病原体-宏基因组的测序:1.开发了一种经过验证的临床mNGS检测方法，用于在许可的微生物实验室中诊断脑脊髓液（CSF）引起的脑膜炎和脑炎的传染原因。2.开发了定制的生物信息学管道SURPI+，以快速分析mNGS数据，生成检测到的病原体的自动摘要，并提供用于评估和解释结果的图形用户界面。3.mNGS提供了一种全方面的方法，通过该方法可以在一次测定中准确鉴定几乎所有潜在病原体-病毒，细菌，寄生虫。4.将mNGS测试迁移到临床微生物学实验室仍然面临许多挑战：1、缺乏用于mNGS临床验证的既定蓝图；2、难以将病原体从殖民者或污染物中区分开；3、缺乏专为临床诊断使用的生物信息学软件；4、注重质量和全方面性的可获得的参考数据库；5、临床实验室改进修正案（CLIA）环境中，患者诊断测试固有的法规遵从性要求。在传统的诊断检测中对病原体的诊断检测是通过体外培养的方式进行的。上海肠道微生物多样性测序分析上哪找
宏病毒组是病毒的宏基因组，该技术是随着高通量测序技术的兴起而发展起来的。该技术主要是使用大量微生物群体样本的测序数据和生物信息学分析手段，以多种数据库为基础，进行群体的种类和功能分析。因此，它主要的应用场景在于微生物群体研究，如肠道微生物、皮肤微生物、口腔微生物、水体微生物、土壤微生物等。一直以来宏基因组技术都是在细菌领域使用，病毒的样本收集困难、文库构建繁琐、数据库不完善，因此宏基因组技术未能获得普遍应用。上海探普生物科技有限公司立志专门解决病毒方向的基因组研究难题，开发了整套的样本处理和生信分析流程，基于这套流程，研究者们想对样本进行宏病毒组测序就很容易实现了。上海肠道微生物多样性测序分析上哪找技术的成熟，未来二代测序病原体检测应进一步在成本下降、诊断标准完善、质量控制提升等方面进行完善。
上海探普生物科技有限公司对样本进行宏病毒组测序具有的优势：全国开设病毒宏基因组测序的公司不超过3家，只有探普生物是专门为病毒研究者服务的，探普生物的研发团队和实验团队都来自全国各地病毒学、微生物学专业的高校，硕士及以上学历成员超过60%，团队具备普通测序实验和分析基础之外，同时具备病毒学及微生物学的学术背景，相当了解病毒相关样本情况、研究方向等。研究者在项目咨询的时候就可以明显感觉到探普生物的专业性，沟通顺畅，省时省力。
宏病毒组分析的常用软件：介绍之前首先我们来看一下宏病毒组的基本分析流程。这里需要说明的是基于病毒颗粒分离技术及NGS测序平台的宏病毒组学研究还处于起步阶段，分析功能模块新的思路和技术层出不穷，但另一个层面，宏病毒组是宏基因组的一个分支，基本大的分析思路方面与宏基因组还是有着不小的相似之处。归纳一下，宏病毒组主要包括一下几个方面的分析内容：病毒群落结构组成分析；病毒群落功能分析；病毒（特别是噬菌体）宿主预测；病毒与群落中细菌、古菌等其他微生物之间的互作网络；基于非数据库比对的新病毒序列的挖掘。探普生物的病毒测序具备：样本准备简单，商务流程通畅，回复消息及时。
病毒宏基因组测序相关知识：DNA宏基因组测序的病原检出率均高于培养等传统方法，表现出良好的诊断性能。DNA宏基因组测序已被用于诊断各种临床传染性疾病，例如血液传染，肺和肺外结核（TB），侵袭性传染，寄生虫传染，传染性心内膜炎，复杂性肺炎，尿路传染和实体移植后的继发传染等，为临床传染性疾病的诊断和提供了新的前景。尽管一项多中心的回顾性研究表明，目前使用mcfDNA宏基因组测序作为诊断常见传染疾病的工具的优势并不明显，但它可以提供比传统方法更快、更早的诊断结果，以及在的升级/降级方面具有重要意义。宏基因组测序可以提供比传统方法更快、更早的诊断结果，以及在的升级/降级方面具有重要意义。河南微生物多样性测序上哪找
病原微生物二代测序也称宏基因组测序（mNGS）是目前临床上针对病原常用的基因测序方法。上海肠道微生物多样性测序分析上哪找
随着测序技术的发展，对微生物群（微生物组）的研究逐渐加深，研究热点越来越多集中于环境和生物体相互作用的微生物群。加之测序成本降低，分析技术不断提升，都使得宏基因组测序技术得到普遍应用。为什么要做宏基因组：宏基因组相对16S来说其物种分辨率会更高，随着物种测序完成越来越多，数据库更加完善，在肠道菌群方面基本能实现97%以上的菌都能鉴定到种，90%以上到菌株层面。而且可以同时获得除RNA病毒外的所有物种的分布。此外包括菌基因组CNV等方法的出现，可以直接通过大规模宏基因组测序不只找到可能的菌，进一步还能鉴定出特定候选基因区段。上海肠道微生物多样性测序分析上哪找
上海探普生物科技有限公司拥有从事生物科技专业领域内技术开发、技术转让、技术咨询、技术服务，化工原料及产品（除危险化学品、监控化学品、烟花爆竹、易制毒化学品），实验室设备，计算机、软件及辅助设备，电子产品销售，计算机软件开发及维护，计算机信息系统集成服务等。等多项业务，主营业务涵盖病毒测序，病毒全基因组测序，病毒宏基因组测序，未知病原鉴定。目前我公司在职员工以90后为主，是一个有活力有能力有创新精神的团队。诚实、守信是对企业的经营要求，也是我们做人的基本准则。公司致力于打造***的病毒测序，病毒全基因组测序，病毒宏基因组测序，未知病原鉴定。公司凭着雄厚的技术力量、饱满的工作态度、扎实的工作作风、良好的职业道德，树立了良好的病毒测序，病毒全基因组测序，病毒宏基因组测序，未知病原鉴定形象，赢得了社会各界的信任和认可。
