荧光探针法是一种利用荧光标记的分子(即荧光探针)来检测和定量目标分子的方法。这种方法广泛应用于生物化学、分子生物学和医学诊断等领域。以下是荧光探针法的一些关键特点和工作原理:1.**荧光标记**:荧光探针是一类特殊的分子,它们含有可以发出荧光的化学基团(荧光团)。这些荧光团在受到特定波长的光激发时,会发出特定波长的光。2.**特异性结合**:荧光探针通常设计成能够特异性地与目标分子结合,如DNA、RNA、蛋白质或其他小分子。这种结合通常是通过分子间的互补性,如氢键、疏水作用或离子键等实现的。3.**信号变化**:荧光探针在结合目标分子前后,其荧光特性(如荧光强度、波长、寿命等)会发生改变。这种变化可以是增强或减弱,取决于探针的设计和环境条件。4.**检测原理**:-在**荧光共振能量转移(FRET)**中,两个不同的荧光团被设计成靠近,使得一个荧光团(供体)的能量可以非放射性地转移到另一个荧光团(受体)。当供体和受体之间的距离改变(如由于目标分子的结合)时,FRET效率会改变,从而影响荧光信号。-在**荧光增强或减弱**中,探针的荧光特性直接受到其与目标分子结合的影响。例如,某些探针在结合DNA后,其荧光强度会增强。SpCas9-NLS的N端和C端都融合了SV40 T抗原的核定位信号,这使得Cas9蛋白与gRNA形成的复合物。Recombinant Canine PDGFA Protein,His Tag
5'DNA腺苷酰化试剂盒通过酶学方法高效地将单链DNA(ssDNA)5'端腺苷酰化,通常转化效率可达95%以上。以下是实现高效转化的关键步骤和特点:1.**单步反应**:与传统化学方法相比,该试剂盒可以在一个简单的步骤中完成5'端磷酸化修饰的单链DNA或RNA的腺苷酰化修饰,无需多步骤操作或纯化。2.**高效率**:试剂盒通常能将95%以上的5'端磷酸化的DNA(pDNA)转化成腺苷酰化DNA(AppDNA),从而提高产量并避免胶回收提纯步骤。3.**高温孵育**:在65℃的高温下进行反应,有助于避免DNA或RNA的二级结构对腺苷酰化反应的干扰。4.**酶的来源**:试剂盒中的腺苷酰化酶(Adenylase)通常来源于嗜热古细菌,在大肠杆菌中表达获得,保证反应的高效性。5.**操作简便**:使用MthRNA连接酶、ATP和5'-磷酸化的单链DNA进行反应,操作简单,且腺苷化产物通常不需要进行电泳切胶回收,可以直接通过乙醇沉淀进行进一步浓缩后用于后续的连接反应。6.**失活酶**:反应完成后推荐在85℃孵育5分钟以失活Adenylase,防止去腺苷酰化现象,确保腺苷酰化比率不下降。
PCR抑制剂是指那些在PCR反应中能够干扰或阻碍DNA扩增的物质。这些物质通常来源于生物样本本身或者样本的收集和处理过程。以下是一些PCR抑制剂的特点:1.**多样性**:PCR抑制剂可以是多种不同的化合物,包括胆酸盐、尿素、血红素、酚类化合物、蛋白质、多糖、植物或血液成分等。2.**来源**:它们可能来自血液(如血红素)、尿液(如尿素)、粪便(如胆酸盐)、植物(如多酚和多糖)、土壤(如腐殖酸)或化学物质(如酚类化合物)。3.**影响**:抑制剂可以影响DNA聚合酶的活性,干扰引物的退火,或与DNA模板发生非特异性结合,导致PCR扩增效率降低或特异性下降。4.**复杂性**:由于样本来源的复杂性,不同的抑制剂可能需要不同的策略来克服。某些抑制剂可能通过物理方法(如离心、过滤)去除,而其他抑制剂可能需要化学处理或使用特定的PCR增强剂。5.**浓度依赖性**:抑制效果通常与抑制剂的浓度有关。在较低浓度下,某些抑制剂可能不会影响PCR,但随着浓度增加,抑制效果会变得更加明显。6.**特异性**:某些抑制剂可能对特定的DNA聚合酶或PCR体系有特定的影响。例如,一些抑制剂可能特别影响高GC含量的模板扩增。
