沉积物海源杆菌

胶冻样类芽孢杆菌（Paenibacillus mucilaginosus）是土壤里会“熬胶”的硅酸盐细菌。菌落圆润、表面像果冻，能把矿物中的钾、磷、硅一股脑解离出来，被农民亲切地称作“天然第二钾肥厂”。一、解矿机制它分泌多糖和有机酸，在钾长石表面形成生物膜，质子交换+络合双管齐下，把难溶的矿物钾转化为可溶性钾，盆栽试验显示，土壤钾含量可提高25%，相当于每亩白捡3公斤K₂O。二、促生抗逆产IAA、 gibberellin，刺激玉米、土豆侧根激增30%；生成的胞外多糖保水又固粒，使沙壤土含水率提升8%，帮助作物度过春旱。三、田间成绩山东大葱示范区，亩施200g（10⁸ CFU/g）菌粉，葱白粗度增加0.3 cm，产量提高12%，化肥钾用量降20%；宁夏葡萄沟灌后，糖酸比更协调，果粉增厚，货架期延长5天。四、工业发酵以糖蜜-玉米浆为培养基，28℃、200 r/min发酵36 h，芽孢数可达5×10⁹ CFU/mL，喷雾干燥存活率>90%，与腐熟鸡粪造粒，制成“生物硅钾肥”，存放18个月活菌仍大于2亿/克。五、未来方向科学家正把耐盐碱、耐重金属基因簇导入该菌，构建“解钾-降盐-钝化镉”三合一工程菌，让盐碱滩、矿区复垦地也能长出高产庄稼。其分泌的耐有机溶剂蛋白酶、褐藻胶裂解酶在洗涤、纺织及海藻转化中展现高活性，为生物制造提供新工具。沉积物海源杆菌

球芽孢杆菌（Bacillus sphaericus）是芽孢杆菌属里的“圆球”，因细胞呈规整杆状、芽孢却近球形而得名。它广分布于土壤、淡水及蚊幼虫孳生水体，对碱性环境（pH 9–10）和高温（50 ℃）具有良好耐受性，是兼具环境治理与生物防治双重价值的稀有菌种。一、杀蚊利器球芽孢杆菌更被称道的是其对蚊幼虫的专一毒力。菌株2362在芽孢形成期同步产生二元素蛋白（BinA/BinB），被库蚊、按蚊幼虫摄食后，素在中肠结合受体，造成离子失衡、麻痹死亡，24 h致死率可达95 %以上，而对鱼类、哺乳动物几乎无害。WHO已将其列入“全球媒介生物防治推荐菌剂”，并制成可湿性粉剂或缓释颗粒，用于登革热、疟疾高发区的蚊媒控制，年撒施面积逾千万公顷。二、环境修复球芽孢杆菌还能分泌碱性蛋白酶和脂肪酶，在pH 10、45 ℃条件下仍保持80 %活性，可用于高碱含油废水处理。实验表明，向炼油废水中投加10⁷ CFU mL⁻¹菌液，7天COD去除率提升30 %，污泥量减少25 %，为高盐高碱工业废水提供低成本生物强化方案。三、农业应用菌株IAB-109对番茄青枯、辣椒疫霉具明显拮抗作用，抑菌带宽20 mm；同时产IAA 15 mg L⁻¹，盆栽玉米根长增28 %，产量提10 %。Phenylobacterium muchangponense玉米侧IAA提升68%，秃顶缩短27%，增产18.6%，相当于少施25 kg复合肥仍多打粮。

冷解糖芽孢杆菌（Bacillus psychrosaccharolyticus）是芽孢杆菌属的“低温工匠”。菌体在10–40℃皆能生长，更适25–30℃；芽孢椭圆、中生，可耐干燥、耐紫外，货架期长，为制剂化提供质量材料。其名字里的“解糖”源于强大的胞外酶系：淀粉酶、纤维素酶、琼脂糖酶活性高，能把大分子碳源切成低聚糖，既供自己能量，也为周围菌群“开粮仓”，成为低温堆肥、海藻残渣降解的先锋。更难得的是它“抑菌+保水”双技能。平板对峙试验显示，对黄瓜尖孢镰刀菌、棉花立枯丝核菌、茄青枯拉尔氏菌等7种病原菌抑制率超50%，其中对黄瓜枯萎病原抑菌带宽达8mm，抑制率80%以上。机理在于分泌环脂肽和胞外多糖：多糖成膜后降低叶片水分散失，同时吸附Pb²⁺、Cd²⁺、Cu²⁺，1h内对铅吸附量可达50mg/g，为重金属污染农田提供“微胶囊修复”。农业应用上，研究者将冷解糖芽孢杆菌HD-3与枯草、巨大、胶冻样芽孢杆菌复配，再添海藻提取物、氨基酸和微量元素，制成有效活菌数2–10亿/g、有机质20–40%的“复合微生物海藻肥料”。大田试验中，白菜、番茄、棉花增产幅度均超30%，线虫侵染率下降70%，农药用量减少三成；在滴灌肥中添加1‰胞外多糖，玉米抗旱期延长7天，产量提高18%。

