肺*的EGFR突变检测:EGFR突变目前已成为非小细胞肺*(Non-Small-Cell Lung Cancer,NSCLC)患者常规的伴随诊断,对于EGFR酪氨酸激酶抑制剂(TKI)的使用具有重要的指导作用。然而,由于多数NSCLC都处于晚期,很难取到足够的**组织完成该检测,不方便对患者的疗效和耐药情况进行动态监测。相反,血液、胸水以及脑脊液之类的体液标本中会含有**来源的DNA(Circulating tumor DNA,ctDNA),它们更容易获取,被认为是组织标本的有效替代品。由于体液标本中ctDNA的含量非常低,因此对检测方法提出了很高的要求。近年来,有研究者证实,数字PCR的检测敏感性可以低至0.04%,EGFR突变的血浆检测与组织学检测能够有很好的吻合性,相比于传统的检测方法,数字PCR可以***提高血浆中EGFR突变的检出率。此外,利用数字PCR***定量的优势,可以对血浆中EGFR突变的丰度进行动态监测,这种动态变化与患者使用TKI的疗效密切相关,可以更好的指导患者的***。随着越来越多循证医学证据的出现,NSCLC的血液EGFR突变检测正在成为ddPCR相当有前景的应用方向。在扩增结束后对每个反应单元的荧光信号进行采集。天津数字PCR数字PCR专业服务
数字PCR作为新一代PCR技术,采用芯片载体将PCR反应体系分配到20000个微孔中,实现单分子模板的扩增,通过荧光信号的有无来判断每个微孔的阴阳性**终利用泊松分布校正结果给出***定量值(copy/ul),利于精细定量样品中的拷贝数,且灵敏度高(0.1%),即使针对血液中低频的ctDNA检测也同样适用。数字PCR技术在血液cfDNA低突变丰度检出中的出色表现,以及涵盖多种变异形式(SNV、InDel、融合和扩增)的检测能力,均证明其作为液体活检领域的重要“神技”,可广泛应用于医疗机构、临检中心和科研院所等。江苏重现性数字PCR欢迎咨询通过锁核酸修饰的引物增强了对互补序列的亲和力和特异性,即使是微小表达差异也可以轻松检测。
***代PCR技术是常规PCR技术,对目的基因扩增后进行凝胶电泳,将扩增条带与已知浓度的标准品比较,得到定性结果,但在产物分析时需要开盖操作,容易引起交叉污染,导致假阳性。第二代PCR技术是在PCR反应体系加入荧光基团,利用荧光信号累积实时监测整个PCR反应进程,通过相关数据分析方法对目的基因进行定量分析的技术。数字PCR是第三代PCR技术,是一种采用微流控或微滴化的方法将稀释后的待测样品核酸溶液分散至微反应器或微滴中再在相同条件下进行单分子PCR,检测每一个微反应器或微滴中荧光信号通过直接计数或泊松分布修正得到原始浓度或含量的核酸分子***定量技术。目前大致可分为三类:微反应室/孔板数字PCR、大规模集成微流控芯片数字PCR、液滴数字PCR。
微生物(病毒、细菌等)的检测:疾病预防控制中心、出入境检验检疫局系统的实验室可以将基于TaqMan探针法的定量PCR体系无缝地转移到数字PCR上,从而满足该类实验室对于检测结果的要求:灵敏度更高、重复性更好、无需依赖标准曲线的***定量结果。其他应用:数字PCR还可以用于转基因成分的检测、移植排斥监控、肠道菌群分析以及药物基因组检测等领域。随着数字PCR荧光通道的增加和多指标检测的成熟,数字PCR将会进入更多应用领域,有力推动生命科学、医学诊断、检验检疫、农业等领域的快速发展。对引物的特异性要求高。
微流控芯片技术的发展为我们提供了一个实现低成本、小体积和高通量平行PCR分析的理想平台。2000年,Unger等采用多层软刻蚀 ( multilayer soft lithography,MSL) 技术在聚二甲基硅氧烷( polydimethylsiloxane,PDMS) 微流控芯片上设计并加工高密度微泵微阀结构(如图2b所示) ,他们将这种芯片称为IFC( integrated fluidic circuit)。IFC 利用PDMS材料具有高弹性的特点,通过多层软刻蚀技术在芯片上加工交织的液体和气体通道结构,可以快速并准确地将流体分成若干个**的单元,进行多步平行反应。2006 年Ottesen等将IFC芯片用于数字PCR分析,通过精细控制微泵微阀的开启和关闭,一步操作即可将一个样本平均分配到 1176个反应单元中,每个反应单元的体积只有6. 25 nl,成功代替了传统点样仪和384孔板。他们同时进行了6个样本7 056个单元的平行数字PCR分析。此外, Hansen及其同事采用 MSL技术加工了具有10^6个结构单元的数字PCR 芯片,每个反应单元的体积降低至10 pl,芯片密度达到 440000 /cm2。与微反应室数字PCR系统相比,IFC的特点是通量更高,每个反应单元的体积更小,加样更快。**近,Men等在2mm×2mm区域内加工了82000个 fl 级反应单元,进行数字PCR分析。数字PCR技术为基因表达分析提供了高精确的定量分析方法。广东核酸拷贝数定量数字PCR售后分析
目前有超过130万条经锁核酸修饰的引物,提供至少3种设计方案以满足不同跨外显子区域的检测需求。天津数字PCR数字PCR专业服务
外周血MicroRNA的***定量:人体体液中稳定可检测的miRNA的发现为其作为疾病生物标志物提供了新的可能性,但是它们的含量可能极低,在体液中也缺乏已知的内源性参考基因,这为每一项可靠的转化应用都提出了真正的挑战。利用数字PCR的***定量优势,可以解决缺乏内源性参考基因的问题。有研究者证实,基于EvaGreen的ddPCR技术可以给出溶液之中miRNA分子的精确数量,并且在低丰度的miRNA定量中有更好的准确度,在四个数量级的浓度范围内都有很好的重复性,能够在低至1拷贝/μl的水平上检测到一个拷贝的miRNA,这种性能完全超过了传统定量PCR的表现。由于ddPCR能够提供更好的重复性,实验室内部和实验室之间的结果具有直接可比性,这使得ddPCR成为microRNA研究中非常有潜力的一个技术。天津数字PCR数字PCR专业服务