在PCR实验中,为了避免引物与已知序列的交叉反应,从而确保实验的特异性,以下是一些关键的引物设计原则和策略:1.**选择高保守性区域**:引物比较好设计在模板cDNA的保守区内,这样可以确保引物与目标序列的特异性结合。通过比较不同物种的同一基因序列,可以确定基因的保守区。2.**避免引物与非目标序列的同源性**:设计引物时,应避免与基因组中的重复序列、假基因或高同源性区域设计引物。可以通过BLAST等工具对引物进行同源性分析,确保引物只与目标序列结合。3.**引物长度和GC含量**:引物长度一般在15-30碱基之间,常用的是18-27bp。GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜。过高或过低的GC含量都不利于引发反应,上下游引物的GC含量和Tm值应保持接近。4.**避免引物的3'端错配**:引物3'端的碱基应严格要求配对,特别是倒数第二个碱基,以避免因末端碱基不配对而导致PCR失败。引物3'端比较好不要选择A,比较好选择T,因为当末位链为T时,错配的引发效率降低。5.**避免引物自身及引物之间的互补序列**:引物自身不应存在互补序列,否则引物自身会折叠成发夹结构,影响引物与模板的复性结合。前后引物之间也不应具有互补性,尤其应避免3'端的互补重叠以防止引物二聚体的形成。泛素分子可以通过其内部的赖氨酸残基与其他泛素分子形成多聚泛素链,这一步骤通常由E3酶催化。Recombinant Human JAML Protein,His Tag
BsuDNAPolymerase(嗜热脂肪芽孢杆菌DNA聚合酶)与其他DNA聚合酶相比,具有一些独特的特性和优势:1.**链置换活性**:BsuDNAPolymerase保留了BacillussubtilisDNA聚合酶I的5'→3'聚合酶活性,但缺乏5'→3'核酸外切酶结构域,这使得它具有链置换DNA合成的能力。这种能力对于等温扩增技术如重组酶聚合酶扩增(RPA)和环介导等温扩增(LAMP)非常重要,因为它可以分离双链DNA,允许新的DNA链的合成。2.**温度稳定性**:BsuDNAPolymerase在高温下保持活性,这使得它适用于需要在较高温度下进行的扩增反应,如RPA技术中的65°C反应条件。3.**无核酸外切酶活性**:BsuDNAPolymerase缺乏3'→5'和5'→3'核酸外切酶活性,这意味着它不会像某些其他聚合酶那样在合成过程中具有校对功能。这可以减少非特异性扩增,提高扩增的特异性。4.**高灵敏度和特异性**:BsuDNAPolymerase在等温扩增中展现出高灵敏度,能够将微量核酸模板扩增到可检测水平,同时保持高特异性。5.**简化的操作流程**:与其他需要复杂操作和多个步骤的DNA聚合酶相比,BsuDNAPolymerase在等温扩增技术中的应用简化了操作流程,因为它不需要热循环仪,这使得它适合现场快速检测和诊断。
蛋白A-微球菌核酸酶(pA-MNase)是一种特殊的融合蛋白,它结合了蛋白A和微球菌核酸酶(MNase,MicrococcalNuclease)的特性。以下是pA-MNase的一些关键特点和应用:1.**融合表达产物**:pA-MNase是蛋白A与微球菌核酸酶MNase的融合表达产物,因此它同时具有ProteinA的抗体结合活性和MNase的核酸内切酶活性。2.**双重功能**:由于其双重功能,pA-MNase常用于蛋白质-DNA相互作用研究,特别是在ChIC(ChromatinImmunocleavage)和CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)技术中。3.**ProteinA的特性**:ProteinA是一种发现于金黄色葡萄球菌(Staphylococcusaureus)的细胞壁表面蛋白,分子量为42kDa,能特异性地与哺乳动物免疫球蛋白(Immunoglobulin,Ig)结合,通常结合部位为免疫球蛋白的Fc区。4.**微球菌核酸酶(MNase)的特性**:MNase是一种核酸内切酶,能够降解核酸,常用于降解蛋白质制备中存在的核酸,减少细胞裂解液的粘度,以及用于染色质结构分析和快速RNA测序。5.**反应条件**:MNase的反应条件包括1XMicrococcalNucleaseReactionBuffer,需要补充100µg/ml重组白蛋白,分子生物学级,并在37°C下孵化。
