Lambda核酸外切酶(LambdaExonuclease,简称λExonuclease)是一种具有特定特性和应用的酶,以下是其主要特点和应用:1.**特异性作用**:λExonuclease是一种5'→3'核酸外切酶,能选择性地沿5'→3'方向消化5'端磷酸化的双链DNA。2.**酶切活性**:对单链DNA和5'端未磷酸化修饰的DNA的酶切活性较低,不能从DNA的切刻或缺口处起始消化。3.**嗜磷酸性**:该酶具有非常强的嗜磷酸性,磷酸化的核酸链与非磷酸化的核酸链的切割效率相差达200倍以上。4.**切割效率**:Lambda核酸外切酶是一种具有高度持续性的碱性核酸外切酶,可以连续地将核酸切割成为单个碱基,切割比较高速率可以达到1000nt/S。5.**应用领域**:-生成单链PCR产物用于DNA测序。-DNA单链构象多态性(SSCP)分析。-滚环扩增。-从双链DNA片段生成单链DNA。-PCR产物的克隆。-质粒制备净化。6.**酶活性定义**:Oneunitisdefinedastheamountofenzymerequiredtoproduce10nmolofacid-solubledeoxyribonucleotidefromdouble-strandedsubstrateinatotalreactionvolumeof50μlin30minutesat37ºCin1XLambdaExonucleaseReactionBufferwith1μgsonicatedduplex[3H]-DNA。通过优化crRNA的设计,可以提高FnCas12a的特异性和灵敏度,例如在microRNA检测中 。Recombinant Mouse CD229/SLAMF3 Protein,His Tag
5'-3'外切核酸酶活性是指DNA聚合酶能够从DNA链的5'端向3'端切除核苷酸的能力。这种活性通常用于修复受损的DNA或去除错误配对的核苷酸。具体来说,5'-3'外切核酸酶活性可以在DNA合成过程中切除前方的核苷酸,帮助错误或不需要的序列,从而确保DNA的正确复制和修复。在DNA聚合酶中,5'-3'外切核酸酶活性与聚合酶活性相辅相成。聚合酶在合成新链时,5'-3'外切酶活性可以在发现错误时进行修正,确保合成的DNA链的准确性。例如,E.coliDNA聚合酶I具有这种外切酶活性,可以在合成过程中去除错误的核苷酸,从而提高DNA的保真度。需要注意的是,BstDNAPolymerase,LargeFragment不具有5'-3'外切核酸酶活性,这使得它在某些应用中更为稳定,特别是在等温扩增反应中,如LAMP(环介导等温扩增)和RCA(滚环扩增)等。Recombinant Mouse Adiponectin/Acrp30 Protein,hFc TagUltra-Long Master Mix 是一种用于长片段PCR扩增的预混液,它含有经过特殊修饰的热稳定Taq DNA聚合酶。
嗜热脂肪芽孢杆菌DNA聚合酶I(BstDNAPolymeraseI)是一种热稳定的酶,它在高温下(55-65°C)仍然保持活性,这使得它在分子生物学实验中非常有用,尤其是在需要高温反应的实验中,如热循环扩增(PCR)。BstDNAPolymeraseI具有以下特性:1.**热稳定性**:BstDNAPolymeraseI在高温下具有较高的稳定性,适用于高温反应的实验,如PCR。2.**3'到5'外切酶活性**:这种酶具有3'到5'外切酶活性,能够切除DNA末端上的非特异性引物和杂交DNA,使其成为等温扩增应用的理想酶。3.**耐盐性**:BstDNAPolymeraseI在高盐条件下仍能保持稳定活性,这在一些特殊的PCR应用中非常有用。4.**等温扩增**:由于其3'到5'外切酶活性,BstDNAPolymeraseI用于等温扩增反应,如LAMP技术,这种技术能够在恒温下进行DNA扩增,无需繁琐的温度循环。5.**快速PCR**:由于其高温稳定性,BstDNAPolymeraseI也可用于快速PCR反应,缩短了实验时间。6.**高GC含量模板扩增**:BstDNAPolymeraseI对高GC含量模板的扩增效果较好,因此在一些难扩增的模板中表现出色。
