由于真核微生物的核糖体 DNA 是由核糖体基
因及与之相邻的间隔区(ITS)组成，使扩增
ITS1 的正向引物落在 18S 亚基上，扩增 ITS1 的反
向引物和扩增 ITS2 的正向引物落在 5.8S，而扩增
ITS2 的反向引物则是落在 28S 亚基上。然而目前并
没有一个较为准确完整的数据库能够提供从 18S 至
28S 全长序列。因此，我们用 ITSx Extractor 从专门
针对 ITS 序列的数据库 Unite 中分别筛选出的
ITS1、ITS2 和 ITS 全长序列，并构建了 3 个新的
数据库。其中，ITS1 数据库的筛选条件为：包含 ITS1
基因，且 ITS1 基因前、IT1 基因后序列长度>100 bp；
ITS2 数据库的筛选条件为：包含 ITS2 基因，且 ITS2
基因前、ITS2 基因后序列长度>100 bp；ITS 基因全
长序列数据库的筛选条件为：序列包含 ITS1 基因，
ITS2 基因、且 ITS1 基因前、ITS1 基因与 ITS2 基
因间隔、ITS2 基因后序列长度>100 bp。 上海融享生物科技有限公司主营测序包括 18S 价格优惠。云南细菌16S测序机构
随着分子生物学的发展以及各项新技术的临床广泛应用， 细菌微生物的分类鉴定从鉴定表型特征，深化为基因特征的分 类，在技术提高到细胞分子的水平[1]。16SrRNA、23SrRNA、 16-23SrRNA间隔区、RNA聚合酶的β亚基、超氧化物歧化 酶、DNA促旋酶B基因等是遗传学的候选基因，应用多的 是16SrRNA基因。分子标记法包括RAPD（随机扩增多态性 DNA）、AFLP（扩增片段长度多态性）、REP-PCR（重复基因 外回文序列）。细菌体内基本存在三种核糖体RNA，即16SrRNA 和23 rRNA、5 rRNA，参与细菌的蛋白质的合成过程。其中 16SrRNA比真核生物的相应rRNA略小，16SrRNA及其基因在微 生物鉴定中有重要作用，由于细菌各种属间生理特征和生化特征 相似，单凭传统方法已无法准确的进行分类鉴定，随着科技的发 展，现在已经能通过对细菌DNA，常用的是16SrRNA基因的进 行鉴定区分细菌种属。云南细菌16S测序机构16s 18S ITS 的不同测序会有不同的优势。
１６Ｓ～２３ＳｒＲＮＡ 基因间区序列分析的基本方法 通 用
引物的选取是 ＰＣＲ扩 增１６Ｓ～２３ＳｒＲＮＡ 基因间区鉴定细菌
的关键所在，在１６ＳｒＲＮＡ 上 至 少 有４个 保 守 区 域，区 域２存
在于真细 菌、古 细 菌 和 真 核 生 物 中，被认为是保守序列。
Ｇｕｒｔｌｅｒ等对１８个属２１个种的２３ＳｒＲＮＡ 的前５２０个碱基
进行研究后发现５个保守区域，其中区域１０保守，适合作
通用 引 物 设 计。因此从理论上而言，１６ＳｒＲＮＡ 的 区 域 ２ 和
２３ＳｒＲＮＡ 的区域１０是扩增１６Ｓ～２３ＳｒＲＮＡ 区间的理想引物
设计部位。对于 ＰＣＲ扩增后的产物，Ｇｏｎｚａｌｅｚ等总结的主
要方法有依赖序列长度大小的电泳分离技术、特异序列杂交技
术、实时定量 ＰＣＲ技术、ＲＦＬＰ、ＤＮＡ 序列测定技术、焦磷酸测
序技术、单链构象多态性分析技术（ＳＳＣＰ）、质 谱 技 术（ＭＳ）和
高压液相色谱技术（ＨＰＬＣ）
16S/18S/ITS 等全长扩增子测序利用二代高通量测序技术通过提取环境样品的DNA，对微生物的16S rDNA、18S rDNA、ITS以及目标区域扩增子测序，检测环境微生物多样性。全长16S测序：细菌群落结构多样性。全长18S测序：真核微生物群落结构多样性。全长ITS测序：群落结构多样性。生信分析样本中细菌、古细菌以及的种类组成和含量，揭示样本中微生物种类以及彼此间的差异、相对丰度、种群结构和进化关系；在研究微生物与人类医疗健康、食品安全、环境检测与治理、微生物资源的利用等方面有着重要的指导意义。想要测序16s ？您要先了解16s 的特点。
对微生物的鉴定，细菌培养虽然用于对病原菌的检测， 但存在所需时间长、敏感度低等缺点，采用传统的方法对微生物 进行分离与鉴定，需要获得的培养物纯度较高，但是获得的纯 培养的微生物比例很少，大量的微生物无法得到培养和鉴定。 16SrRNA相对应的16SrDNA序列，集保守性与变异性于一身， 存在于细菌染色体基因组中，不存在于、等非原核生物 体内。16SrDNA具有以下特点：①多拷贝：使得该编码基因的 分子生物学检测灵敏度较高；②多信息：由于所有细菌共有保守 区，细菌之间没有差别，所以可以通过保守区设计通用引物，而 可变区具有特异性，可以用来进行细菌鉴定；③长度适中：其编 码基因既能反映不同菌属间的差异，又可以使用测序技术得到其 序列。ITS 的各种测序应用领域还是不一样的。上海细菌16S测序机构
上海融享生物科技有限公司就带您了解一下16s的特点。云南细菌16S测序机构
原 核 生物的ｒＲＮＡ 有３类：５ＳｒＲＮＡ、１６ＳｒＲＮＡ 和２３ＳｒＲＮＡ，其 编
码基因（ｒＤＮＡ）长度依次为１２０、１５４０及３３００个 核 苷 酸。它
们位于同一操纵子序列中，但被一些间隔区域所分开，从５′～
３′端 依 次 是：１６Ｓ、间 隔 区、ｔＲＮＡ、间 隔 区、２３Ｓ、间 隔 区 和 ５Ｓ
ｒＲＮＡ［２］，一个操纵子进行转录后处理成为成熟的１６Ｓ、２３Ｓ和
５ＳｒＲＮＡ。ｒＲＮＡ 结构既具保守性又具高变性，保守性反 映 生
物物种的亲缘关系，高变性则揭示生物物种的特征核酸序列，
是属种鉴定的分子基础。因此，可以利用保守区设计通用引
物扩增细菌的相应靶序列，再利用可变区的差异鉴别菌种。其
中以１６ＳｒＲＮＡ 基因及１６Ｓ～２３ＳｒＲＮＡ 基因间区在细菌鉴定
中的应用较为成熟。 云南细菌16S测序机构
