上机测序后，每个样本同一个SNP位置可以读到数十或数百条reads（具体取决于测序通量），并且能够清晰看到每条序列的具体信息，通过对SNP位点的聚类分析，实现位点基因型的判断。大规模样本中二等位基因reads比分布结果，每一个点**一个样本一个SNP位点的聚类结果，两端表示纯和，中间表示杂合（理想情况，1/0表示纯和，0.5表示杂合）。上海翼和应用生物技术有限公司上海翼和**团队富有开创精神，朝气蓬勃，在肖君华博士的带领下，秉承“专业、协作、进取”的企业精神，为科研用户提供性价比高、高质量可靠的遗传学技术服务和产品。微信公众号：上海翼和生物通常所说的SNP都是二等位多态性的。江苏SNP基因分型机构
理论上讲，SNP既可能是二等位多态性，也可能是3个或4个等位多态性，但实际上，后两者非常少见，几乎可以忽略。通常所说的SNP都是二等位多态性的。这种变异可能是转换(C T，在其互补链上则为GA)，也可能是颠换(CA，GT，CG，AT)。转换的发生率总是明显高于其它几种变异，具有转换型变异的SNP约占2/3。上海翼和应用生物技术有限公司是上海市遗传学会理事单位，是上海市****，至今已有十六年历史，专注于为国内科研工作者和生物医药企业提供各类分子遗传学技术服务（高同源区段SNP分型）和质控试剂盒。江苏SNP基因分型机构普通的二代测序SNP分型，利用生信分析手段剔除HSVs、PSVs，难度比较高。
TaqMan荧光探针法优点是操作简单，准确性高（闭管进行，减少污染），判读也很方便，认可度高；适合多样本，少位点。但是其也有不可忽视的限制性，如探针合成耗时较长，价格昂贵，为了保证探针的稳定质量，一般大家会选择A公司合成。TaqMan荧光探针法一般为只有几个位点时适用，并且对样本的质量要求较高，除了样本无降解外，要需要浓度尽可能的一致。上海翼和应用生物技术有限公司，地址：上海市松江区龙腾路1015弄中星创意园2号502
RFLP法的优点是分型技术简单，结果判断容易，不需要昂贵的设备，成本低，并且实验人员培训简单。但是通过SNP能够导致RFLP的概率低，很多SNP位点不能采用这种方法进行检测，而且有的限制性酶价格昂贵并且不容易买到。通常酶切的条件较高，容易出现假阳性结果，且工作量大，耗时长，通量低。这是早期的一种SNP分型技术，在通量和效率上难以满足批量分型需求，因此这种技术目前只在个别实验室中还在使用中。上海翼和应用生物技术有限公司理论上讲，SNP既可能是二等位多态性，也可能是3个或4个等位多态性。
在研究亲缘关系较远的物种时，物种分化和基因重复的嵌套发生使研究具有很大的复杂性和困难度。这时，笼统的划分直系同源和旁系同源关系并不足以解决问题，我们需要一个更为精确的分类。为了区别于B1和C1的简单的直向同源关系，把B2和C2/C3的同源称为“共生直向同源”co—ortholog)或“横向同源基因家族谱系特异性扩充”(1ineage—specificexpansionofparalogousfamily)。为了区分C2和C3、B1和C2/C3这两种同源关系，可以根据物种分化和基因重复的发生的先后次序，把旁系同源基因又分为内旁系同源基因（inparalog）和外旁系同源基因（outparalog）。在物种分化之后产生旁系同源基因的称“内旁系同源基因”；在物种分化之前产生横旁系同源基因的称“外旁系同源基因”。“内旁系同源基因”和“外旁系同源基因”只是一种相对的划分，取决于所研究的系统和选作标准的某特定分化事件。若以第二次物种分化为准线，则C2和C3的分离发生在物种分化之后，因此它们互为内旁系同源基因；B1和C2/C3的分离发生在物种分化之前，因此B1和C2/C3互为外旁系同源基因。高同源区段是二倍体和多倍体都存在的，由于多倍体染色体加倍，所以高同源区段在多倍体中更是普遍现象。SNP分型送样要求
多重长片段PCR技术，结合了长片段PCR和多重PCR的优势，是解决多个高同源区段SNP分型分析的有效手段。江苏SNP基因分型机构
序列相似性比较：将待研究序列与DNA或蛋白质序列库进行比较，用于确定该序列的生物属性，也就是找出与该序列相似的一致序列是什么。完成这一工作只需要使用两两序列比较算法。常用的程序包邮BLAST；FASTA等。上海翼和应用生物技术有限公司是上海市遗传学会理事单位，上海市****，至今已有十六年历史，专注于为国内科研工作者和生物医药企业提供各类分子遗传学技术服务和质控试剂盒。基于自主知识产权的多重PCR技术，翼和生物研发和改良了适用于荧光定量PCR、一代测序和二代高通量测序平台的多种检测技术和产品，逐步形成了在细胞组织和动物模型质控、大健康检测和科学研究3大板块产品布局。江苏SNP基因分型机构
上海翼和应用生物技术有限公司位于龙腾路1015弄中星创意园2号502。翼和生物致力于为客户提供良好的细胞组织小鼠质控，大健康检测，生物技术服务，一切以用户需求为中心，深受广大客户的欢迎。公司从事医药健康多年，有着创新的设计、强大的技术，还有一批**的专业化的队伍，确保为客户提供良好的产品及服务。翼和生物秉承“客户为尊、服务为荣、创意为先、技术为实”的经营理念，全力打造公司的重点竞争力。
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