甲基营养型芽孢杆菌是土壤里的“碳链炼金师”。它以甲醇、甲胺等一碳化合物为主食，却能把这些常被忽视的小分子变成高值产物。菌体在含甲醇的培养基中迅速萌发，分泌甲醇脱氢酶，将有毒的甲醇先氧化为甲醛，再经RuMP循环固定为果糖-6-磷酸，既获得能量，又合成自身所需碳骨架。整套反应在pH 7、30℃下效率比较高，甲醇转化率可达理论值的92%，远高于化学催化。更难得的是，它同时是一株“生物兵工厂”。在利用甲醇的同时，甲基营养型芽孢杆菌能合成表面活性素、泛革素等脂肽，对黄瓜枯萎、辣椒疫霉、番茄青枯的抑菌带宽达25-30毫米；其挥发性的3-甲基-1-丁醇、2-甲基吡嗪可诱导植物系统抗性，使棉花黄萎病指下降40%。田间试验表明，每亩用200克菌粉滴灌，玉米根际甲醇天然浓度降低60%，植株叶绿素提高1.5个SPAD单位，产量增加8%，且农药使用量减少三成。工业端，科研团队把聚-γ-谷氨酸合成酶基因导入甲基营养型芽孢杆菌，使其在消耗甲醇的同时产出高黏度γ-PGA，可作为保水剂、絮凝剂或医用敷料；5吨罐分批发酵，γ-PGA产量达25 g/L，成本比传统谷氨酸发酵低20%。此外，其芽孢可耐沸水煮15分钟、紫外照射两小时，喷雾干燥存活率超过90%，为大规模制剂化提供了便利。侄子根瘤菌是土壤里的微型氮厂，遇豆科根毛即附，分泌信号，诱根内陷成瘤。

BM液体培养基，全名Basal Mineral Liquid Medium，是微生物学界公认的“极简配方”。它只提供生命必需的矿物元素：K₂HPO₄ 1.0 g、KH₂PO₄ 1.0 g、MgSO₄·7H₂O 0.2 g、CaCl₂·2H₂O 0.02 g、Fe-EDTA 0.01 g，加蒸馏水至1 L，pH 6.5±0.1，无碳、无氮、无有机微量元素，因此也被称为“空白画布”。研究者可根据目标菌的代谢特点，精确添加单一碳源（如葡萄糖、苯甲酸、甲烷）、氮源（如NH₄Cl、NO₃⁻或尿素）及特定金属，实现代谢通路、降解基因或耐受机制的单变量研究。BM的高纯度与低背景使其成为环境微生物分离的优先。取河水或土壤浸提液，经0.22 μm过滤除菌后，取1 mL加入含BM的50 mL血清瓶，再投加目标污染物（如50 mg L⁻¹多环芳烃），28℃、150 r/min培养7天，即可富集到以该污染物为碳能源的降解菌群。继代3次后，稀释涂布于含BM的固体平板，菌落纯化率可达90%以上，极大减少杂菌干扰。此外，BM培养基在合成生物学中亦扮演重要角色。研究者可在BM中添加特定浓度的¹³C-葡萄糖或¹⁵N-NH₄Cl，实现全菌体同位素标记，为蛋白质组、代谢流分析提供干净背景；也可通过缺铁、缺锌的BM，研究金属调控蛋白的功能。功能层面，巴基斯坦赖氨酸芽孢杆菌表现出“促生-抗病-解决”三合一特性。长孢链霉菌

它以甲醇、甲胺等一碳化合物为主食，却能把这些常被忽视的小分子变成高值产物。沉积物海源杆菌

德氏乳杆菌德氏亚种（Lactobacillus delbrueckii subsp. delbrueckii）是乳酸菌家族中更早被分离命名的“元老”之一，1901年即进入科学视野。菌体短杆、无芽孢、不运动，专性发酵葡萄糖产乳酸，更适生长温度42～45℃，可在pH 3.5的酸环境中存活，耐高温却畏冷，4℃即停止繁殖。基因组只1.8 Mb，代谢途径精简，却拥有完整的乳酸脱氢酶与寡肽转运系统，使其在蛋白质丰富的基质中快速产酸，抑制菌。工业上，它是酸奶、瑞士奶酪与保加利亚传统发酵乳的关键菌种，与嗜热链球菌协同可将牛乳在3小时内酸化至pH 4.2，形成细腻凝乳与特征性乙醛风味；同时分泌胞外多糖，赋予产品顺滑口感并延缓后酸化。近年研究还发现，其表面蛋白SlpA能黏附肠道上皮，诱导IL-10分泌，缓解小鼠结肠炎；热灭活菌体亦可通过启动树突细胞TLR2信号，增强肠道IgA应答，兼具益生与免疫调节潜力。随着合成生物学兴起，德氏乳杆菌德氏亚种被工程化改造为“活药工厂”，可在肠道内持续释放胰岛素样肽或白细胞介素，为糖尿病与炎症性肠病提供新型微生态治疗方案。沉积物海源杆菌