与Ct值有关的参数:标准曲线Standardcurve:模板的Ct值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系。利用已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线,其中横坐标表示起始拷贝数的对数,纵坐标代Ct值。相关系数Correlationcoefficient(R^2):反映了标准曲线的线性,通常要求>0.99。扩增效率Efficiency(E):通常要求在90%~110%。效率低于100%,是由于PCR反应中存在抑制因素;而高于100%可能一些污染、非特异性扩增或者是引物二聚体造成。斜率 Slope :当扩增效率为 100% 时斜率为 - 3.32,当 90%-110% 时的斜率为 - 3.58 ~ -3.10。上海融享生物科技有限公司专业的qPCR。内蒙古实时荧光qPCR
qPCR做不好的原因:RNA的降解,当然也就是RNA完整性的问题,RNA的完整性,一般体现在电泳过程中18S和28S的亮度上,如果这两个条带的RNA亮度变低,甚至没有,就说明RNA的完整性应该会有损失。导致RNA完整性受损的原因有很多,比如:包括镁离子,pH,温度,紫外线,福尔马林等等都会对你的RNA产生影响。所以,要处处小心。于是有人做了这样的实验,就是对于RNA的降解,有没有什么方法可以降低RNA降解对于qPCR的影响。他们分别分析了3`端和5`端的扩增CT值,以及长片段和短片段的ΔCT,发现RNA的完整性缺失与3`端和5`端没多大关系,但是短片段会比长片段扩增效率更高。所以,qPCR引物设计的过程中,尽量把片段设计得短一点。黑龙江实时荧光定量qPCR机构电话上海SYBR荧光染料qPCR机构哪家靠谱?
什么是CT值比较法?数据怎么处理?CT值与起始DNA浓度的对数成反比:如果:不同管之间的PCR反应效率相同。这些PCR的反应效率接近100%。可以从上面的公式推出相对含量(X01/X02)=2-ΔCT。假设实验的目标是研究药物处理后0、24、48小时IL-2基因在某种组织中的表达量的变化,所用内对照是18SRNA基因。IL-2和18SRNA的测定结果都是CT值,而没有通过标准曲线测定总RNA的pg数。内标法和外标法哪种数据更精密?是同样可靠的。内标的优点在于目标基因与管家基因的反应条件较接近一致,缺点在于目标基因与管家基因的引物和探针相互之间会发生竞争与抑制,导致它们的PCR效率有差异。外标的优点在于目标基因与管家基因的引物和探针之间没有发生竞争与抑制的机会,但是不同管之间的反应条件差异比同管的要大,也会导致它们的PCR效率有差异。两相比较,内标法与外标法的数据精确度是一样的。
扩增曲线异常,比如S型曲线参比染料设定不正确:MasterMix不加参比染料时,选NONE。模板的浓度太高或者降解。荧光染料的降解。定量PCR仪的开关机顺序是怎样的?按照正确的开关机顺序操作,有助于延长仪器的使用寿命,减少仪器出故障的频率。开机顺序:先开电脑,待电脑完全启动后再开启定量PCR仪主机,等主机面板上的绿灯亮后即可打开定量PCR的收集软件,进行实验。关机顺序:确认实验已经结束后,首先关闭信号收集软件,然后关掉定量PCR仪主机的电源,然后关闭电脑。上海SYBR荧光染料qPCR机构哪家好?
实时定量PCR可以通过荧光定量检测和测量微小量的核酸,适用范围很广,可以检测多种不同来源的组织样本,在分析诊断学,生命科学,农学和医学中应用很广,是一种好的的技术方法。因为qPCR操作简单,检测速度快,敏感性和特异性好,还可以对核酸定量的特点,qPCR已成为核酸定量实验的标准方法。qPCR除了作为一种研究方法,其在诊断中也有广泛应用,如微生物定量,基因定量,转基因食品中外源基因的鉴定,疾病复发的风险评估以及法医中的应用。利用qPCR技术的研究文献也是数量惊人,这些文章使用不同的试剂,方法,分析法和报道格式。但是由于缺乏如何比较好的操作qPCR实验共识,qPCR一些不足可能会引起很多不良后果,这阻碍了qPCR成为一个单独的标飘走。影响qPCR检测性能的技术上的不足包括以下几点。缺少足够的样本,制剂和核酸质量,从而产生高度可变的结果。反转录引物和PCR引物以及探针选择性差,导致效率低下,与其强大的检测性能不成比例。不恰当的数据和统计分析,产生可能是高度误导的结果。 用qPCR检测细胞内mRNA的表达量。云南实时荧光qPCR机构
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每个量化目标的校准曲线必须包含在提交稿件中,这些信息审稿人可以看到。校准曲线的斜率和Y截距必须包含在发表中。不同PCR效率可以产生不同的校准曲线和不同的斜率。因此靶基因和参考基因的Cq值不同可以保持不变,但是模板量是变化的,计算相对浓度是不准确的,易产生误导性结果。Cq>40是可疑的,因为扩增效率低。使用这种Cq值是不理想的,因为它们可能太低(没有有效的结果)或者太高(假阳性结果增加)。反应的动态范围是线性的(比较高到比较低量化的拷贝数通过校准曲线表示)。根据生成校准曲线的模板,动态范围应当包括至少3个数量级,理想状态5或6log10浓度。校准曲线的线性间隔必须包括目标核酸量化的间隔。因为量化的低限常不明确,应当确定线性间隔内比较低浓度的变化。必须报道相关系数(r2值),理想是CIs应当通过整个线性动态范围。内蒙古实时荧光qPCR