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数字PCR基本参数
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数字PCR企业商机

***代PCR技术是常规PCR技术,对目的基因扩增后进行凝胶电泳,将扩增条带与已知浓度的标准品比较,得到定性结果,但在产物分析时需要开盖操作,容易引起交叉污染,导致假阳性。第二代PCR技术是在PCR反应体系加入荧光基团,利用荧光信号累积实时监测整个PCR反应进程,通过相关数据分析方法对目的基因进行定量分析的技术。数字PCR是第三代PCR技术,是一种采用微流控或微滴化的方法将稀释后的待测样品核酸溶液分散至微反应器或微滴中再在相同条件下进行单分子PCR,检测每一个微反应器或微滴中荧光信号通过直接计数或泊松分布修正得到原始浓度或含量的核酸分子***定量技术。目前大致可分为三类:微反应室/孔板数字PCR、大规模集成微流控芯片数字PCR、液滴数字PCR。外泌体里面的micRNA含量是非常低的。广东数字PCR售后分析

优势:不依赖Ct值,无需标准曲线,即可实现真正的***定量高精确度、高灵敏度,荧光定量qPCR灵敏度为1%-0.1%,数字化PCR灵敏度可达0.01-0.001%。对干扰分子(背景信号、PCR抑制剂等)耐受度高,通过信号的“有”“无”定量而不是Ct值。数字PCR研究基因表达遇到基因丰度非常低的,或者样本浓度低的,可以选择数字化PCR,通常CT值大于30的时候,荧光定量qPCR的精确度和重复性会**降低,这个时候可考虑数字化PCR。外泌体里面的micRNA含量是非常低的,提取外泌体也是个非常费时费钱的事情,千辛万苦提取出来的样本,保险起见,用数字化PCR是非常不错的一个选择,而且也非常便宜。四川数字PCR经验丰富整个实验流程可在2小时内完成。

外周血MicroRNA的***定量:人体体液中稳定可检测的miRNA的发现为其作为疾病生物标志物提供了新的可能性,但是它们的含量可能极低,在体液中也缺乏已知的内源性参考基因,这为每一项可靠的转化应用都提出了真正的挑战。利用数字PCR的***定量优势,可以解决缺乏内源性参考基因的问题。有研究者证实,基于EvaGreen的ddPCR技术可以给出溶液之中miRNA分子的精确数量,并且在低丰度的miRNA定量中有更好的准确度,在四个数量级的浓度范围内都有很好的重复性,能够在低至1拷贝/μl的水平上检测到一个拷贝的miRNA,这种性能完全超过了传统定量PCR的表现。由于ddPCR能够提供更好的重复性,实验室内部和实验室之间的结果具有直接可比性,这使得ddPCR成为microRNA研究中非常有潜力的一个技术。

乳腺*的分型:ER,PR和HER2是乳腺***常用的分子标志物,在患者在开始***之前必须要明确这几个分子标志物的具体状态。传统的检测方法是通过IHC来确定蛋白的表达情况,而HER2检测也还可以通过FISH来判断染色体的扩增情况。尽管相应的检测都有明确的指南来加以规范,但是在临床实践过程之中,有些检测结果不可避免的还是会受到人为操作和判读的主观影响,从而导致同一样本的结果偏差,为临床的治疗带来了极大的困惑。有研究者尝试采用四重数字PCR方法,对这几个标志物同时进行定量检测。95例石蜡标本的对比分析结果显示,HER2,ER和PR与IHC的一致性分别为96.8%,91.5%和85.1%,而ROC曲线下面积则分别为0.991,0.977和0.920,说明该方法与IHC方法有较好的一致性。此外,相比于IHC方法,数字PCR方法还具有操作和判读标准化、结果重复性好、检测周期短、标本使用量少等优势,未来在临床将会有很好的应用前景。数字PCR可以用来研究基因表达。

常规PCR和实时荧光PCR定量检测都需要已知拷贝数的标准DNA制定标准曲线,由于样品测定在各种条件上不会完全一致,会造成PCR扩增效率的差异,从而影响定量结果的准确性。而ddPCR不受标准曲线和扩增动力学影响,可以进行***定量。dPCR也有一些缺点,数字PCR系统成本高,通量有限、操作繁琐等不足。芯片式dPCR由于芯片加工成本高,系统复杂度高,使得商业化优势不是特别明显,特别是目前大多数分子诊断qPCR也能够很好的满足需求,dPCR增加的收益成本比并不算高。液滴式相对芯片式成本有所下降,但典型的液滴式dPCR液滴形成和PCR扩增和检测都分别在不同仪器中完成,增加了很多操作,也增加了系统的复杂性,从这点上看全自动荧光定量PCR做的更好。通常CT值大于30的时候,荧光定量qPCR的精确度和重复性会**降低,这个时候可考虑数字化PCR。四川数字PCR经验丰富

DNA聚合酶对实验的准确性起着至关重要的作用。广东数字PCR售后分析

cdPCR主要以Fluidigm公司的BioMark HD系统以及Life Technology公司的QuantStudio 3D系统为**。Bio Mark系统采用微泵阀式芯片,以聚二甲基硅氧烷为芯片材料,主要依靠微流控通道与阀门的开闭进行原始体系分割,在芯片的反应仓进行PCR反应,然后通过类似于基因芯片的方法扫描每个通孔的荧光信号,进行目的序列含量的计算。QuantStudio 3D系统采用阵列微池式芯片,反应液由进样孔直接进入各微反应池。芯片式dPCR生成微滴体积均一,具有较高的稳定性,体系之间影响较小,但技术操作复杂,通量有限且实验成本较高。广东数字PCR售后分析

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