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分型企业商机

BLAST是一个机遇序列相似性的数据库搜索程序。是“局部相似性基本查询工具”(BasicLocalAlignmentSearchTool)的缩写。Blast是一个序列相似性搜索的程序包,其中包含了很多**的程序,这些程序是根据查询对象和数据库的不同来定义的。上海翼和应用生物技术有限公司是上海市遗传学会理事单位,是上海市****,至今已有十六年历史,专注于为国内科研工作者和生物医药企业提供各类分子遗传学技术服务(高同源区段SNP分型)和质控试剂盒。在进行基因组研究中经常会遇到各类高同源区段,比如人基因组中P450基因家族,HLA基因座位。浙江高同源序列分型哪里做

Hi-SNP 结合多重 PCR 技术和高通量测序技术,对需要检测的位点设计特异性引物,在单管内进行多重 PCR 扩增,不同的样本以不同的 Barcode 引物区分。混合样本后,在 Ion Proton/illumina 主流测序平台上, 对扩增子进行高通量测序。测序结果使用生物信息学方法,区分不同的样本,**终获得每个位点的 SNP 信 息。高通量测序能一次对几百万条 DNA 分子进行序列测定,相比其他的 SNP 检测技术,基于高通量测序的 SNP 分型具有更准确、更灵敏的特点。上海翼和生物。北京同源序列SNP分型机构但是当位点数和样本量都比较大的时候,长片段PCR增加成本,工作量也非常庞大了。

SNP全称Single Nucleotide Polymorphism,即单核苷酸多态性,是指在基因组DNA序列中由于单个核苷酸(A,T,C和G)的突变引起的多态性。一个SNP表示基因组某个位点有一个核苷酸的变化,源于单个碱基的转换,颠换,插入和缺失。上海翼和应用生物技术有限公司是上海市遗传学会理事单位,是上海市****,至今已有十六年历史,专注于为国内科研工作者和生物医药企业提供各类分子遗传学技术服务(高同源区段SNP分型)和质控试剂盒。

TaqMan荧光探针是一种寡核苷酸探针,荧光基团连接在探针的5’末端,而淬灭剂则在3’末端。在PCR反应体系中加入2种不同荧光标记的探针,它们可以分别与2个等位基因完全配对。正常情况下,由于探针5’端荧光基团和3’端淬灭基团紧邻在一起,荧光被淬灭。随着PCR有效的进行,与模板完全配对的探针逐步被TaqDNA聚合酶5’——3’外切酶活性切割,致使探针5’端荧光基团和3’端淬灭基团分离,淬灭效应解除,报告荧光基团被***,检测到荧光信号,相反,如果模板不能完全配对的探针(**另一种等位基因)不能被有效切割,因此检测不到荧光信号,从而实现SNP位点的分型检测。高同源区段是二倍体和多倍体都存在的,由于多倍体染色体加倍,所以高同源区段在多倍体中更是普遍现象。

1. SNP数量多,分布比较常见。据估计,人类基因组中每1000个核苷酸就有一个SNP,人类30亿碱基***有300万以上的SNPs.SNP 遍布于整个人类基因组中,根据SNP在基因中的位置,可分为基因编码区SNPs(Coding-region SNPs,cSNPs)、基因周边SNPs(Perigenic SNPs,pSNPs)以及基因间SNPs(Intergenic SNPs,iSNPs)等三类。2、 SNP适于快速、规模化筛查。组成DNA的碱基虽然有4种,但SNP一般只有两种碱基组成,所以它是一种二态的标记,即二等位基因(biallelic)。 由于SNP的二态性,非此即彼,在基因组筛选中SNPs往往只需+/-的分析,而不用分析片段的长度,这就利于发展自动化技术筛选或检测SNPs.3、SNP等位基因频率的容易估计。采用混和样本估算等位基因的频率是种高效快速的策略。该策略的原理是:首先选择参考样本制作标准曲线,然后将待测的混和样本与标准曲线进行比较,根据所得信号的比例确定混和样本中各种等位基因的频率。4、易于基因分型。SNPs的二态性,也有利于对其进行基因分型。由于SNP的二态性,非此即彼,在基因组筛选中SNPs往往只需+/-的分析这就利于发展自动化技术筛选或检测SNPs.高同源区段SNP分型分析

翼和生物利用自主研发的多重长片段CPR技术,结合巢式PCR技术,解决高同源区段SNP/序列分析难题。浙江高同源序列分型哪里做

二代测序法主要通过PCR的方法,对目标SNP位点进行特异性捕获。为了提**型的通量,目前多采用多重PCR的方法同时对多个位点进行捕获(可同时对1-100位点进行分型)。由于二代测序通量是足够满足数百数千样本的同时测序,因此需要对不同的样本添加***的样本标签(Barcode),从而在后续数据分析过程中,能够进行样本拆分。因此在多重PCR完成***轮多SNP位点捕获后,需要进行第二轮PCR,在***轮PCR产物的基础上,添加样本样本标签及测序接头等序列。通过PCR条件优化,目前亦可实现一次反应,两轮PCR接力完成的效果。浙江高同源序列分型哪里做

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