Lambda核酸外切酶(λExonuclease)在PCR产物的克隆中主要应用在以下几个方面:1.**单链DNA的生成**:-Lambda核酸外切酶可以用于从双链DNA中生成单链DNA。由于该酶沿5'→3'方向逐步切去5'单核苷酸,底物是5'磷酸化的双链DNA,因此可以用来消化PCR产物中的一条链,从而生成单链DNA,这对于某些克隆技术来说是必要的步骤。2.**PCR产物的克隆**:-在克隆过程中,有时需要将PCR产物的5'端磷酸化,以便与载体连接。Lambda核酸外切酶可以消化非磷酸化的DNA,从而在一定程度上帮助准备适合克隆的PCR产物。3.**减少自身环化和非特异性连接**:-在连接反应中,为了减少质粒载体的自身环化,可以使用碱性磷酸酶处理质粒DNA以去除5'磷酸基团。而Lambda核酸外切酶可以消化5'端磷酸化的DNA,因此在某些情况下,它可以辅助减少PCR产物的自身环化,尤其是在PCR产物和质粒载体的连接反应中。4.**提高克隆效率**:-通过消化PCR产物中的一条链,Lambda核酸外切酶可以帮助减少PCR产物的非特异性连接,从而提高克隆的效率和准确性。综上所述,Lambda核酸外切酶在PCR产物的克隆中主要通过生成单链DNA、准备适合克隆的PCR产物、减少自身环化和非特异性连接以及提高克隆效率等方面发挥作用。在cDNA末端快速扩增(RACE)技术中,Ultra-Long Master Mix 可以用来扩增5'和3'末端的长片段cDNA。Recombinant Human SCF Protein,His Tag
使用BloodGenomicDNAIsolationKitwithMagneticBeads(血液基因组DNA提取试剂盒,磁珠法)进行血液样本中基因组DNA的提取,主要步骤如下:1.**实验准备**:准备抗凝全血样本(如EDTA抗凝血),移液器及无菌,15ml离心管,无水乙醇,70%乙醇,干净的吸水纸,涡旋振荡器,金属浴/水浴,台式离心机等。2.**样本处理**:取适量血液样本,根据试剂盒要求,可能需要将血液体积调整至特定量,例如200μl,并可能需要加入PBS缓冲液。3.**裂解血液细胞**:向血液样本中加入蛋白酶K和细胞裂解液,涡旋混匀后,置于金属浴或水浴中进行裂解,通常在65°C孵育10-15分钟,并在此期间定期混匀。4.**DNA与磁珠结合**:向裂解后的样本中加入异丙醇和磁珠悬浮液,涡旋混匀后,室温放置一段时间,以便于基因组DNA与磁珠结合。5.**磁珠分离**:将样本置于磁力架上,待磁珠聚集后,小心移除上清液,去除杂质。6.**洗涤磁珠**:向磁珠中加入漂洗液和洗涤液,进行洗涤以去除残留的蛋白质和盐分,然后再次使用磁力架分离磁珠,移除洗涤液。
牛痘DNA拓扑异构酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)与细菌DNA拓扑异构酶的主要区别如下:1.**来源不同**:-牛痘DNA拓扑异构酶I来源于牛痘病毒,是一种真核生物病毒中的酶。-细菌DNA拓扑异构酶则来源于原核生物,如大肠杆菌的ω蛋白等。2.**功能特性**:-牛痘DNA拓扑异构酶I能够解旋DNA的超螺旋结构,并且识别并切割双链DNA末端[5’C(T)CCTT],与DNA形成共价连接形成稳定复合物,遇到DNA的5’-OH基团后,重新连接形成完整DNA链。-细菌DNA拓扑异构酶,如大肠杆菌的ω蛋白,主要功能是催化DNA链断开和结合的偶联反应,以改变DNA的拓扑结构。3.**活性条件**:-牛痘DNA拓扑异构酶I即使在Mg2+不存在的条件下也显示活性。-细菌DNA拓扑异构酶可能需要Mg2+等金属离子作为辅因子来发挥活性。4.**作用的DNA链**:-牛痘DNA拓扑异构酶I能使正负两方的超螺旋分子均形成松散型。-原核生物由来的DNA拓扑异构酶I只作用负链的超螺旋分子。5.**共价键形成**:-牛痘DNA拓扑异构酶I与DNA形成共价连接,此酯键中所贮存的能量可能在切断端的再结合上起着作用。-细菌DNA拓扑异构酶在原核生物中是游离型的5′-OH末端扣3′-磷酸末端与酶形成共价键。
