在研究亲缘关系较远的物种时，物种分化和基因重复的嵌套发生使研究具有很大的复杂性和困难度。这时，笼统的划分直系同源和旁系同源关系并不足以解决问题，我们需要一个更为精确的分类。为了区别于B1和C1的简单的直向同源关系，把B2和C2/C3的同源称为“共生直向同源”co—ortholog)或“横向同源基因家...

多序列比对的意义：用于描述一组序列之间的相似性关系，以便了解一个基因家族的基本特征，寻找motif，保守区域等。用于描述一个同源基因之间的亲缘关系的远景，应用到分子进化分析中。多序列比对的方法：同源性分析中常常要通过多序列比对来找出序列之间的相互关系，和blast的局部匹配搜索不同，多序列比对大多都...

LDR连接酶检测法优点是适用于任何多态性位点，基于杂交反应和连接反应，分型结果准确，可进行多重反应，性价比较高，且实验灵活。但是相比TaqMan和直接测序法的单一位点检测而言，LDR法可以实现多位点的同时检测，提高检测通量，因此前期需要一定时间构建多重分型方案。因此该方法非常适合相同分型方案，连续样...

Hi-SNP结合多重PCR技术和高通量测序技术，对需要检测的位点设计特异性引物，在单管内进行多重PCR扩增，不同的样本以不同的Barcode引物区分。混合样本后，在Ion Proton/Ion Torrent平台上，对扩增子进行高通量测序。测序结果使用生物信息学方法，区分不同的样本，，终获得每个...

主要是指同源蛋白质的氨基酸序列或者碱基序列相似的程度。主要包括氨基酸序列和碱基序列。把几个相似的或相关的氨基酸或碱基的序列放到NCBI或者clustalw软件中进行对比，比对出其相似的程度。相似度越高，说明序列的同源性越高。上海翼和应用生物技术有限公司是上海市遗传学会理事单位，至今已有十六年历史，专...

多倍体是指含有3套或3套以上完整染色体组的生物体。很多重要的农作物和动物都是多倍体，例如：小麦、油菜、棉花、花生、***、甘蔗、家蚕、蝾螈、果蝇、蛙等。多倍体物种基因组复杂，给遗传学研究带来了很大挑战。在SNP分型、目标区间重测序和分子克隆等过程中，特异性扩增的难度增大，非特异性扩增容易扩增出多个亚...

SNP 全称 Single Nucleotide Polymorphism，即单核苷酸多态性，是指在基因组上单个核苷酸的变异，包括 转换，颠换，插入和缺失，形成的遗传标记，其数量很多，多态性丰富，有些 SNP 位点直接影响基因功 能，从而导致生物性状改变。SNP 是研究人类家族和动植物品系遗传变异的...

主要是指同源蛋白质的氨基酸序列或者碱基序列相似的程度。主要包括氨基酸序列和碱基序列。把几个相似的或相关的氨基酸或碱基的序列放到NCBI或者clustalw软件中进行对比，比对出其相似的程度。相似度越高，说明序列的同源性越高。上海翼和应用生物技术有限公司是上海市遗传学会理事单位，至今已有十六年历史，专...

上海翼和多倍体扩增子测序SNP分型，结合多重PCR技术和高通量测序技术，对需要检测的位点设计特异性引物，在单管内进行多重PCR扩增，不同的样本以不同的Barcode引物区分，对扩增子进行高通量测序。测序结果使用生物信息学方法，区分不同的样本。并且将多倍体的不同基因组进行拆分后，对测序短序列进行精细r...

单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP），主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中，常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中比较常见存在，平均每500～1000个碱基对中就有1个，估计...

网络版本的NCBI在内的很多网站都提供了在线的blast服务，是**经常用到的blast服务。网络版本的NCBI优点：方便，容易操作，数据库同步更新等优点。网络版本的NCBI缺点：不利于操作大批量的数据，同时也不能定义搜索的数据库。单机版本的NCBI 通过NCBI的ftp站点获得。获得程序的同事...

序列的相似性和序列的同源性有一定的关系，一般来说序列间的相似性越高的话，它们是同源序列的可能性就越高，所以经常可以通过序列的相似性来推测序列是否同源。正因为存在这样的关系，很多时候对序列的相似性和同源性就没有做很明显的区分，造成经常等价混用两个名词。所以有出现A序列和B序列的同源性为80%一说。上海...