Ct值能否直接换算成模板拷贝数?通过制作标准曲线(E:90%~110%,R^2≥0.99,斜率-3.58~-3.10)的方法可以获得未知样品的初始模板拷贝数,前提是需要样品与标准品同时扩增,定量标准品需要使用标准物质等定量准确的物质(OD260/280换算的的拷贝数误差很大),即使如此定值结果仍存在一定的误差。荧光定量PCR是否为定量方法?虽然名字里有「定量」,但是qPCR的间接定量方式又复杂,又受很多因素影响,又不准确,在计量领域是不被认可的。目前的核酸检测方法中只有数字PCR是真正的定量检测方法,其余的都是定性检测方法。上海qPCR机构哪家靠谱?湖北SYBRGreen法qPCR公司哪家好
试验结果:(1)比较低检测限:40个循环和45个循环的比较低检测限均为3copies/μL;(2)低浓度模板的阳性检出率:2,1,0.5copies/μL的阳性检出率完全相同,分别为90%,70%,60%;(3)平均值,SD,CV:将两者平均值做配对T检验的P值为0.002,差异极明显,45个循环的平均值普遍比40个循环的平均值高0.35-1.22,而SD和CV均无明显性差异。(4)Ct值40以上的结果:只有一个值为40.53。试验结论:通过增加循环数不能提高试剂本身的比较低检测限和对低浓度样品的检出率。循环数增加是否会增加非特异扩增的概率,本次试验未进行验证。内蒙古qPCR机构电话上海TaqMan荧光探针qPCR公司哪家好?
Ct值能否作为评价qPCR试剂盒的指标?qPCR试剂的评价需要从分析敏感性(比较低检测限),分析特异性的(交叉反应),重复性(精密度),诊断敏感性,诊断特异性等多个指标去衡量(诊断试剂评价系列2-核酸检测方法(更正),诊断试剂评价系列4-比较低检测限,你做对了吗?)。只凭Ct值的高低去判断一个qPCR试剂盒的优劣太片面,不同试剂盒的Ct值不具有可比性。有些试剂盒采取先进行几个循环的预扩增,再进行正式循环的做法就是为了使Ct值看起来更低。
通常来讲,real-timeqPCR的反应程序不需要像常规的PCR那样,要变性、退火、延伸3步。由于其产物长度在80~150bp之间,所以只需要变性和退火就可以了。SYBR@Green等染料法,比较好在PCR扩增程序结束后,加一个溶解程序,来形成溶解曲线,判断PCR产物的特异性扩增。而溶解程序,仪器都有默认设置,或稍有不同,但都是一个在产物进行溶解时候,进行荧光信号的收集。现在给大家汇总一下qPCR常见问题。无Ct值出现检测荧光信号的步骤有误:一般SG法采用72℃延伸时采集,Taqman法则一般在退火结束时或延伸结束采集信号。引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性。模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的比较高浓度做起。模板降解:避免样品制备中杂质的引入及反复冻融的情况。上海qPCR机构哪里有?
因此大量有关qPCR发表的文献中存在结果证据不足甚至是相互矛盾的结果,这对科学研究是一个很大的危险。科学文献的发表和撤回也为人们提出了警示。多数研究报告缺少足够的信息加剧了这个问题,使用qPCR的文献没有提供足够的实验细节,可以让读者评估结果的质量或者重复实验。具体表现为样本的采集和处理信息,RNA质量和完整性,反向转录细节,PCR效率,以及分析参数等等,这些信息常常被忽略,然而样本正规化是反对没有价值的单一参考基因。SYBRGreen法qPCR机构哪家靠谱?山西TaqMan探针法qPCR机构电话
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定量PCR基因表达的实验数据应该如何处理?总的来说,有三个层次的校正是必须要做的。参比信号校正。试剂中必须包含固定浓度的ROX,这样由于反应总体积的差异、所在孔的位置不同、试管壁的厚度差异、管盖透光性能的差异等所引起的荧光信号波动都能够被扣除,使数据真正反映PCR进程。ROX校正能够极大地改进定量的精确度,提高重复管之间的数据重现性。内对照校正。实验中加入样品基本上都是以体积为单位的,但是同样体积的不同样品很可能来自不同数目的细胞,所以将实验结果校正到每个细胞的含量是必要的。方法是在定量目的基因(如IL-2)的同时定量一个内对照基因(如18SRNA基因),然后IL-2/18S。内对照校正使不同样品的实验数据可以相互比较。计算相对于基准样品(Calibrator)的相对基因含量。比如研究处理和未处理的、0小时和6小时的、正常和患病的之间的基因表达的差别,则需要计算处理/未处理、6小时/0小时、患病/正常。湖北SYBRGreen法qPCR公司哪家好