核酸(DNA和RNA)的可视化是分子生物学实验中的一项基本技术,用于检测和分析核酸的存在、大小、数量和纯度。以下是几种常用的核酸可视化方法:1.**紫外线(UV)检测**:-利用核酸分子对UV光的吸收特性,特别是在260nm波长下的吸收峰。-常用的UV检测方法包括凝胶电泳后的凝胶成像系统,可以观察到凝胶中DNA或RNA的条带。2.**荧光染料染色**:-使用荧光染料,如溴化乙锭(EthidiumBromide,EB)或SYBRGreen,这些染料可以与核酸结合并在特定波长的光照射下发出荧光。-EB常用于凝胶电泳后的DNA可视化,而SYBRGreen可用于实时定量PCR(qPCR)中DNA的检测。3.**凝胶电泳**:-通过将核酸样品加载到凝胶中,利用电场驱动核酸分子按大小分离,然后通过上述的UV或荧光染料进行可视化。4.**紫外交联**:-某些荧光染料,如BODIPY或Cy5,可以通过紫外交联直接结合到核酸上,提供更高的灵敏度和特异性。5.**银染**:-一种比EB染色更灵敏的染色方法,通过银离子与核酸的结合,然后还原成金属银,形成可见的黑色或棕色条带。6.**化学发光检测**:-使用特定的化学发光底物,如荧光素或鲁米诺,与核酸结合后,在氧化过程中产生光信号。可以利用现有的计算工具,如CRISPR design tools,预测gRNA的活性和特异性,以辅助实验设计 。
pA-Tn5转座酶的高活性是其重要特性之一,这种高活性主要来源于以下几个方面:1.**转座酶突变体**:pA-Tn5转座酶是由Tn5转座酶的高活性突变体构成的。这种突变体相比野生型Tn5转座酶,在体外的转座效率显著提高,通常提升1000倍以上。2.**ProteinA融合**:pA-Tn5转座酶将ProteinA与高活性Tn5转座酶融合,这种融合不仅保留了Tn5转座酶的高效DNA切割能力,还通过ProteinA的抗体结合特性,提高了对特定DNA序列的靶向能力。3.**转座随机性**:pA-Tn5转座酶能够在整个基因组上实现随机的DNA切割,这为高通量测序提供了广的覆盖度。4.**稳定性**:高活性的pA-Tn5转座酶在各种实验条件下都能保持稳定,包括在不同的温度和pH值条件下。5.**插入位点易测序**:pA-Tn5转座酶产生的DNA片段具有明确的插入位点,这些位点容易被高通量测序技术识别和分析。6.**高效片段化**:在CUT&Tag等实验中,pA-Tn5转座酶能够高效地实现目标蛋白结合DNA的片段化,为后续的测序和分析打下基础。7.**低细胞投入量**:由于其高活性,pA-Tn5转座酶允许从极少量的细胞中进行实验,如单细胞水平的研究。
全长跨膜蛋白CB1,即受体1(Cannabinoid Receptor 1),是一种G蛋白偶联受体(GPCR)。Recombinant Canine PDGFA Protein,His Tag
重组酶是一类能够促进DNA分子之间同源或非同源序列的重组的酶。它们在分子生物学、遗传工程和细胞生物学中扮演着重要角色。重组酶的作用机制通常涉及识别特定的DNA序列,催化DNA链的断裂和重新连接,从而实现遗传物质的重组。重组酶的主要类型和功能包括:1.限制性内切酶**(RestrictionEnzymes):这些酶可以识别特定的DNA序列并在这些序列处切割DNA链。它们是基因工程中常用的工具,用于DNA片段的精确切割和克隆。2.连接酶(Ligases):连接酶可以将两个DNA片段连接在一起,形成稳定的DNA分子。在DNA克隆和修复过程中,连接酶用于封闭切割位点产生的缺口。3.整合酶(Integrases):整合酶能够将一段DNA序列插入到宿主基因组的特定位置。它们在基因和遗传工程中具有应用。4.转座酶(Transposase):转座酶可以催化DNA片段从一个位置移动到另一个位置,这种机制在基因组中存在,并且在遗传多样性和进化中起着作用。5.**重组酶**(Recombinases):如RecA蛋白和Rad51蛋白,它们在同源重组中发挥作用,促进DNA双链断裂的修复和遗传物质的重组。6.DNA聚合酶:这类酶在DNA复制和修复中添加新的核苷酸,以现有DNA链为模板合成新的DNA链。
核酸内切酶VIII(EndonucleaseVIII)和核酸内切酶III(EndonucleaseIII)都是DNA修复酶,但它们之间存在一些关键的区别:1.**活性类型**:-**核酸内切酶VIII**:具有N-糖基化酶(N-glycosylase)活性和AP裂解酶(AP-lyase)活性。N-糖基化酶活性可以释放受损的嘧啶碱基,如胸腺嘧啶乙二醇和尿嘧啶乙二醇,产生一个脱嘌呤(Apurinic,AP)位点;AP裂解酶活性可以切割AP位点的3'和5'端,产生一个具有3'和5'磷酸的碱基缺口(Gap)。-**核酸内切酶III**:主要具有β裂解酶(β-lyase)活性,能够切割DNA磷二酯骨架在...