细胞STR鉴定——给你的细胞一个“明明白白的”身份,正如人类个体有指纹识别一样,每种细胞系也有它独特的“指纹”:STR。STR,全称Short tandem repeat ,中文名“短串联重复序列”,是一类普遍存在于真核生物基因组中的DNA串联重复序列。由于不同个体来源的细胞在不同STR位点具有特异性的重复次数,因而使得不同细胞具有其特征性的图谱,根据图谱的数据可以判定细胞是否为单一细胞。近年来,大量研究表明STR基因分型方法是进行细胞交叉污染和性质鉴定的有效和准确的方法之一,目前,此方法已被ICLAC、ATCC等机构作为金标准应用于细胞鉴定。一株细胞系的遗传特征确立后,细胞系可以通过定期的检测,以防止出现细胞系被误认或交叉污染的情况。北京细胞鉴定周期
上海翼和公司利用荧光PCR扩增小鼠基因组中9个STR基因位点,PCR产物在毛细管电泳分离之后可通过荧光检测进行基因分型。根据所得的STR分型结果与细胞STR数据库(EXPASY)比对,从而鉴定样品所属的小鼠细胞系。2017年4月,翼和客户山东泰山医学院免疫所发表了EBioMedicine上的一篇论文,该文中编辑要求对突变小鼠的遗传背景进行鉴定,翼和公司应用基于多重PCR与二代测序的近交系小鼠检测方案2.0版本方案,成功的对基因编辑小鼠进行了测试,并对小鼠遗传背景进行了STR鉴定,杂志编辑成功接受。苏州鉴定ATCC细胞系STR遗传质量鉴定是上海翼和自2014年起开始推出的专业服务。
翼和为您普及小知识点:作者分别从国内28个研究机构搜集了278株常见人源**细胞系,其中国内建立的细胞系71株,国外建立的细胞系207株。经STR鉴定后发现,来自于22个研究机构的128株细胞存在交叉污染/错误鉴定的情况,错误率高达46%。其中国内建立的细胞系占52株,这表明了什么,国内建立的细胞系交叉污染/错误鉴定率竟然高达73.2%,并且67.3%(35/52)国内交叉污染/错误鉴定的细胞系结果被证实是Hela细胞或被Hela细胞部分污染的!
STR基因位点由长度为3~7个碱基对的短串连重复序列组成,这些重复序列普遍存在于人类基因组中,可作为高度多态性标记,被称为细胞的DNA指纹,其可通过PCR(聚合酶链式反应)来检测。STR基因座位上的等位基因可通过扩增区域内重复序列的拷贝数的不同来区分,在毛细管电泳分离之后可通过荧光检测来识别。随后通过一定的计算方法,即可根据所得的STR分型结果与专业的细胞STR数据库比对从而推算出样品所属的细胞系或可能的交叉污染的细胞系名称。翼和是国内很早一批开展细胞系STR遗传质量鉴定服务的公司。
本文购自ATCC等机构的细胞(如SW480,HCT116, FET细胞系等),均全部由上海翼和应用生物技术有限公司鉴定。其中,HCT116细胞系,虽源于一个男性个体,但其现存细胞系在世界上有两种性别,翼和公司以自己的专业对其成功的进行了鉴定。文章认为,尽管ABHD5在结直肠的发展中起着**抑制作用,但它通过促进RNASET2介导的自噬,以Fu作为代谢的底物,虚弱了结直肠细胞对FU的敏感性。该研究表明ABHD5基因转录表达、对基于FU辅助化疗预后的有重要提示作用。无论是小鼠、大鼠、人我们都能区分。关键价格超便宜,为您第1时间鉴定细胞来源。郑州细胞鉴定周期
如何根据细胞STR鉴定结果判断细胞系是否发生了交叉污染?北京细胞鉴定周期
什么时候需细胞系鉴定?(1)当建立或获得一个新的细胞系时(2)一个涉及到细胞试验项目开始/结束时(3)在细胞冻存之前,或细胞已连续培养2~3个月时(4)发表文章或申请课题经费前(5)细胞系表现不稳定或结果与预期差别较大时(6)当实验室使用超过一种细胞系时,所有细胞系比较好先鉴定以排除交叉污染的可能。如何提供鉴定样本?每种细胞需单独收集在1.5ml离心管中,细胞数目不少于 106个。细胞需要离心沉淀,并且以PBS清洗尽可能去除上清培养基,沉淀沉淀进行冰冻保存与寄送。北京细胞鉴定周期
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