亚硫酸氢钠转化是分析胞嘧啶甲基化效果比较好的工具之一。该方法基于亚硫酸氢钠对 DNA 的处理，确定其甲基化模式。重亚硫酸盐测序本质上就是重亚硫酸盐转化与二代测序（NGS）的结合。甲基化的金标准是亚硫酸氢盐测序法：用亚硫酸氢盐处理DNA，未发生甲基化的胞嘧啶能够被转化为尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶则保持不变，通过后续的测序即可检测。利用亚硫酸氢盐的这种原理，可以衍生出多种甲基化检测方法，如甲基化特异性的PCR和高分辨率熔解曲线法。目标区域甲基化重测序（Hi-Methylseq）结合了亚硫酸盐转换、靶向扩增子高通量测序技术。河南甲基化重测序报告
DNA甲基化是表观遗传修饰的主要方式，能在不改变DNA序列的前提下，改变遗传表现。为外遗传编码（epigenetic code）的一部分，是一种外遗传机制。DNA甲基化过程会使甲基添加到DNA分子上，例如在胞嘧啶环的5'碳上：这种5'方向的DNA甲基化方式可见於所有脊椎动物。在人类细胞内，大约有1%的DNA碱基受到了甲基化。在成熟体细胞组织中，DNA甲基化一般发生於CpG双核苷酸（CpG dinucleotide）部位；而非CpG甲基化则於胚胎干细胞中较为常见。植物体内胞嘧啶的甲基化则可分为对称的CpG（或CpNpG），或是不对称的CpNpNp形式（C与G是碱基；p是磷酸根；N指的是任意的核苷酸）。特定胞嘧碇受甲基化的情形，可利用亚硫酸盐定序（bisulfite sequencing）方式测定。DNA甲基化可能使基因沉默化，进而使其失去功能。此外，也有一些生物体内不存在DNA甲基化作用。目标区域甲基化重测序准确度高DNA甲基化属于表观遗传的范畴。
全基因组重亚硫酸盐甲基化测序（WGBS）可以在全基因组范围内精确的检测所有单个胞嘧啶碱基（C碱基）的甲基化水平，是DNA甲基化研究的金标准。WGBS能为基因组DNA甲基化修饰的研究提供重要技术支持，能广泛应用在个体发育、衰老和cancer发生等生命过程的机制研究中。其原理是用 Bisulfite 处理DNA序列，首先将基因组中未发生甲基化的 C 碱基转换成U（T），从而与原本具有甲基化修饰的碱基C区分开来，然后进行PCR扩增，结合高通量测序技术，适用于全基因组范围内绘制单碱基分辨率的DNA 甲基化图谱。
在生物系统内，甲基化是经酶催化的，这种甲基化涉及重金属修饰、基因表达的调控、蛋白质功能的调节以及核糖核酸(RNA)加工。重金属修饰可以在生物系统外发生。组织样本的化学甲基化也是组织染色的方法之一。表观遗传学的甲基化包括DNA甲基化或蛋白质甲基化。1）DNA甲基化。脊椎动物的DNA甲基化一般发生在CpG位点（胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤位点，即DNA序列中胞嘧啶后紧连鸟嘌呤的位点）。经DNA甲基转移酶催化胞嘧啶转化为5-甲基胞嘧啶。人类基因中约80%-90%的CpG位点已被甲基化，但是在某些特定区域，如富含胞嘧啶和鸟嘌呤的CpG岛则未被甲基化。这与包含所有普遍表达基因在内的56%的哺乳动物基因中的启动子有关。1%-2%的人类基因组是CpG群，并且CpG甲基化与转录活性成反比。翼和生物目标区域甲基化项目结合亚硫酸盐转化和多重PCR扩增建库测序技术，对目标区域甲基化位点进行分析。
DNA甲基化是一种重要的表观遗传学标记，在调控基因表达、细胞的分化与发育等过程中发挥着关键作用。使用基于重亚硫酸氢盐测序的方法进行DNA甲基化评估：首先用亚硫酸氢盐处理基因组DNA可将未甲基化胞嘧啶转化为尿嘧啶（黄色字母），而甲基化胞嘧啶保留为胞嘧啶（白色字母）；然后进行两轮PCR：first轮PCR分别放大每个样本的每个区域，并添加8个随机核苷酸（N8）用于重复数据消除和适配体序列；在汇集每个生物样本的扩增子后，第二轮PCR完成带有样本barcode的序列库，用于多样本NGS测序。DNA复制后胞嘧啶的甲基化会改变DNA的构象，使DNA的大沟无法与DNA结合蛋白正常结合。北京多重PCR技术甲基化重测序机构
DNA甲基化是指在甲基转移酶的催化下，DNA的CG二核苷酸中的胞嘧啶被选择性的添加甲基，形成5-甲基胞嘧啶。河南甲基化重测序报告
DNA甲基化是研究 为普遍的表观遗传修饰，它被认为在许多生物学过程和疾病中有着重要的作用。随着测序技术的快速发展，二代测序与重亚硫酸盐处理基因组DNA相结合产生了可以在全基因组单碱基水平上测量DNA甲基化水平的全基因组重亚硫酸盐测序（whole-genome bisulfite sequencing，WGBS）技术。WGBS的流程与全基因组DNA测序主要区别于DNA文库的构建。以MethlyC-seq为例，将DNA 段化后收集特定长度的片段并修复DNA末端，再将双端加上3′-dAMP然后连接上甲基化的接头，接着用重亚硫酸盐处理DNA使未甲基化的胞嘧啶（C）转化为尿嘧啶（U）， 终进行低循环数的PCR扩增后完成建库，建库完后上机测序，得到原始数据（fastq文件）后，完成一定的质量控制后就可以进行mapping分析。河南甲基化重测序报告
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