在PCR实验中,为了避免引物与已知序列的交叉反应,从而确保实验的特异性,以下是一些关键的引物设计原则和策略:1.**选择高保守性区域**:引物比较好设计在模板cDNA的保守区内,这样可以确保引物与目标序列的特异性结合。通过比较不同物种的同一基因序列,可以确定基因的保守区。2.**避免引物与非目标序列的同源性**:设计引物时,应避免与基因组中的重复序列、假基因或高同源性区域设计引物。可以通过BLAST等工具对引物进行同源性分析,确保引物只与目标序列结合。3.**引物长度和GC含量**:引物长度一般在15-30碱基之间,常用的是18-27bp。GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜。过高或过低的GC含量都不利于引发反应,上下游引物的GC含量和Tm值应保持接近。4.**避免引物的3'端错配**:引物3'端的碱基应严格要求配对,特别是倒数第二个碱基,以避免因末端碱基不配对而导致PCR失败。引物3'端比较好不要选择A,比较好选择T,因为当末位链为T时,错配的引发效率降低。5.**避免引物自身及引物之间的互补序列**:引物自身不应存在互补序列,否则引物自身会折叠成发夹结构,影响引物与模板的复性结合。前后引物之间也不应具有互补性,尤其应避免3'端的互补重叠以防止引物二聚体的形成。Cas9 NLS在Cas9蛋白的N端和C端都含有SV40 T抗原的核定位序列,这使得Cas9与gRNA形成的复合物。
T5核酸外切酶在基因编辑中确实有应用,并且具有一些优势:1.**提高编辑效率**:根据一篇研究文章,T5核酸外切酶可以与CRISPR/Cas系统共表达或融合,以提高基因编辑的效率。这种共表达或融合可以增加indel(插入和缺失)频率,尽管增加的幅度可能不大。2.**增强基因编辑效果**:在另一项研究中,通过使用螺旋-螺旋二聚体肽(coiled-coilpeptides)将T5核酸外切酶招募到Cas9或Cas12a蛋白上,可以提高基因编辑的效率,这种方法被称为CCExo(CRISPR-Coiled-coil-Exonuclease)。这种招募方式优于共表达和直接融合,其中强的亲和力CC对显示出高的突变频率和删除长度。3.**应用于多种细胞类型**:CCExo系统在多种细胞系和原代细胞中都能有效地提高基因失活效率,并且在慢性髓性白血病(CML)患者的原代细胞以及异种移植动物模型中展示了其应用潜力,这表明CCExo方法可能成为CML和其他遗传性疾病的潜在选择。T5核酸外切酶与CRISPR核酸酶蛋白进行融合,并引入了核定位信号(NLS)序列以构建表达载体,用于基因编辑。综上所述,T5核酸外切酶在基因编辑中的应用可以增强编辑效率和效果,尤其是在与CRISPR/Cas系统结合使用时。Cas12a不仅具有顺式切割活性,还具备独特的反式切割活性,这使得它能够无差别地裂解附近的单链DNA。Recombinant Mouse CD229/SLAMF3 Protein,His Tag
泛素蛋白的C末端通常通过酰胺键与靶蛋白的氨基团连接在一起,最常见的是与靶蛋白赖氨酸的ε氨基团相连。Recombinant Mouse CD229/SLAMF3 Protein,His Tag
在比较BstDNA聚合酶和TaqDNA聚合酶对于复杂DNA片段扩增的适用性时,以下是一些关键点:1.**TaqDNA聚合酶**:-TaqDNA聚合酶因其高热稳定性和扩增效率而被应用于常规PCR。它扩增速度为30-60秒/kb,缺乏3'→5'核酸外切酶活性,无校正功能,易产生错配碱基。-对于结构复杂的模板,如GC含量高、有二级结构等,TaqPlus可以用于扩增,能有效地扩增10kb以下的片段。-有产品如TitaniumTaqDNA聚合酶,它是通过基因工程改造的Taq酶,缺失了5'-3'外切酶活性,具备更强大的扩增性能,适合扩增高度复杂的DNA混合物。2.**BstDNA聚合酶**:-BstDNA聚合酶具有高适温度,能够适应更加苛刻的扩增条件,同时消除DNA二级结构,因而能够准确并且均匀地扩增全基因组序列。-BstDNA聚合酶大片段能够优先扩增短片段的DNA,并且能够确保扩增得到的DNA覆盖了整个基因组,连贯并且无偏地扩增所有的遗传位点。-翌圣生物HieffCanace®PlusHigh-FidelityDNAPolymerase基于PfuDNA聚合酶改造而成,其保真性是Taq酶的83倍,Pfu酶的9倍,扩增速度高达10秒/kb,扩增目的片段长达13kb,具有极强的扩增效率的模板适应性,非常适合复杂模板的高保真扩增。
Lambda核酸外切酶(LambdaExonuclease,简称λExonuclease)是一种具有特定特性和应用的酶,以下是其主要特点和应用:1.**特异性作用**:λExonuclease是一种5'→3'核酸外切酶,能选择性地沿5'→3'方向消化5'端磷酸化的双链DNA。2.**酶切活性**:对单链DNA和5'端未磷酸化修饰的DNA的酶切活性较低,不能从DNA的切刻或缺口处起始消化。3.**嗜磷酸性**:该酶具有非常强的嗜磷酸性,磷酸化的核酸链与非磷酸化的核酸链的切割效率相差达200倍以上。4.**切割效率**:Lambda核酸外切酶是一种具有高度持续性的碱性核酸外切酶,可以连续地将核酸切...