旁系同源基因（paralogousgene）又译为“横向同源基因”、“并系同源基因”或“平行进化同源基因”，是指由于基因复制而产生的同源基因，例如人γ一珠蛋白基因和β一珠蛋白基因。基因复制后，进化选择压力变小，其中一条基因丢失或发生沉默，都能促使旁系同源基因分化，产生新特性或新功能的原因。然而，虽然...

上机测序后，每个样本同一个SNP位置可以读到数十或数百条reads（具体取决于测序通量），并且能够清晰看到每条序列的具体信息，通过对SNP位点的聚类分析，实现位点基因型的判断。大规模样本中二等位基因reads比分布结果，每一个点**一个样本一个SNP位点的聚类结果，两端表示纯和，中间表示杂合（理想情...

1. SNP数量多，分布比较常见。据估计，人类基因组中每1000个核苷酸就有一个SNP，人类30亿碱基***有300万以上的SNPs.SNP 遍布于整个人类基因组中，根据SNP在基因中的位置，可分为基因编码区SNPs（Coding-region SNPs，cSNPs）、基因周边SNPs（Perige...

异源同源基因（xenologousgene）是由于基因在不同物种间的横向转移（horizontaltransfer）而产生的。异源同源基因在原核生物中研究比较多。**近研究表明，异源同源基因的原位取代xenolo—gousgenedisplacementinsitu)是细菌进化的强大推动力。另外，在...

旁系同源基因（paralogousgene）又译为“横向同源基因”、“并系同源基因”或“平行进化同源基因”，是指由于基因复制而产生的同源基因，例如人γ一珠蛋白基因和β一珠蛋白基因。基因复制后，进化选择压力变小，其中一条基因丢失或发生沉默，都能促使旁系同源基因分化，产生新特性或新功能的原因。然而，虽然...

上机测序后，每个样本同一个SNP位置可以读到数十或数百条reads（具体取决于测序通量），并且能够清晰看到每条序列的具体信息，通过对SNP位点的聚类分析，实现位点基因型的判断。大规模样本中二等位基因reads比分布结果，每一个点**一个样本一个SNP位点的聚类结果，两端表示纯和，中间表示杂合（理想情...

BLAST是一个机遇序列相似性的数据库搜索程序。是“局部相似性基本查询工具”（BasicLocalAlignmentSearchTool）的缩写。Blast是一个序列相似性搜索的程序包，其中包含了很多**的程序，这些程序是根据查询对象和数据库的不同来定义的。上海翼和应用生物技术有限公司是上海市遗传学...

序列相似性比较：将待研究序列与DNA或蛋白质序列库进行比较，用于确定该序列的生物属性，也就是找出与该序列相似的一致序列是什么。完成这一工作只需要使用两两序列比较算法。常用的程序包邮BLAST；FASTA等。上海翼和应用生物技术有限公司是上海市遗传学会理事单位，上海市****，至今已有十六年历史，...

序列的相似性和序列的同源性有一定的关系，一般来说序列间的相似性越高的话，它们是同源序列的可能性就越高，所以经常可以通过序列的相似性来推测序列是否同源。正因为存在这样的关系，很多时候对序列的相似性和同源性就没有做很明显的区分，造成经常等价混用两个名词。所以有出现A序列和B序列的同源性为80%一说。上海...

旁系同源基因（paralogousgene）又译为“横向同源基因”、“并系同源基因”或“平行进化同源基因”，是指由于基因复制而产生的同源基因，例如人γ一珠蛋白基因和β一珠蛋白基因。基因复制后，进化选择压力变小，其中一条基因丢失或发生沉默，都能促使旁系同源基因分化，产生新特性或新功能的原因。然而，虽然...

多序列比对的意义：用于描述一组序列之间的相似性关系，以便了解一个基因家族的基本特征，寻找motif，保守区域等。用于描述一个同源基因之间的亲缘关系的远景，应用到分子进化分析中。多序列比对的方法：同源性分析中常常要通过多序列比对来找出序列之间的相互关系，和blast的局部匹配搜索不同，多序列比对大多都...

主要是指同源蛋白质的氨基酸序列或者碱基序列相似的程度。主要包括氨基酸序列和碱基序列。把几个相似的或相关的氨基酸或碱基的序列放到NCBI或者clustalw软件中进行对比，比对出其相似的程度。相似度越高，说明序列的同源性越高。上海翼和应用生物技术有限公司是上海市遗传学会理事单位，至今已有十六年历史，专...

片段长度多态性（限制性内切酶）法——RFLP（RestrictionFragmentLengthPolymorphism）法的基本原理是通过PCR扩增目的片段DNA，扩增产物再用特异性内切酶酶切成不同大小的片段，直接通过凝胶电泳分辨基因型。不同等位基因的限制性酶切位点分布不同，产生不同长度的DNA*...

TaqMan荧光探针法优点是操作简单，准确性高（闭管进行，减少污染），判读也很方便，认可度高；适合多样本，少位点。但是其也有不可忽视的限制性，如探针合成耗时较长，价格昂贵，为了保证探针的稳定质量，一般大家会选择A公司合成。TaqMan荧光探针法一般为只有几个位点时适用，并且对样本的质量要求较高，除了...

二代测序法主要通过PCR的方法，对目标SNP位点进行特异性捕获。为了提**型的通量，目前多采用多重PCR的方法同时对多个位点进行捕获（可同时对1-100位点进行分型）。由于二代测序通量是足够满足数百数千样本的同时测序，因此需要对不同的样本添加***的样本标签（Barcode），从而在后续数据分析过程...

