DNA甲基化可以抑制基因表达。其机制是当DNA甲基化出现在启动子区，其会强化启动子序列的异染色质化（染色体拧巴在一起），而使转录起始复合物无法接近和结合，从而强化基因的转录抑制。只有保持开放性常染色质状态的转录起始位点，才能保证转录起始蛋白复合物可接近并结合这个区域，从而保证基因的转录表达。当DNA甲基化出现在编码基因不同区域的时候（上游，基因区或下游），其对基因表达的影响也是不同的。同时，DNA甲基化不仅只影响基因转录，实际上其与组蛋白修饰、DNA突变、小RNA表达等都有非常复杂的相互调控作用。上海翼和生物甲基化测序采用的是重亚硫酸盐扩增子测序法，重亚硫酸盐转化是研究DNA甲基化的金标方法。江苏目标区间甲基化重测序技术服务
DNA甲基化作为一种重要的表观修饰，在调控基因的时空特异性表达中扮演着关键的角色，参与了X染色体失活、基因组印记和重复序列抑制等诸多生命过程。哺乳动物细胞的DNA甲基化主要发生在CpG二核苷酸对的C（胞嘧啶）上，并在有丝分裂过程中得以相对稳定的维持，这对细胞保持谱系特性有着重要的意义。上海翼和应用生物技术有限公司自主研发的Hi-MethylSeq技术，可对对大规模群体的候选基因甲基化水平进行检测。上海翼和生物是上海市遗传学会理事单位。江苏目标区间甲基化重测序技术服务全基因组甲基化测序:利用Bisulfite(亚硫酸盐)对基因组进行处理后上机测序。
DNA甲基化是指在甲基转移酶的催化下，DNA的CG二核苷酸中的胞嘧啶被选择性的添加甲基，形成5-甲基胞嘧啶，常见于基因的5′—CG—3′序列。DNA甲基化的位置主要集中在基因5′端的非编码区，DNA高度甲基化首先会影响DNA结构，进而阻遏基因转录，引起基因沉默。DNA甲基化为非编码区（如内含子等）的长期沉默提供了一种有效的抑制机制。基因启动区域内CpG位点的甲基化通过三种方式影响基因转录活性：DNA序列甲基化直接阻碍转录因子的结合；甲基CpG结合蛋白结合到甲基化CpG位点与其他转录抑制因子相互作用；染色质结构的凝集阻碍了转录因子与其调控序列的结合。
DNA甲基化是表观遗传调控的常见机制。启动子区域的高度甲基化可导致基因表达改变。甲基化多发生于胞嘧啶（cytosine, C）位置。在细胞和组织分化、疾病发生以及适应环境等过程中，甲基化状态可发生改变。高精确度全基因组甲基化修饰状态的分析，将为发育、育种、tumour标志物鉴定或药物靶标寻找等研究奠定基础。全基因组甲基化测序结合了亚硫酸氢盐转化（bisulfite conversion）方法与新一代高通量测序技术，可在单碱基分辨率水平上高效地检测全基因组DNA甲基化状态。亚硫酸氢盐处理可以使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶保持不变，PCR扩增所需片段，则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。对PCR产物进行高通量测序，与参考序列比对，即可判断CpG/CHG/CHH位点是否发生甲基化。DNA甲基化通常抑制基因表达，去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。
物种的DNA甲基化率通常与物种基因组大小成正比。从细菌的数千个基因进化到高等动物的数万个基因，基因数增长的一个数量级。要管好这么多的基因，在漫长的一生中有规律地关闭或打开基因表达，DNA甲基化这个开关对高等动植物必不可少。转座子是一类在基因组上可以自主复制（或剪切）和移动的**功能元件。如果它们随意移动，对基因组的稳定性具有破坏作用。DNA甲基化对转座子的移动具有抑制作用。通常，物种的基因组越大，其基因组中转座子的比例越高，那么限制转座子移动的门神——DNA甲基化的比例就越高。在前期全基因组甲基化测序等工作基础上，利用Hi-MethylSeq技术对大规模群体的候选基因甲基化水平进行检测。天津目标区域甲基化重测序准确度高
5 位C 甲基化的胞嘧啶脱氨基生成胸腺嘧啶, 由此可能导致基因置换突变, 发生碱基错配: T2G。江苏目标区间甲基化重测序技术服务
DNA甲基化即在DNA上增加甲基基团，是使基因的转录抑制或沉默的主要方式。该修饰特异性地发生在CpG位点，胞嘧啶通过磷酸盐与鸟苷酸连接(图1)。甲基基团的插入改变了DNA的表观和结构，可能会直接阻碍DNA的识别及与转录因子的结合，或者吸引其他因子优先与DNA结合，干扰转录因子的结合。目前已鉴定了三个与甲基化DNA结合的蛋白家族，包括MBD蛋白、Kaiso和Kaiso样蛋白、以及SRA蛋白。通过招募这些蛋白，DNA甲基化可促进某些组蛋白状态的维持，如去乙酰作用，从而保持转录后的组蛋白修饰。例如，MBD家族的甲基CpG结合蛋白2(MeCP2)与甲基CpG结合，招募HDACs，可促使染色体浓缩和转录抑制。江苏目标区间甲基化重测序技术服务
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