目标区域甲基化重测序（Hi-Methylseq）结合了亚硫酸盐转换、靶向扩增子高通量测序技术，可实现多区段、多位点的甲基化精确定量分析，特别适合队列样本目标区域的甲基化分析，测序深度高，结果更加准确。适用于感兴趣目的片段甲基化研究；适用于在大样本中进一步确认全基因组甲基化研究挑选的阳性位点（DMR）。农口上：表观遗传学研究、品种鉴定、品种改良；医口上：tumour早期诊断、表观遗传学生物标志物开发、tumour复发的 预测因子。DNA复制后胞嘧啶的甲基化会改变DNA的构象，使DNA的大沟无法与DNA结合蛋白正常结合。上海目标甲基化重测序机构
DNA甲基化过程在一些生物学现象中起重要作用。例如，在原核生物中，它参与毒力、细胞周期调控、基因表达和对外源 DNA 导入的保护（DNA-宿主特异性）等过程。在高等真核生物中，DNA 甲基化参与调控染色体稳定性、印记、X 染色体失活和cancer 变等多个细胞过程。在哺乳动物中，DNA 甲基化主要发生在胞嘧啶碱基的第五个碳原子上，形成 5-甲基胞嘧啶或 5-甲基胞嘧啶核苷 (5-mC)。DNA甲基化几乎只存在于CpG二核苷酸上，是一个关键的表观遗传标记和基因表达调控因子。基因启动子或 CpG 岛处的甲基化 CpG 簇与基因失活有关。DNA 甲基化由一个被称为 DNA 甲基转移酶并包括 DNMT1、DNMT3a 和 DNMT3b 的酶家族催化。DNMT3a 和 DNMT3b是从头合成的甲基转移酶，能够甲基化之前未甲基化的 CpG二核苷酸。相反，DNMT1是一种维持性甲基转移酶，在复制过程中修饰半甲基化的 DNA。浙江全基因组甲基化重测序哪里做DNA甲基化几乎只存在于CpG二核苷酸上，是一个关键的表观遗传标记和基因表达调控因子。
DNA甲基化（DNA methylation）为DNA化学修饰的一种形式，能在不改变DNA序列的前提下，改变遗传表观。 DNA甲基化在维持细胞正常功能、传递基因组印记，胚胎发育、tumour发生等方面发挥重要作用，目前已经成为表观遗传学和表观基因组学的研究热点。DNA甲基化测序可在全基因组水平上比较大限度的、完整的获取甲基化状态信息和与基因表达调控的多重关系，可高效精确完成全基因组甲基化测序及*分辨DNA甲基化谱式绘制，并可对发现的靶点区进行甲基化特异性PCR验证。
全基因组重亚硫酸盐测序（whole genome bisulfite sequencing，WGBS）用于全基因组DNA甲基化检测：表观遗传学研究已经证实了特定基因区域的DNA甲基化修饰对于染色体构象、基因表达调控机制有着重要影响，而全基因组DNA甲基化研究是表观基因组学关注的重要内容。Bisulfite处理能够将基因组中未发生甲基化的C碱基转换成U，进行PCR扩增后变成T，与原本具有甲基化修饰的C碱基区分开来，再结合高通量测序技术，可绘制单碱基分辨率的全基因组DNA甲基化图谱。以MethlyC-seq为例，将DNA段化后收集特定长度的片段并修复DNA末端.
DNA甲基化即在DNA上增加甲基基团，是使基因的转录抑制或沉默的主要方式。该修饰特异性地发生在CpG位点，胞嘧啶通过磷酸盐与鸟苷酸连接(图1)。甲基基团的插入改变了DNA的表观和结构，可能会直接阻碍DNA的识别及与转录因子的结合，或者吸引其他因子优先与DNA结合，干扰转录因子的结合。目前已鉴定了三个与甲基化DNA结合的蛋白家族，包括MBD蛋白、Kaiso和Kaiso样蛋白、以及SRA蛋白。通过招募这些蛋白，DNA甲基化可促进某些组蛋白状态的维持，如去乙酰作用，从而保持转录后的组蛋白修饰。例如，MBD家族的甲基CpG结合蛋白2(MeCP2)与甲基CpG结合，招募HDACs，可促使染色体浓缩和转录抑制。重亚硫酸盐测序本质上就是重亚硫酸盐转化与二代测序（NGS）的结合。苏州目标区间甲基化重测序准确度高
亚硫酸氢盐处理能够将基因组中未发生甲基化的C碱基转换成U，进行PCR扩增后变成T。上海目标甲基化重测序机构
目标区域甲基化重测序（Hi-MethylSeq），又叫重亚硫酸盐扩增子测序（Bisulfite Amplicon Sequencing， BSAS）。在前期全基因组甲基化测序、全基因组甲基化芯片等工作基础上，或者依据文献报道目的基因甲基化与性状/疾病关联，选择感兴趣的目的区间或候选基因，利用Hi-MethylSeq技术对大规模群体的候选基因甲基化水平进行检测。Hi-MethylSeq技术通过亚硫酸氢盐（bisulfite）处理，用多重PCR扩增目的片段，添加barcode和测序通用接头，在Illumina X10二代测序平台对PCR产物进行高通量测序，利用生物信息学方法，精确定量计算目标区间内的甲基化位点的甲基化状态，在完成目标区域检测的同时大幅降低研究费用。上海目标甲基化重测序机构
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