为了确保PCR实验中BstDNAPolymeraseI的活性比较大化,以下是一些关键的优化措施:1.**反应缓冲液**:使用适合BstDNAPolymeraseI的反应缓冲液,如NEB提供的IsothermalAmplificationBufferIIPack,该缓冲液包含Tris-HCl、(NH4)2SO4、KCl、MgSO4和Tween®20,pH值为8.8,专为等温扩增设计。2.**反应条件**:BstDNAPolymeraseI的比较好反应温度通常在65°C左右。确保PCR仪能够精确控制并保持这一温度,以保证酶的活性和稳定性。3.**酶的浓度**:根据反应体系的需要调整BstDNAPolymeraseI的用量。过多的酶可能导致非特异性扩增,而过少则可能降低扩增效率。通常,一个单位的酶能够在65°C下,30分钟内将25nmol的dNTP掺入酸不溶性物质。4.**Mg2+浓度**:Mg2+是DNA聚合酶活性的关键辅因子。其浓度对PCR反应有影响,需要根据具体情况调整Mg2+浓度,以获得比较好的扩增效果。5.**dNTPs浓度**:dNTPs是DNA合成的基础原料,其浓度约为200-300μM较为适宜。过高会增加非特异性扩增。6.**引物设计**:设计特异性引物,通常长度为18-30个碱基,Tm(熔解温度)相近,以保证同时退火。7.**模板DNA的质量和纯度**:确保模板DNA无蛋白质、RNA和其他杂质的污染,这些杂质可能会抑制酶的活性。Cas12a同源物能够识别更简单的PAM序列(如5-TTN),这使得基因组的覆盖率显著提高。
BstDNAPolymerase,LargeFragment(嗜热脂肪芽孢杆菌DNA聚合酶大片段)是一种经过改造的酶,它来源于嗜热脂肪芽孢杆菌(Bacillusstearothermophilus)DNA聚合酶I,通过重组技术在大肠杆菌中表达并纯化获得。这种酶具有5'→3'的DNA聚合酶活性,但不具有5'→3'的核酸外切酶活性,因此它在等温扩增反应中非常有用,如环介导的等温扩增(LAMP)和滚环扩增(RCA)等。以下是BstDNAPolymerase,LargeFragment的一些关键特点和应用:1.**等温扩增**:BstDNAPolymerase,LargeFragment具有很强的链置换能力,适用于多种等温扩增反应,这些反应通常在50-68°C之间进行,比较好反应温度为65°C。2.**快速测序**:由于其高聚合酶活性,BstDNAPolymerase,LargeFragment可以用于快速测序,特别是对于高GC含量的DNA模板或微量(纳克量级)DNA模板的测序。3.**全基因组扩增**:BstDNAPolymerase,LargeFragment也可用于全基因组扩增(WGA),这是一种在不需要热循环仪的情况下扩增整个基因组DNA的技术。4.**高dUTP耐受性**:与BstDNAPolymerase2.0相比,BstDNAPolymerase,LargeFragment在进行等温扩增时不具有将dUTP掺入合成的DNA链的能力,这使得它在某些应用中更具优势。泛素分子可以通过其内部的赖氨酸残基(如Lys48)与其他泛素分子形成多聚泛素链。PSA1 (141-150)
泛素化蛋白随后被靶向到26S蛋白酶体进行降解,或出现蛋白位置或活性变化。Recombinant Human SCF Protein,His Tag
CUT&RUN和ChIC是两种用于研究蛋白质-DNA相互作用的技术,它们有一些关键的区别:1.**技术原理**:-**ChIC(ChromatinImmunocleavage)**:ChIC技术利用抗体将感兴趣的蛋白与ProteinA-MNase相结合来进行DNA切割。ChIC的优势在于使用TF特异性抗体系住MNase,并只在结合位点裂解。-**CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)**:CUT&RUN技术则是在核的轻微MNase处理后释放单核小体和TF-DNA复合物,留下寡核小体。CUT&RUN通过在冰上进行简短的消化反应,在TF结合的MNase扩散到周边的基因组和裂解可接近的染色质之前在上清中恢复TF-DNA复合物。2.**操作步骤和简便性**:-**ChIC**:ChIC可能需要甲醛固定操作,这可能重新引入了ChIP-seq的一些问题,如交联导致的DNA和蛋白质的化学修饰。-**CUT&RUN**:CUT&RUN简化了操作步骤,使用磁珠固定细胞核,适用于新鲜和冷冻组织样本,缩短了生成DNA测序文库的时间(1-2天)。3.**背景信号和信噪比**:-**ChIC**:ChIC产生的背景信号可能较高,因为它可能涉及到非特异性的DNA切割。
使用BloodGenomicDNAIsolationKitwithMagneticBeads(血液基因组DNA提取试剂盒,磁珠法)进行血液样本中基因组DNA的提取,主要步骤如下:1.**实验准备**:准备抗凝全血样本(如EDTA抗凝血),移液器及无菌,15ml离心管,无水乙醇,70%乙醇,干净的吸水纸,涡旋振荡器,金属浴/水浴,台式离心机等。2.**样本处理**:取适量血液样本,根据试剂盒要求,可能需要将血液体积调整至特定量,例如200μl,并可能需要加入PBS缓冲液。3.**裂解血液细胞**:向血液样本中加入蛋白酶K和细胞裂解液,涡旋混匀后,置于金属浴或水浴中进行裂解,通常在65°C孵育10...