T5核酸外切酶在基因克隆中的优势主要体现在以下几个方面:1.**高效性**:T5核酸外切酶依赖性组装(TEDA)方法在常规克隆中的效率与使用专有DNA聚合酶的商业In-Fusion方法相似,但高于使用T5核酸外切酶、PhusionDNA聚合酶和DNA连接酶的Gibson方法。2.**低成本**:TEDA方法每个反应使用0.04U的T5核酸外切酶,价格为0.25美分,具有很高的成本效益。3.**简单性**:TEDA方法的反应混合物非常简单,易于操作,这使得它在预算有限的实验室中尤其有用。4.**灵活性**:TEDA方法能够组装多个DNA片段,并在多个位点同时进行定点诱变,提供了一种灵活的克隆和突变方法。5.**阳性克隆率**:使用T5核酸外切酶的无缝克隆技术可以确保100%的阳性克隆率,这提高了实验的成功率。6.**协同作用**:在无缝克隆中,T5核酸外切酶与Phusion高保真DNA聚合酶和TaqDNA连接酶协同作用,通过切割、填补和连接三个步骤,高效地完成DNA片段的连接。7.**减少污染**:T5核酸外切酶可以降解碱裂解提取质粒中的变性DNA,减少超螺旋DNA的污染,提高DNA克隆和转染效率。这些优势使得T5核酸外切酶成为基因克隆中一个非常有价值的工具,尤其是在需要高效、低成本和操作简便的实验环境中。多泛素化的靶蛋白被26S蛋白酶体识别。26S蛋白酶体由一个20S颗粒和两个19S调节颗粒组成。
BstDNA聚合酶对dUTP的耐受性对实验结果有以下影响:1.**防止交叉污染**:BstDNA聚合酶具有较高的dUTP耐受性,这意味着它可以在反应体系中添加dUTP/UDG酶防污染系统的情况下工作,有效防止LAMP产物的交叉污染,确保数据的准确性。2.**保持灵敏度和扩增效率**:即使在引入dUTP/UDG酶防污染系统,使用dUTP替换dTTP的情况下,BstDNA聚合酶的灵敏度及扩增效率不受影响。实验数据显示,在反应体系中添加dUTP对BstDNA聚合酶的扩增灵敏度和效率没有负面影响。3.**提高实验的可靠性**:由于BstDNA聚合酶能够在高浓度的dUTP存在下保持活性,这使得它在进行等温扩增时更加可靠,尤其是在需要防止DNA污染的实验中。4.**兼容dUTP/UDG系统**:BstDNA聚合酶对dUTP的耐受性好,高度兼容dUTP/UDG系统,这对于避免交叉污染和提高实验结果的准确性至关重要。综上所述,BstDNA聚合酶的高dUTP耐受性为等温扩增实验提供了一个重要的优势,即在保持高灵敏度和扩增效率的同时,能够有效防止交叉污染,从而提高实验结果的可靠性和准确性。CRISPR/Cas12a 是一种单一的RNA引导的核酸内切酶,通过CRISPR/Cas9系统为靶向基因组工程提供了新的机会。Recombinant Human IgG1 Fc Protein,Tag Tag
FnCas12a在切割DNA时产生黏性末端,有助于提高同源定向修复(HDR)的效率。Recombinant Human JAML Protein,His Tag
Lambda核酸外切酶(LambdaExonuclease,简称λExonuclease)是一种具有特定特性和应用的酶,以下是其主要特点和应用:1.**特异性作用**:λExonuclease是一种5'→3'核酸外切酶,能选择性地沿5'→3'方向消化5'端磷酸化的双链DNA。2.**酶切活性**:对单链DNA和5'端未磷酸化修饰的DNA的酶切活性较低,不能从DNA的切刻或缺口处起始消化。3.**嗜磷酸性**:该酶具有非常强的嗜磷酸性,磷酸化的核酸链与非磷酸化的核酸链的切割效率相差达200倍以上。4.**切割效率**:Lambda核酸外切酶是一种具有高度持续性的碱性核酸外切酶,可以连续地将核酸切割成为单个碱基,切割比较高速率可以达到1000nt/S。5.**应用领域**:-生成单链PCR产物用于DNA测序。-DNA单链构象多态性(SSCP)分析。-滚环扩增。-从双链DNA片段生成单链DNA。-PCR产物的克隆。-质粒制备净化。6.**酶活性定义**:Oneunitisdefinedastheamountofenzymerequiredtoproduce10nmolofacid-solubledeoxyribonucleotidefromdouble-strandedsubstrateinatotalreactionvolumeof50μlin30minutesat37ºCin1XLambdaExonucleaseReactionBufferwith1μgsonicatedduplex[3H]-DNA。Recombinant Human JAML Protein,His Tag
磁珠法PCR/DNA纯化试剂盒在科研中的应用非常广,主要包括以下几个方面:1.**PCR产物的纯化**:磁珠法试剂盒可以从PCR反应液中回收不同片段大小的DNA,有效去除酶、dNTP、盐类等杂质,回收率高,产物纯度好,可以直接应用于PCR、连接、测序、NGS建库等下游实验。2.**基因组DNA的提取**:适用于从血液、唾液、口腔拭子和动物组织等样品中分离纯化高质量基因组DNA,提取的DNA片段大,纯度高,质量稳定可靠,适合高通量工作站的自动化提取。3.**质粒DNA的提取**:磁珠用于从粗制的提取物中分离质粒DNA,通过精心优化的溶液将质粒DNA从基因组DNA和蛋白质中分离出来。4.**DNA...