什么是CT值比较法？数据怎么处理？CT值与起始DNA浓度的对数成反比：如果：不同管之间的PCR反应效率相同。这些PCR的反应效率接近100%。可以从上面的公式推出相对含量（X01/X02）=2-ΔCT。假设实验的目标是研究药物处理后0、24、48小时IL-2基因在某种组织中的表达量的变化，所用内对照是18SRNA基因。IL-2和18SRNA的测定结果都是CT值，而没有通过标准曲线测定总RNA的pg数。内标法和外标法哪种数据更精密？是同样可靠的。内标的优点在于目标基因与管家基因的反应条件较接近一致，缺点在于目标基因与管家基因的引物和探针相互之间会发生竞争与抑制，导致它们的PCR效率有差异。外标的优点在于目标基因与管家基因的引物和探针之间没有发生竞争与抑制的机会，但是不同管之间的反应条件差异比同管的要大，也会导致它们的PCR效率有差异。两相比较，内标法与外标法的数据精确度是一样的。选择一款靠谱的产品，一次性把 qPCR 做好，把更多的精力投入到科研思路、科研创造中，才能更快产生科研价值。甘肃TaqMan荧光探针qPCR公司哪家好
负对照有信号引物设计不够优化：应避免引物二聚体和发夹结构的出现。引物浓度不佳：适当降低引物的浓度，并注意上下游引物的浓度配比。镁离子浓度过高：适当降低镁离子浓度，或选择更合适的mix试剂盒。模板有基因组的污染：RNA提取过程中避免基因组DNA的引入，或通过引物设计避免非特异扩增。扩增效率低反应试剂中部分成分特别是荧光染料降解。反应条件不够优化：可适当降低退火温度或改为三步扩增法。反应体系中有PCR反应抑制物：一般是加入模板时所引入，应先把模板适度稀释，再加入反应体系中，减少抑制物的影响。广西TaqMan荧光探针qPCR机构电话TaqMan荧光探针qPCR公司哪家靠谱？
Ct值能否直接换算成模板拷贝数？通过制作标准曲线（E：90%~110%，R^2≥0.99，斜率-3.58~-3.10）的方法可以获得未知样品的初始模板拷贝数，前提是需要样品与标准品同时扩增，定量标准品需要使用标准物质等定量准确的物质（OD260/280换算的的拷贝数误差很大），即使如此定值结果仍存在一定的误差。荧光定量PCR是否为定量方法？虽然名字里有「定量」，但是qPCR的间接定量方式又复杂，又受很多因素影响，又不准确，在计量领域是不被认可的。目前的核酸检测方法中只有数字PCR是真正的定量检测方法，其余的都是定性检测方法。
引物用于启始PCR反应，其质量直接关乎实验成败。引物设计一般遵循以下原则：长度在15～30bp（一般为18～25bp），GC含量尽可能在50%～60%。严重的比例失衡会导致引物二聚体增多。Tm值在50℃～65℃。过高会导致扩增受影响（DNA聚合酶有一定的工作温度范围）；过低容易产生错配，特异性差。目前很多软件和网站可以预测引物的Tm值，要注意的是该值（包括引物合成单中的Tm）只只是预测，并不表示实际情况，PCR时比较好的退火温度需要通过温度梯度实验来得到。避免匹配模板的二级结构区域。避免连续出现三个以上G或者C碱基。引物中碱基分布比较好是随机的，否则可能会在基因组中的GC密集区发生错误匹配。3’端尽量安置G或者C碱基。GC配对的强氢键作用对于启始PCR反应具有更好的作用。避免引物二聚体的出现。其中包括自身配对和上下游引物配对，这要求3’端序列尽可能不要出现大量碱基配对。 SYBR green染料法相对较便宜。
使用Bioanalyzer/Experion系统计算RNA完整性数量或RNA质量指标数量的优点是这些指标可以提供有关RNA样本一般状态的定量信息。但是要记住这些与rRNA质量有关的数字不能期望作为质量的指标。使用3’:5’分析要求两个实验的PCR效率几乎相同，不受不同抑制剂的控制。这个实验还需要一个阈值来定义RNA质量产量不足可信结果。理想状太下检测目标是一组「可靠参考基因」，可能没有内含子，3’:5’的倍数大约是0.2-5。显然需要进一步的工作开发一个评价RNA完整性的工具，既有普遍适用性，又有成本效益和操作简单。应当通过稀释样本(比较好)检测反转录活性或者PCR抑制剂，或者使用一般的抑制试验如SPUD。如果RNA样本部分降解，这个信息必须报道，因为实验的低水平转录检测敏感性可能减少，转录的降解的相对差异可能引起不正确的比率。为什么我的qPCR每次结果都不太一样？重庆实时荧光定量qPCR哪里有
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提取样本中的RNA定量分析很重要，因为比较不样本时，使用大致相似相同数量的RNA是明智的。平常使用的有几种量化方法，如分光光度法(NanoDrop;ThermoScientific)，微流控分析法(AgilentTechnologies’Bioanalyzer,Bio-RadLaboratories’Experion)，毛细管凝胶电泳法(Qiagen’sQIAxcel)，或者荧光染料检测法(Am-bion/AppliedBiosystems’RiboGreen)。这些方法可以有不同的结果，因此用不同方法比较结果是不明智的。定量RNA推荐使用荧光RNA结合染料(如RiboGreen)，该方法是检测低浓度样本比较好的方法。建议任何情况下检测所有样本使用同一种方法，并且报道这些信息。外源性基因组DNA污染程度和这种污染容忍的阈值也是很重要的。必须报道RNA样本是否经过DNase处理(包括DNase类型和反应条件)，每个核酸样本的获得的Cqs研究组和非反转录的控制组的阳性果之间比较结果。甘肃TaqMan荧光探针qPCR公司哪家好
