4.MassArray法MassARRAY分子量阵列技术是Sequenom公司推出的世界上靠前的基因分析工具,通过引物延伸或切割反应与灵敏、可靠的MALDI-TOF-MS技术相结合,实现基因分型检测。基于MassARRAY平台的iPLEXGOLD技术可以设计,高达40重的PCR反应和基因型检测,实验设计灵活,分型结果准确性高。根据应用需要,对数十到数百个SNP位点进行数百至数千份样本检测时,MassARRAY具有,佳的性价比,特别适合于对全基因组研究发现的结果进行验证,或者是有限数量的研究位点已经确定的情况。主要特点是准确性高、灵活性强、通量大,主要方法是TaqMan探针法。广东微卫星SSRSNP分型外包服务
在拥有饱和染料和高分辨率仪器之后,HRM分析就可以开始啦。这个过程其实很简单,就是对PCR的扩增子进行加热,温度从50°C逐渐上升到95°C。在此过程中,扩增子逐渐解链,在到达熔解温度(Tm)时,DNA链完全分开。在HRM分析的初期,荧光强度很高,随着温度升高,双链DNA逐渐减少,荧光强度也就下降了。HRM仪器通过照相机,记录下荧光变化的整个过程。通过对数据的作图,就生成了熔解曲线。上海翼和**团队富有开创精神,朝气蓬勃,在肖君华博士的带领下,秉承“专业、协作、进取”的企业精神,为科研用户提供性价比高、可靠的遗传学技术服务和产品。河南微卫星标记strSNP分型准确度高SNP基因分型技术原理是PCR扩增含有SNP的基因组片段。
SNP(单核苷酸多态性)是遗传学研究是不可缺少的一部分,上海翼和应用生物技术有限公司作为一家专门从事遗传学技术服务的公司,SNP基因分型也是日常项目中经常碰到的对象。但是目前成熟的SNP分型方法有很多,各有各的特点和适用性,这让很多刚开始接触SNP分型的人们难以选择,适合自己的分型方法。翼和生物可根据客户提供的样本量,位点数目等情况,提供不同的方案。SNP分型技术大盘点,选择,适合的才是,好的。上海翼和**团队富有开创精神,朝气蓬勃,在肖君华博士的带领下,秉承“专业、协作、进取”的企业精神,为科研用户提供性价比高、高质量可靠的遗传学技术服务和产品。
TaqMan荧光探针是一种寡核苷酸探针,荧光基团连接在探针的5’末端,而淬灭剂则在3’末端。在PCR反应体系中加入2种不同荧光标记的探针,它们可以分别与2个等位基因完全配对。正常情况下,由于探针5’端荧光基团和3’端淬灭基团紧邻在一起,荧光被淬灭。随着PCR有效的进行,与模板完全配对的探针逐步被TaqDNA聚合酶5’——3’外切酶活性切割,致使探针5’端荧光基团和3’端淬灭基团分离,淬灭效应解除,报告荧光基团被,检测到荧光信号,相反,如果模板不能完全配对的探针(另一种等位基因)不能被有效切割,因此检测不到荧光信号,从而实现SNP位点的分型检测。只是偶是做tumour的,所以提Cancer Research提得比较多。
SNP挑选:(1)SNP位于非编码区;(2)SNP平均分布在29条常染色体上;(3),小等位基因频度(MAF)需大于30%,保证位点有足够多态性;SNP鉴定方法~翼和Hi-SNP:59个SNP采用上海翼和应用生物技术有限公司的Hi-SNP技术,由本公司实施多重PCR建库与illuminaX-10测序。上海翼和应用生物**团队富有开创精神,朝气蓬勃,在肖君华博士的带领下,秉承“专业、协作、进取”的企业精神,为科研用户提供性价比高、可靠的遗传学技术服务和产品。美国学者Eric S. Lander于1996年正式提出单核苷酸多态性(SNP)为第三代分子标记.广东STR/SSRSNP分型
突变一般不是一个个体全部细胞的变化。广东微卫星SSRSNP分型外包服务
竞争性等位基因特异性PCR法——KASP(KompetitiveAlleleSpecificPCR),是英国LGC(**化学家实验室)公司所开发的技术,被比较常见用于少位点,多样本的SNP分型中,与TaqMan荧光探针法有一定相似性。KASP基于引物末端碱基的特异匹配来对SNP分型以及检测InDels(Insertions and Deletions,插入和缺失)。上海翼和应用生物技术有限公司,微信公众号:上海翼和生物。 总公司地址位于:上海市松江区龙腾路1015弄中星创意园2号502、508 ,此外,无锡设有分公司广东微卫星SSRSNP分型外包服务
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