引物用于启始PCR反应，其质量直接关乎实验成败。引物设计一般遵循以下原则：长度在15～30bp（一般为18～25bp），GC含量尽可能在50%～60%。严重的比例失衡会导致引物二聚体增多。Tm值在50℃～65℃。过高会导致扩增受影响（DNA聚合酶有一定的工作温度范围）；过低容易产生错配，特异性差。目前很多软件和网站可以预测引物的Tm值，要注意的是该值（包括引物合成单中的Tm）只只是预测，并不表示实际情况，PCR时比较好的退火温度需要通过温度梯度实验来得到。避免匹配模板的二级结构区域。避免连续出现三个以上G或者C碱基。引物中碱基分布比较好是随机的，否则可能会在基因组中的GC密集区发生错误匹配。3’端尽量安置G或者C碱基。GC配对的强氢键作用对于启始PCR反应具有更好的作用。避免引物二聚体的出现。其中包括自身配对和上下游引物配对，这要求3’端序列尽可能不要出现大量碱基配对。 SYBRGreen法qPCR机构哪家好？宁夏SYBRGreen法qPCR机构哪家好
Ct值出现过晚（Ct>38）扩增效率低：反应条件不够优化。设计更好的引物或探针；改用三步法进行反应；适当降低退火温度；增加镁离子浓度等。PCR各种反应成分的降解或加样量的不足。PCR产物太长：一般采用80～150bp的产物长度。标准曲线线性关系不佳加样存在误差：使得标准品不呈梯度。标准品出现降解：应避免标准品反复冻融，或重新制备并稀释标准品。引物或探针不佳：重新设计更好的引物和探针。模板中存在抑制物，或模板浓度过高。黑龙江实时荧光定量qPCR机构电话一个 qPCR 试剂盒的重心是引物探针设计、酶、反应体系和较好的反应条件。
与Ct值有关的参数：标准曲线Standardcurve：模板的Ct值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系。利用已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线，其中横坐标表示起始拷贝数的对数，纵坐标代Ct值。相关系数Correlationcoefficient(R^2)：反映了标准曲线的线性，通常要求>0.99。扩增效率Efficiency(E):通常要求在90%~110%。效率低于100%，是由于PCR反应中存在抑制因素；而高于100%可能一些污染、非特异性扩增或者是引物二聚体造成。斜率 Slope ：当扩增效率为 100% 时斜率为 - 3.32，当 90%-110% 时的斜率为 - 3.58 ~ -3.10。
当初始模板核酸浓度≤1 copies/μL 时，这时的影响因素不光是你能否检测到，还取决于你每次能取到模板的概率。因为在低浓度下，每次取到模板的概率是服从泊松分布的。不明白的可以看看（诊断试剂评价系列 4 - 比较低检测限，你做对了吗？）qPCR循环数试验：模板浓度：将标准物质稀释为0.5，1，2，3，4，5copies/μL，模板上样量2μL，每个浓度10次重复。扩增体系：使用相同的引物探针和扩增体系进行扩增，扩增体系体积为20μL。该扩增体系的R^2=0.997,E=92.57%,斜率-3.51。循环数：分别进行40个循环和45个循环，其他条件完全一致。上海融享生物科技有限公司TaqMan荧光探针qPCR服务。
荧光定量PCR（qPCR）是目前病原检测领域使用j较为普遍的核酸检测方法。尤其是非洲猪瘟和肺炎发生后，qPCR检测得到了极大的普及，对于刚刚进入qPCR检测领域的人，很容易钻入了「唯Ct值」的牛角尖，我们就来聊聊qPCR中的Ct值。什么是Ct值阈值循环数Thresholdcycle(Ct)也写作Cq值，荧光信号大于荧光阈值时PCR循环数。仪器软件通常将第3-15个循环的荧光值设为基线（baseline），是由于测量的偶然误差引起的。阈值（threshold）一般是基线的标准偏差的10倍。在实际操作中也可以手动调节。高于阈值的荧光信号被认为是真实的信号，用于定义Ct值。Ct会受到阈值的影响，每次试验由于样品和仪器的不同会导致基线不同，进而影响阈值和Ct值。上海SYBR荧光染料qPCR机构哪家靠谱？黑龙江实时荧光定量qPCR机构电话
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InSilico工具如BLAST或者等效性搜索是实验设计有用的。应当记录任何可预测的假基因的同源或者其它不可预见的基因，并且作为一个序列比对提供给审稿人。但是特异性必须用直接的实验证据(凝胶电泳，解链曲线图形，DNA序列，扩增片段大小，和/或限制性酶切)验证有效性。设计之初可预测寡核苷酸的熔解温度(Tm)的算法，但是退火的实际比较好温度必须通过实验决定。虽然引物优化已成为过去时，但是不当的退火温度优化对实验质量有很大的影响还是明确的。引物二聚体的显可引起PCR低效率，在探针和SYBRGreenⅠ的实验中可能产生假阳性。引物优化的一些证据应提给审稿人，比较好还要提交退火温度或者Mg2+浓度，Cq值，荧光点阵图与循环次数，和/或熔解曲线。宁夏SYBRGreen法qPCR机构哪家好