1. SNP数量多，分布比较常见。据估计，人类基因组中每1000个核苷酸就有一个SNP，人类30亿碱基***有300万以上的SNPs.SNP 遍布于整个人类基因组中，根据SNP在基因中的位置，可分为基因编码区SNPs（Coding-region SNPs，cSNPs）、基因周边SNPs（Perige...

目前市场上有多个厂家提供HRM分析的仪器，包括Idaho Technology、Corbett（QIAGEN）、Roche等，有些是**HRM的仪器，有些则是附带HRM功能的定量PCR仪。HRM的发明者—美国犹他大学医学院的Wittwer实验室曾评估了市场上多台仪器在基因分型和突变扫描上的性能1。他...

目前市场上有多个厂家提供HRM分析的仪器，包括Idaho Technology、Corbett（QIAGEN）、Roche等，有些是**HRM的仪器，有些则是附带HRM功能的定量PCR仪。HRM的发明者—美国犹他大学医学院的Wittwer实验室曾评估了市场上多台仪器在基因分型和突变扫描上的性能1。他...

单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP），主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中，常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中比较常见存在，平均每500～1000个碱基对中就有1个，估计...

主要是指同源蛋白质的氨基酸序列或者碱基序列相似的程度。主要包括氨基酸序列和碱基序列。把几个相似的或相关的氨基酸或碱基的序列放到NCBI或者clustalw软件中进行对比，比对出其相似的程度。相似度越高，说明序列的同源性越高。上海翼和应用生物技术有限公司是上海市遗传学会理事单位，至今已有十六年历史，专...

单核苷酸多态性（SNP)主要应用比较比较常见，主要场景：（1）科研：研究特定疾病发生的遗传变异，如tumour、罕见变异。（2）临床：用于**易感基因检测、低频**游离DNA检测等。（3）健康：用于**风险评估，家族遗传咨询指导、生活方式指导等相关的大众消费基因检测。（4）农业：用于品系鉴定、全基因...

目前市场上有多个厂家提供HRM分析的仪器，包括Idaho Technology、Corbett（QIAGEN）、Roche等，有些是**HRM的仪器，有些则是附带HRM功能的定量PCR仪。HRM的发明者—美国犹他大学医学院的Wittwer实验室曾评估了市场上多台仪器在基因分型和突变扫描上的性能1。他...

主要是指同源蛋白质的氨基酸序列或者碱基序列相似的程度。主要包括氨基酸序列和碱基序列。把几个相似的或相关的氨基酸或碱基的序列放到NCBI或者clustalw软件中进行对比，比对出其相似的程度。相似度越高，说明序列的同源性越高。上海翼和应用生物技术有限公司是上海市遗传学会理事单位，至今已有十六年历史，专...

常见的SNP既可以出现在基因编码区，也可以出现在非编码区，虽然发生在编码区的概率相对较小，但会影响基因的功能，导致生物性状改变，在遗传性疾病的研究中具有非常重要的意义。SNP作为第三代遗传标记，其分布密度高，遍布于整个动物和人类基因组中；与功能基因具有高度关联性;突变率低，遗传稳定性强；检测通量高便...

基因的直系同源、旁系同源或异源同源关系[1]。祖先物种通过两次物种分化形成ABC三个物种；伴随物种分化而进行的两次基因重复共形成A1、B1、B2、C1、C2、C3等6个基因。显然，C2与C3互为直系同源；B1与C1互为旁系同源；AB1与其他6个基因互为异源同源。然而，B1和B2、B2和C1又是什么关...

序列相似性比较：将待研究序列与DNA或蛋白质序列库进行比较，用于确定该序列的生物属性，也就是找出与该序列相似的一致序列是什么。完成这一工作只需要使用两两序列比较算法。常用的程序包邮BLAST；FASTA等。上海翼和应用生物技术有限公司是上海市遗传学会理事单位，上海市****，至今已有十六年历史，...

多序列比对的意义：用于描述一组序列之间的相似性关系，以便了解一个基因家族的基本特征，寻找motif，保守区域等。用于描述一个同源基因之间的亲缘关系的远景，应用到分子进化分析中。多序列比对的方法：同源性分析中常常要通过多序列比对来找出序列之间的相互关系，和blast的局部匹配搜索不同，多序列比对大多都...

TaqMan荧光探针是一种寡核苷酸探针，荧光基团连接在探针的5’末端，而淬灭剂则在3’末端。在PCR反应体系中加入2种不同荧光标记的探针，它们可以分别与2个等位基因完全配对。正常情况下，由于探针5’端荧光基团和3’端淬灭基团紧邻在一起，荧光被淬灭。随着PCR有效的进行，与模板完全配对的探针逐步被Ta...

TaqMan荧光探针是一种寡核苷酸探针，荧光基团连接在探针的5’末端，而淬灭剂则在3’末端。在PCR反应体系中加入2种不同荧光标记的探针，它们可以分别与2个等位基因完全配对。正常情况下，由于探针5’端荧光基团和3’端淬灭基团紧邻在一起，荧光被淬灭。随着PCR有效的进行，与模板完全配对的探针逐步被Ta...

两条高度相似的序列可能不存在同源性；同样的，同源序列的相似性也可能很低。例如两条同源序列的相似性比对结果不明显，但如果它们在结构上相似性上明显，或者它们都与第三条序列的相似性明显，那么它们显然是同源序列。因此，当相似性搜索发现统计学上显着的匹配时，我们可以放心地推断出这两个序列是同源的。但是，如果在...