DNA甲基化是表观遗传学领域研究的重点之一。DNA甲基化是指在DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase, 缩写DNMT)的作用下,基因组DNA序列上CpG岛的二核苷酸5′端胞嘧啶转变为5′甲基胞嘧啶(5′ methylcytosine, 缩写5mC)。这种DNA修饰的方式并未改变基因的序列, 但能改变某些基因的表达,从而影响生物学功能。DNA 甲基化参与众多的细胞生命活动,包括细胞分化、组织特异性基因表达、基因组印记、X 染色体失活等。异常的 DNA 甲基化会导致发育异常、tumour等疾病的发生。DNA甲基化测序可在全基因组水平上比较大限度的、完整的获取甲基化状态信息和与基因表达调控的多重关系.浙江亚硫酸盐甲基化重测序准确度高
5甲基胞嘧啶 (5-methylcytosine, 5mC) 是一种常见的DNA修饰类型,能调节基因表达、转座子及染色体的状态等。全基因组重亚硫酸盐转化的WGBS法,能够实现单碱基分辨率的甲基化位点准确、高效定位。通过***分析不同处理方式下的全基因组甲基化水平,快速准确鉴定出差异甲基化区域,有助于我们更加***深入地了解动、植物的甲基化模式和表观调控机制,在动物行为、植物胁迫、植物性状、胚胎发育、cancer疾病、生物标记物等方面具有普遍的应用。浙江亚硫酸盐甲基化重测序准确度高翼和生物目标区域甲基化项目结合亚硫酸盐转化和多重PCR扩增建库测序技术,对目标区域甲基化位点进行分析。
DNA甲基化一直以来都是表观遗传学领域研究的重点之一。DNA甲基化(Methylation)是指在DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase, 缩写DNMT)的作用下,基因组DNA序列上CpG岛的二核苷酸5′端胞嘧啶转变为5′甲基胞嘧啶(5′ methylcytosine, 缩写5mC)。这种DNA修饰的方式并未改变基因的序列, 但能抑制某些基因的表达。在哺乳动物中,基因组DNA的甲基化可分为两种类型:维持甲基化(maintenance DNA methylation)和重新甲基化(de novo methylation)。维持甲基化是指在甲基转移酶的作用下,DNA的半保留复制过程中,会在子链的相应的位置进行甲基化修饰的过程。重新甲基化是指在甲基转移酶的作用下,原来没有甲基化的DNA双链上,进行甲基化的过程,之后由维持甲基化酶来维持稳定的DNA甲基化状态。对于这两种甲基化机制来说,有两种对应类型的甲基化酶:维持甲基转移酶和重新甲基转移酶。
DNA去甲基化分为两类:主动去甲基化(Active DNA Demethylation)和被动去甲基化(Passive DNA Demethylation)。基因组甲基化模式的形成主要依赖于主动去甲基化,主要涉及一类具有DNA去甲基化功能的蛋白,可能存在的五种机制a. DNA转葡糖基酶参与的碱基切除修复(base excision repair;BER):5-mC 由DNA 转葡糖基酶直接去除。此途径主要存在于植物体内,动物体内也可能存在。b.脱氨酶参与的碱基切除修复:5-mC 脱氨变成胸腺嘧啶T,形成G/T 错配,进入BER 途径。这一途径主要存在于动物体中,植物体中也可能存在。c.核苷酸外切修复机制(nucleotide excision repair;NER):直接移除甲基化的CpG 二核苷酸。d.氧化去甲基化:发生氧化反应打开碳-碳键,直接去除甲基基团。e.水解去甲基化:水解胞嘧啶的甲基基团,使其以甲醇的形式被释放。DNA被动去甲基化是指当DNMTs活性被抑制或浓度过低时,无法维持原有的甲基化状态,使DNA甲基化程度降低的过程,这类去甲基化通常发生在细胞复制的两个周期之间,涉及到某些可与DNMTs结合的因子,其结合后形成的复合物可以阻止DNMTs与DNA的结合。WGBS的流程与全基因组DNA测序主要区别于DNA文库的构建。
DNA甲基化是表观遗传学修饰的主要形式,甲基化模式的异常促进细胞恶性转化,参与tumour演进。许多基因具有tumour特异性的甲基化表型,一方面基因组普遍的低甲基化引起原cancer基因活化,基因组不稳定性增加;另一方面启动子区的高甲基化,引起抑cancer基因及错配修复基因表达沉默,导致tumour的发生。研究表明,基因组的低甲基化随着细胞恶性度的增加而愈加明显,是病情诊断的重要指标;此外,CpG岛局部的高甲基化发生于细胞恶变之前,能在早期预测tumour的发生,其也能有效地预测tumour的复发和转移,在tumour的鉴别诊断中亦发挥重要作用。因此,检测tumour发生中相关基因的甲基化模式具有重要意义,现就近年来中外文献报道的甲基化检测方法进行简要的分析总结。Hi-Methylseq结合了亚硫酸盐转换、靶向扩增子高通量测序技术,可实现 多区段、多位点的甲基化精确定量分析。苏州CPG岛甲基化重测序哪里好
在前期全基因组甲基化测序等工作基础上,利用Hi-MethylSeq技术对大规模群体的候选基因甲基化水平进行检测。浙江亚硫酸盐甲基化重测序准确度高
DNA甲基化是DNA化学修饰的一种形式,能够在不改变DNA序列的前提下,改变遗传表现。DNA甲基化是指在甲基转移酶的催化下,DNA的CG两个核苷酸中的胞嘧啶被选择性地添加甲基基团的化学修饰现象,极常见的是在胞嘧啶的5号碳位置,在酶和底物的作用下,引入一个甲基基团,变成了5甲基胞嘧啶(5mC),从而改变了它的活性。DNA甲基化是基因组DNA的一种主要表观遗传修饰形式。DNA甲基化修饰对于维持正常细胞功能、传递基因组遗传印记、胚胎发育以及人类tumour发生,起着至关重要的作用。上海翼和生物通过亚硫酸氢盐(bisulfite)处理,用PCR扩增目的片段,并结合二代测序平台(illumina等主流测序平台)并对PCR产物进行测序,本方案目标区域甲基化测序服务Hi-MethylSeq,在完成目标区域检测的同时大幅降低研究费用。浙江亚硫酸盐甲基化重测序准确度高
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