获 得 １６Ｓ
ｒＲＮＡ 序列信息，再与１６ＳｒＲＮＡ 基因数据库中的序列数据或
其他数据进行同源对比及分析，从而鉴定样本中可能存在的病
原菌种类。目前绝大多数的研究都 是 先 将１６ＳｒＲＮＡ 反 转 录 为１６ＳｒＤＮＡ 再 进 行 进 一 步
的研究。也可以提取细菌总的 ＤＮＡ 之 后，利用细菌通用引物
对样品总 ＤＮＡ 中的１６ＳｒＲＮＡ 基因进行全长扩增，再对 ＰＣＲ
产物进行进一步研究。 重庆环境微生物16S测序公司电话上海融享生物科技有限公司主营测序包括16s 18S ITS 价格优惠。
在真核微生物中，核糖体 DNA 是由核糖体基
因及与之相邻的间隔区组成，其基因组序列从 5′到 3′依次为：外部转录间隔区(external transcribed
spacer，ETS)、18S rRNA 基因、内部转录间隔区 1
(ITS1)、5.8S rRNA 基因、内部转录间隔区 2 (ITS2)、
28S rRNA 基因和基因间隔序列(intergenic spacer，
IGS) 。其中，18S rRNA 基因是编码真核生物
核糖体小亚基的 DNA 序列，其中既有保守区，也
有可变区(V1−V9)。与 16S rRNA 基因相似，保守区
反映了生物物种间的亲缘关系，而可变区则能体现
物种间的差异，适用于作为物种分类单元及系统发
育的分子标记。在中，相比于 rRNA 中的 18S、
5.8S 和 28S 的基因组序列，内转录间隔区 ITS1 和
ITS2 作为非编码区具有更高的丰富度和分辨率，承
受的选择压力较小，相对变化较大，并且能够提供
详尽的系统学分析所需要的可遗传性状。
１６Ｓ～２３ＳｒＲＮＡ 基因间区结构特点及序列分析的基本
原理 １６Ｓ～２３ＳｒＲＮＡ 区 间ＩＳＲ 是 位 于 １６ＳｒＲＮＡ 基 因 与
２３ＳｒＲＮＡ 基因之间的 区 间 序 列，不仅序列长度存在差异，而
且序列中间有ｔＲＮＡ 的插入、缺失、突变等特征。经研究发现，
大多数 革 兰 阳 性 菌 含 有ｔＲＮＡａｌａ、ｔＲＮＡｉｌｅ，少 部 分 只 含 ｔＲ－
ＮＡｇｌｕ基因。相比而言，大部分革兰阴性菌不含ｔＲＮＡ 基 因，
少部分只含ｔＲＮＡａｌａ或ｔＲＮＡｉｌｅ，或者两者兼有。另外不同的
细菌可能含有不同的ｒＲＮＡ 操 纵 子 数 目。所有这些序列长度
差异和ｔＲＮＡ 基因数目的变异为微生物菌的鉴定分型提供了
依据。研 究 证 实 １６Ｓ～２３ＳｒＲＮＡ 区 间 的 进 化 率 要 高 于 １６Ｓ
ｒＲＮＡ 基因１０ 倍，它 比 １６ＳｒＲＮＡ 有更多的变异区。 16s 18S ITS 的各种测序应用领域还是不一样的。
扩增子测序是对特定长度的PCR产物或捕获的片段进行测序，分析序列中的变异。通过检测目标区域的序列变异和丰度，以研究环境微生物多样性及群落组成差异。16S/18S rDNA为编码原/真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。ITS分为两个区域：ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之间，ITS2位于5.8S和28S之间。采用 Illumina测序平台，通量高，速度快，运行时间短，周期短。信息分析分析内容=标准分析+高级分析。基于测序得到的序列，进行 OUT聚类和物种注释分析，获得物种的丰度分布。研究样本中环境微生物多样性和群落结构差异性。对于不同的需求我们选择不同的16s。河南16S测序公司电话
18S 的不同测序会有不同的优势。江苏细菌16S测序实验
对于 ITS 基因扩增，由于整个 ITS 区域太长，
目前的第二代测序无法对其进行完全测序。因此，
我们捕捉的目的片段目前只针对 ITS1 或 ITS2 区
域，EMP 则是推荐了扩增 ITS1 基因的引物对
ITS1F/ITS2。由于这对引物是在物种中只有一
小部分分子变异已知的情况下设计的，因此在我们
的结果中其覆盖度并不高。在过去的研究中，这对
引物在担子菌等部分类群的扩增中有错配，甚
至不匹配的比例很高，因此当我们允许一个碱
基的错配时，这对引物对 Unite ITS1 数据库的覆盖
度可以提高一倍。 江苏细菌16S测序实验
